itk/clitkCropLikeImageFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17   ===========================================================================**/
  18
  19 #ifndef CLITKCROPLIKEIMAGEFILTER_H
  20 #define CLITKCROPLIKEIMAGEFILTER_H
  21
  22 // clitk
  23 #include "clitkBoundingBoxUtils.h"
  24
  25 // itk
  26 #include <itkImageToImageFilter.h>
  27
  28 namespace clitk {
  29
  30   //--------------------------------------------------------------------
  31   /*
  32     Perform various cropping operation on a image
  33   */
  34   //--------------------------------------------------------------------
  35
  36   template <class ImageType>
  37   class ITK_EXPORT CropLikeImageFilter: public itk::ImageToImageFilter<ImageType, ImageType> {
  38   public:
  39     /** Standard class typedefs. */
  40     typedef CropLikeImageFilter                            Self;
  41     typedef itk::ImageToImageFilter<ImageType, ImageType>  Superclass;
  42     typedef itk::SmartPointer<Self>                        Pointer;
  43     typedef itk::SmartPointer<const Self>                  ConstPointer;
  44
  45     /** Method for creation through the object factory. */
  46     itkNewMacro(Self);
  47
  48     /** Run-time type information (and related methods). */
  49     itkTypeMacro(CropLikeImageFilter, ImageToImageFilter);
  50
  51     /** Some convenient typedefs. */
  52     typedef typename ImageType::ConstPointer ImageConstPointer;
  53     typedef typename ImageType::Pointer      ImagePointer;
  54     typedef typename ImageType::PixelType    PixelType;
  55     typedef typename ImageType::RegionType   RegionType;
  56     typedef typename ImageType::PointType    PointType;
  57     typedef typename ImageType::IndexType    IndexType;
  58     typedef typename ImageType::SizeType     SizeType;
  59
  60     /** Image filename for Crop Like */
  61     void SetCropLikeFilename(std::string f);
  62     void SetCropLikeImage(const itk::ImageBase<ImageType::ImageDimension> * like);
  63     void SetCropLikeImage(const itk::ImageBase<ImageType::ImageDimension> * like, int axe);
  64
  65     // Set Background if 'like' is greater than input
  66     itkSetMacro(BackgroundValue, PixelType);
  67     itkGetConstMacro(BackgroundValue, PixelType);
  68
  69     /** ImageDimension constants */
  70     itkStaticConstMacro(ImageDimension, unsigned int, ImageType::ImageDimension);
  71
  72     // I dont want to verify inputs information
  73     virtual void VerifyInputInformation() { }
  74
  75   protected:
  76     CropLikeImageFilter();
  77     virtual ~CropLikeImageFilter() {}
  78
  79     virtual void GenerateOutputInformation();
  80     virtual void GenerateData();
  81     virtual void GenerateInputRequestedRegion();
  82
  83     PixelType m_BackgroundValue;
  84     RegionType m_OutputRegion;
  85     RegionType m_Region;
  86     std::string m_LikeFilename;
  87     bool m_LikeFilenameIsGiven;
  88     PointType m_Origin;
  89     const itk::ImageBase<ImageDimension> * m_LikeImage;
  90     std::vector<bool> m_CropAlongThisDimension;
  91
  92     PointType m_StartPoint;         // start point in physical world
  93     IndexType m_StartSourceIndex;   // start index in "source" image
  94     IndexType m_StartDestIndex;     // start index in "destination" image
  95
  96     PointType m_StopPoint;         // stop point in physical world
  97     IndexType m_StopSourceIndex;   // stop index in "source" image
  98     IndexType m_StopDestIndex;     // stop index in "destination" image
  99
 100   private:
 101     CropLikeImageFilter(const Self&); //purposely not implemented
 102     void operator=(const Self&); //purposely not implemented
 103
 104   }; // end class
 105   //--------------------------------------------------------------------
 106
 107
 108   //--------------------------------------------------------------------
 109   // Convenient function
 110   template<class ImageType>
 111   typename ImageType::Pointer
 112   ResizeImageLike(const ImageType * input,
 113                   const itk::ImageBase<ImageType::ImageDimension> * like,
 114                   typename ImageType::PixelType BG);
 115
 116   template<class ImageType>
 117   typename ImageType::Pointer
 118   ResizeImageLike(const ImageType * input,
 119                   typename itk::ImageBase<ImageType::ImageDimension>::RegionType * like,
 120                   typename ImageType::PixelType BG);
 121
 122   template<class ImageType>
 123   typename ImageType::Pointer
 124   ResizeImageLike(const ImageType * input,
 125                   typename itk::BoundingBox<unsigned long, ImageType::ImageDimension>::Pointer bb,
 126                   typename ImageType::PixelType BG);
 127
 128
 129 } // end namespace clitk
 130 //--------------------------------------------------------------------
 131
 132 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
 133 #include "clitkCropLikeImageFilter.txx"
 134 #endif
 135
 136 #endif // # CROPLIKEIMAGEFILTER