itk/clitkReconstructThroughDilationImageFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
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   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================*/
  18 #ifndef clitkReconstructThroughDilationImageFilter_h
  19 #define clitkReconstructThroughDilationImageFilter_h
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  21 /* =================================================
  22  * @file   clitkReconstructThroughDilationImageFilter.h
  23  * @author
  24  * @date
  25  *
  26  * @brief
  27  *
  28  ===================================================*/
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  30
  31 // clitk include
  32 #include "clitkIO.h"
  33 #include "clitkCommon.h"
  34 #include "clitkConditionalBinaryDilateImageFilter.h"
  35
  36 //itk include
  37 #include "itkImageToImageFilter.h"
  38 #include "itkBinaryBallStructuringElement.h"
  39 #include "itkConnectedComponentImageFilter.h"
  40 #include "itkStatisticsImageFilter.h"
  41 #include "itkCastImageFilter.h"
  42 #include "itkDifferenceImageFilter.h"
  43 #include "itkThresholdImageFilter.h"
  44
  45 namespace clitk
  46 {
  47
  48   template <class InputImageType, class OutputImageType>
  49   class ITK_EXPORT ReconstructThroughDilationImageFilter :
  50     public itk::ImageToImageFilter<InputImageType, OutputImageType>
  51   {
  52   public:
  53     //----------------------------------------
  54     // ITK
  55     //----------------------------------------
  56     typedef ReconstructThroughDilationImageFilter                                                 Self;
  57     typedef itk::ImageToImageFilter<InputImageType, OutputImageType>  Superclass;
  58     typedef itk::SmartPointer<Self>                                   Pointer;
  59     typedef itk::SmartPointer<const Self>                             ConstPointer;
  60
  61     // Method for creation through the object factory
  62     itkNewMacro(Self);
  63
  64     // Run-time type information (and related methods)
  65     itkTypeMacro( ReconstructThroughDilationImageFilter, ImageToImageFilter );
  66
  67     /** Dimension of the domain space. */
  68     itkStaticConstMacro(InputImageDimension, unsigned int, Superclass::InputImageDimension);
  69     itkStaticConstMacro(OutputImageDimension, unsigned int, Superclass::OutputImageDimension);
  70
  71     //----------------------------------------
  72     // Typedefs
  73     //----------------------------------------
  74     typedef typename OutputImageType::RegionType OutputImageRegionType;
  75     typedef int InternalPixelType;
  76     typedef typename InputImageType::PixelType InputPixelType;
  77     typedef typename OutputImageType::PixelType OutputPixelType;
  78     typedef typename InputImageType::SizeType SizeType;
  79
  80     //----------------------------------------
  81     // Set & Get
  82     //----------------------------------------
  83     itkBooleanMacro(Verbose);
  84     itkSetMacro( Verbose, bool);
  85     itkGetConstReferenceMacro( Verbose, bool);
  86     void SetRadius ( const SizeType& s){ m_Radius=s; this->Modified();}
  87     SizeType GetRadius(void){return m_Radius;}
  88     itkSetMacro( ErosionPaddingValue, OutputPixelType);
  89     itkGetConstMacro( ErosionPaddingValue, OutputPixelType)
  90     itkSetMacro( MaximumNumberOfLabels, unsigned int);
  91     itkGetConstMacro( MaximumNumberOfLabels, unsigned int);
  92     itkSetMacro( BackgroundValue, InternalPixelType);
  93     itkGetConstMacro( BackgroundValue, InternalPixelType);
  94     itkSetMacro( ForegroundValue, InternalPixelType);
  95     itkGetConstMacro( ForegroundValue, InternalPixelType);
  96
  97   protected:
  98
  99     //----------------------------------------
 100     // Constructor & Destructor
 101     //----------------------------------------
 102     ReconstructThroughDilationImageFilter();
 103     ~ReconstructThroughDilationImageFilter() {};
 104
 105     //----------------------------------------
 106     // Update
 107     //----------------------------------------
 108     // Generate Data
 109     void GenerateData(void);
 110
 111     //     // Threaded Generate Data
 112     //     void BeforeThreadedGenerateData(void );
 113     //     void ThreadedGenerateData(const OutputImageRegionType & outputRegionForThread, int threadId );
 114     //     void AfterThreadedGenerateData(void );
 115     //     // Override defaults
 116     //     virtual void GenerateInputRequestedRegion();
 117     //     virtual void GenerateOutputInformation (void);
 118     //     virtual void EnlargeOutputRequestedRegion(DataObject *data);
 119     //     void AllocateOutputs();
 120     //----------------------------------------
 121     // Data members
 122     //----------------------------------------
 123     bool m_Verbose;
 124     InternalPixelType m_BackgroundValue;
 125     InternalPixelType m_ForegroundValue;
 126     unsigned int m_MaximumNumberOfLabels;
 127     OutputPixelType m_ErosionPaddingValue;
 128     SizeType m_Radius;
 129
 130   };
 131
 132
 133 } // end namespace clitk
 134
 135 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
 136 #include "clitkReconstructThroughDilationImageFilter.txx"
 137 #endif
 138
 139 #endif // #define clitkReconstructThroughDilationImageFilter_h
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