itk/clitkExtractSliceFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17   ======================================================================-====*/
  18
  19 #ifndef CLITKEXTRACTSLICEFILTER_H
  20 #define CLITKEXTRACTSLICEFILTER_H
  21
  22 // clitk
  23 #include "clitkFilterBase.h"
  24
  25 // itk
  26 #include "itkPasteImageFilter.h"
  27
  28 // itk ENST
  29 #include "RelativePositionPropImageFilter.h"
  30
  31 namespace clitk {
  32
  33   //--------------------------------------------------------------------
  34   /*
  35     Let A be an initial label image.
  36     Let B be a label image with an object.
  37     Let o be an orientation relatively to the B object (for example RightTo, AntTo, InferiorTo ...)
  38
  39     This filter removes (=set background) from A all points that are
  40     not in the wanted o orientation. It uses downsampled version for
  41     faster processing, and (try to) take into account discretization
  42     problem. Uses [Bloch 1999].
  43   */
  44   //--------------------------------------------------------------------
  45
  46   template <class ImageType>
  47   class ITK_EXPORT ExtractSliceFilter:
  48     public clitk::FilterBase,
  49     public itk::ImageToImageFilter<ImageType,
  50                                    std::vector<typename itk::Image<typename ImageType::PixelType,
  51                                                                    ImageType::ImageDimension-1>::Pointer> >
  52   {
  53
  54   public:
  55     /** Standard class typedefs. */
  56     typedef itk::ImageToImageFilter<ImageType, ImageType> Superclass;
  57     typedef ExtractSliceFilter                              Self;
  58     typedef itk::SmartPointer<Self>                         Pointer;
  59     typedef itk::SmartPointer<const Self>                   ConstPointer;
  60
  61     /** Method for creation through the object factory. */
  62     itkNewMacro(Self);
  63
  64     /** Run-time type information (and related methods). */
  65     itkTypeMacro(ExtractSliceFilter, ImageToImageFilter);
  66     FILTERBASE_INIT;
  67
  68     /** Some convenient typedefs. */
  69     typedef typename ImageType::ConstPointer ImageConstPointer;
  70     typedef typename ImageType::Pointer      ImagePointer;
  71     typedef typename ImageType::RegionType   RegionType;
  72     typedef typename ImageType::PixelType    PixelType;
  73     typedef typename ImageType::SpacingType  SpacingType;
  74     typedef typename ImageType::SizeType     SizeType;
  75
  76     /** ImageDimension constants */
  77     itkStaticConstMacro(ImageDimension, unsigned int, ImageType::ImageDimension);
  78
  79     /** Slice image type **/
  80     typedef itk::Image<PixelType, ImageDimension-1> SliceType;
  81     typedef typename SliceType::Pointer             SliceTypePointer;
  82
  83     /** Input : initial image and object */
  84     void SetInput(const ImageType * image);
  85
  86     // Options
  87     itkGetConstMacro(Direction, int);
  88     itkSetMacro(Direction, int);
  89
  90   protected:
  91     ExtractSliceFilter();
  92     virtual ~ExtractSliceFilter() {}
  93
  94     int m_Direction;
  95
  96     virtual void GenerateOutputInformation();
  97     virtual void GenerateInputRequestedRegion();
  98     virtual void GenerateData();
  99
 100     ImagePointer input;
 101     ImagePointer object;
 102     std::vector<SliceTypePointer> output;
 103
 104   private:
 105     ExtractSliceFilter(const Self&); //purposely not implemented
 106     void operator=(const Self&); //purposely not implemented
 107
 108   }; // end class
 109   //--------------------------------------------------------------------
 110
 111 } // end namespace clitk
 112 //--------------------------------------------------------------------
 113
 114 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
 115 #include "clitkExtractSliceFilter.txx"
 116 #endif
 117
 118 #endif