itk/clitkCropLikeImageFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17   ===========================================================================**/
  18
  19 #ifndef CLITKCROPLIKEIMAGEFILTER_H
  20 #define CLITKCROPLIKEIMAGEFILTER_H
  21
  22 #include <itkImageToImageFilter.h>
  23
  24 namespace clitk {
  25
  26   //--------------------------------------------------------------------
  27   /*
  28     Perform various cropping operation on a image
  29   */
  30   //--------------------------------------------------------------------
  31
  32   template <class ImageType>
  33   class ITK_EXPORT CropLikeImageFilter: public itk::ImageToImageFilter<ImageType, ImageType> {
  34   public:
  35     /** Standard class typedefs. */
  36     typedef CropLikeImageFilter                            Self;
  37     typedef itk::ImageToImageFilter<ImageType, ImageType>  Superclass;
  38     typedef itk::SmartPointer<Self>                        Pointer;
  39     typedef itk::SmartPointer<const Self>                  ConstPointer;
  40
  41     /** Method for creation through the object factory. */
  42     itkNewMacro(Self);
  43
  44     /** Run-time type information (and related methods). */
  45     itkTypeMacro(CropLikeImageFilter, ImageToImageFilter);
  46
  47     /** Some convenient typedefs. */
  48     typedef typename ImageType::ConstPointer ImageConstPointer;
  49     typedef typename ImageType::Pointer      ImagePointer;
  50     typedef typename ImageType::PixelType    PixelType;
  51     typedef typename ImageType::RegionType   RegionType;
  52     typedef typename ImageType::PointType    PointType;
  53     typedef typename ImageType::IndexType    IndexType;
  54     typedef typename ImageType::SizeType     SizeType;
  55
  56     /** Image filename for Crop Like */
  57     void SetCropLikeFilename(std::string f);
  58     void SetCropLikeImage(const itk::ImageBase<ImageType::ImageDimension> * like);
  59     void SetCropLikeImage(const itk::ImageBase<ImageType::ImageDimension> * like, int axe);
  60
  61     // Set Background if 'like' is greater than input
  62     itkSetMacro(BackgroundValue, PixelType);
  63     itkGetConstMacro(BackgroundValue, PixelType);
  64
  65     /** ImageDimension constants */
  66     itkStaticConstMacro(ImageDimension, unsigned int, ImageType::ImageDimension);
  67
  68     // I dont want to verify inputs information
  69     virtual void VerifyInputInformation() { }
  70
  71   protected:
  72     CropLikeImageFilter();
  73     virtual ~CropLikeImageFilter() {}
  74
  75     virtual void GenerateOutputInformation();
  76     virtual void GenerateData();
  77     virtual void GenerateInputRequestedRegion();
  78
  79     PixelType m_BackgroundValue;
  80     RegionType m_OutputRegion;
  81     RegionType m_Region;
  82     std::string m_LikeFilename;
  83     bool m_LikeFilenameIsGiven;
  84     PointType m_Origin;
  85     const itk::ImageBase<ImageDimension> * m_LikeImage;
  86     std::vector<bool> m_CropAlongThisDimension;
  87
  88     PointType m_StartPoint;         // start point in physical world
  89     IndexType m_StartSourceIndex;   // start index in "source" image
  90     IndexType m_StartDestIndex;     // start index in "destination" image
  91
  92     PointType m_StopPoint;         // stop point in physical world
  93     IndexType m_StopSourceIndex;   // stop index in "source" image
  94     IndexType m_StopDestIndex;     // stop index in "destination" image
  95
  96   private:
  97     CropLikeImageFilter(const Self&); //purposely not implemented
  98     void operator=(const Self&); //purposely not implemented
  99
 100   }; // end class
 101   //--------------------------------------------------------------------
 102
 103 } // end namespace clitk
 104 //--------------------------------------------------------------------
 105
 106 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
 107 #include "clitkCropLikeImageFilter.txx"
 108 #endif
 109
 110 #endif // # CROPLIKEIMAGEFILTER