itk/clitkRelativePositionDataBase.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17   ===========================================================================**/
  18
  19 #ifndef CLITKRELATIVEPOSITIONDATABASE_H
  20 #define CLITKRELATIVEPOSITIONDATABASE_H
  21
  22 // clitk
  23 #include "clitkCommon.h"
  24
  25 namespace clitk {
  26
  27   //--------------------------------------------------------------------
  28   /*
  29     FIXME
  30    */
  31   //--------------------------------------------------------------------
  32
  33
  34   //--------------------------------------------------------------------
  35    class RelativePositionDirectionType {
  36   public:
  37     double angle1;
  38     double angle2;
  39     bool notFlag;
  40
  41     void Print(std::ostream & os = std::cout) const {
  42       os << clitk::rad2deg(angle1) << " " << clitk::rad2deg(angle2) << " ";
  43       if (notFlag) os << "true";
  44       else os << "false";
  45       os << " ";
  46     }
  47
  48     void PrintOptions(std::ostream & os = std::cout) const {
  49       os << "angle1 = " << clitk::rad2deg(angle1) << std::endl
  50          << "angle2 = " << clitk::rad2deg(angle2) << std::endl;
  51       if (notFlag) os << "inverse" << std::endl;
  52     }
  53
  54     void Println(std::ostream & os = std::cout) const {
  55       Print(os);
  56       os << std::endl;
  57     }
  58
  59     bool operator< (const RelativePositionDirectionType &compare) const
  60     {
  61       if (angle1 < compare.angle1) return true;
  62       if (angle1 > compare.angle1) return false;
  63
  64       if (angle2 < compare.angle2) return true;
  65       if (angle2 > compare.angle2) return false;
  66
  67       if (notFlag == true) {
  68         if (compare.notFlag == false) return true;
  69         else return false;
  70       }
  71       return false;
  72     }
  73   };
  74   //--------------------------------------------------------------------
  75
  76
  77   //--------------------------------------------------------------------
  78   class RelativePositionDataBaseIndexType {
  79   public:
  80     std::string patient;
  81     std::string station;
  82     std::string object;
  83     RelativePositionDirectionType direction;
  84     void Print(std::ostream & os = std::cout) const {
  85       os << patient << " " << station << " " << object << " ";
  86       direction.Print(os);
  87     }
  88     void Println(std::ostream & os = std::cout) const {
  89       Print(os);
  90       os << std::endl;
  91     }
  92   };
  93   //--------------------------------------------------------------------
  94
  95
  96   //--------------------------------------------------------------------
  97   class RelativePositionInformationType {
  98   public:
  99     double threshold;
 100     int sizeBeforeThreshold;
 101     int sizeAfterThreshold;
 102     int sizeReference;
 103     void Print(std::ostream & os = std::cout) const {
 104       os << threshold << " " << sizeBeforeThreshold << " "
 105          << sizeAfterThreshold << " " << sizeReference;
 106     }
 107     void Println(std::ostream & os = std::cout) const {
 108       Print(os);
 109       os << std::endl;
 110     }
 111   };
 112   std::ostream operator<<(std::ostream & os, const clitk::RelativePositionInformationType & rp) {
 113     rp.Print(os);
 114   }
 115   //--------------------------------------------------------------------
 116
 117
 118   //--------------------------------------------------------------------
 119   class RelativePositionDataBase {
 120
 121   public:
 122     RelativePositionDataBase() {}
 123     ~RelativePositionDataBase() {}
 124
 125     typedef RelativePositionDataBaseIndexType IndexType;
 126
 127     void Read(const std::string & filename);
 128     double GetAreaGain(const IndexType & index) const;
 129     double GetThreshold(const IndexType & index) const;
 130     int GetNumberOfPatient(const IndexType & index) const;
 131     std::vector<std::string> & GetListOfPatients(const IndexType & index) const;
 132     void GetListOfObjects(const std::string & station, std::vector<std::string> & objects) const;
 133     void GetListOfDirections(const std::string & station,
 134                                const std::string & object,
 135                                std::vector<RelativePositionDirectionType> & directions) const;
 136     bool CheckIndex(const IndexType & index) const;
 137
 138   protected:
 139     typedef std::map<std::string, RelativePositionInformationType> MapByPatientType;
 140     typedef std::map<RelativePositionDirectionType, MapByPatientType> MapByDirectionType;
 141     typedef std::map<std::string, MapByDirectionType> MapByObjectType;
 142     typedef std::map<std::string, MapByObjectType> MapByStationType;
 143     MapByStationType m_DB;
 144
 145     void ReadIndex(std::istream & is, IndexType & index);
 146     void ReadInformation(std::istream & is, RelativePositionInformationType & v);
 147
 148     const MapByDirectionType & GetMapByDirection(const IndexType & index) const;
 149     const MapByPatientType & GetMapByPatient(const IndexType & index) const;
 150     const RelativePositionInformationType & GetInformation(const IndexType & index) const;
 151     const MapByObjectType & GetMapByObject(const std::string & station) const;
 152
 153   }; // end class
 154   //--------------------------------------------------------------------
 155
 156 } // end namespace clitk
 157 //--------------------------------------------------------------------
 158
 159 #endif