itk/clitkResampleImageWithOptionsFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17   ======================================================================-====*/
  18
  19 #ifndef CLITKRESAMPLEIMAGEWITHOPTIONSFILTER_H
  20 #define CLITKRESAMPLEIMAGEWITHOPTIONSFILTER_H
  21
  22 #include "itkImageToImageFilter.h"
  23 #include "itkAffineTransform.h"
  24
  25 namespace clitk {
  26
  27   //--------------------------------------------------------------------
  28   /*
  29     Image resampling with several interpolations and Gaussian filtering included.
  30   */
  31   //--------------------------------------------------------------------
  32
  33   template <class TInputImage, class TOutputImage=TInputImage>
  34   class ITK_EXPORT ResampleImageWithOptionsFilter:
  35     public itk::ImageToImageFilter<TInputImage, TOutputImage> {
  36
  37   public:
  38     /** Standard class typedefs. */
  39     typedef ResampleImageWithOptionsFilter                     Self;
  40     typedef itk::ImageToImageFilter<TInputImage, TOutputImage> Superclass;
  41     typedef itk::SmartPointer<Self>                            Pointer;
  42     typedef itk::SmartPointer<const Self>                      ConstPointer;
  43
  44     /** Method for creation through the object factory. */
  45     itkNewMacro(Self);
  46
  47     /** Run-time type information (and related methods). */
  48     itkTypeMacro(ResampleImageWithOptionsFilter, ImageToImageFilter);
  49
  50     /** Some convenient typedefs. */
  51     typedef TInputImage                           InputImageType;
  52     typedef typename InputImageType::ConstPointer InputImageConstPointer;
  53     typedef typename InputImageType::Pointer      InputImagePointer;
  54     typedef typename InputImageType::RegionType   InputImageRegionType;
  55     typedef typename InputImageType::PixelType    InputImagePixelType;
  56     typedef typename InputImageType::SpacingType  InputImageSpacingType;
  57     typedef typename InputImageType::SizeType     InputImageSizeType;
  58
  59     typedef TOutputImage                           OutputImageType;
  60     typedef typename OutputImageType::ConstPointer OutputImageConstPointer;
  61     typedef typename OutputImageType::Pointer      OutputImagePointer;
  62     typedef typename OutputImageType::RegionType   OutputImageRegionType;
  63     typedef typename OutputImageType::PixelType    OutputImagePixelType;
  64     typedef typename OutputImageType::SpacingType  OutputImageSpacingType;
  65     typedef typename OutputImageType::SizeType     OutputImageSizeType;
  66
  67     typedef itk::AffineTransform<double, InputImageType::ImageDimension> TransformType;
  68     typedef typename InputImageType::SpacingType                         GaussianSigmaType;
  69
  70     /** ImageDimension constants */
  71     itkStaticConstMacro(InputImageDimension, unsigned int,
  72                         TInputImage::ImageDimension);
  73     itkStaticConstMacro(OutputImageDimension, unsigned int,
  74                         TOutputImage::ImageDimension);
  75     itkConceptMacro(SameDimensionCheck,
  76                     (itk::Concept::SameDimension<InputImageDimension, OutputImageDimension>));
  77
  78     /** Interpolation types */
  79     typedef enum {
  80       NearestNeighbor = 0,
  81       Linear = 1,
  82       BSpline = 2,
  83       B_LUT = 3
  84     } InterpolationTypeEnumeration;
  85
  86     /** Input : image to resample */
  87     void SetInput(const InputImageType * image);
  88
  89     /** ImageDimension constants */
  90     itkStaticConstMacro(ImageDimension, unsigned int, InputImageType::ImageDimension);
  91
  92     // Options
  93     itkGetMacro(LastDimensionIsTime, bool);
  94     itkSetMacro(LastDimensionIsTime, bool);
  95     itkSetMacro(IsoSpacing, double);
  96     itkGetMacro(IsoSpacing, double);
  97     itkSetMacro(OutputSpacing, OutputImageSpacingType);
  98     itkGetMacro(OutputSpacing, OutputImageSpacingType);
  99     itkSetMacro(OutputSize, OutputImageSizeType);
 100     itkGetMacro(OutputSize, OutputImageSizeType);
 101     itkGetMacro(InterpolationType, InterpolationTypeEnumeration);
 102     itkSetMacro(InterpolationType, InterpolationTypeEnumeration);
 103     itkGetMacro(GaussianFilteringEnabled, bool);
 104     itkSetMacro(GaussianFilteringEnabled, bool);
 105     itkGetMacro(BSplineOrder, int);
 106     itkSetMacro(BSplineOrder, int);
 107     itkGetMacro(BLUTSamplingFactor, int);
 108     itkSetMacro(BLUTSamplingFactor, int);
 109     itkGetMacro(Transform, typename TransformType::Pointer);
 110     itkSetMacro(Transform, typename TransformType::Pointer);
 111     itkGetMacro(GaussianSigma, GaussianSigmaType);
 112     itkSetMacro(GaussianSigma, GaussianSigmaType);
 113     itkGetMacro(DefaultPixelValue, OutputImagePixelType);
 114     itkSetMacro(DefaultPixelValue, OutputImagePixelType);
 115     itkGetMacro(VerboseOptions, bool);
 116     itkSetMacro(VerboseOptions, bool);
 117
 118   protected:
 119     ResampleImageWithOptionsFilter();
 120     virtual ~ResampleImageWithOptionsFilter() {}
 121
 122     bool m_LastDimensionIsTime;
 123     double m_IsoSpacing;
 124     InterpolationTypeEnumeration m_InterpolationType;
 125     bool m_GaussianFilteringEnabled;
 126     int m_BSplineOrder;
 127     int m_BLUTSamplingFactor;
 128     OutputImageSizeType m_OutputSize;
 129     OutputImageSpacingType m_OutputSpacing;
 130     typename TransformType::Pointer m_Transform;
 131     GaussianSigmaType m_GaussianSigma;
 132     OutputImagePixelType m_DefaultPixelValue;
 133     bool m_VerboseOptions;
 134
 135     virtual void GenerateInputRequestedRegion();
 136     virtual void GenerateOutputInformation();
 137     virtual void GenerateData();
 138
 139   private:
 140     ResampleImageWithOptionsFilter(const Self&); //purposely not implemented
 141     void operator=(const Self&); //purposely not implemented
 142
 143   }; // end class
 144   //--------------------------------------------------------------------
 145
 146 } // end namespace clitk
 147 //--------------------------------------------------------------------
 148
 149 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
 150 #include "clitkResampleImageWithOptionsFilter.txx"
 151 #endif
 152
 153 #endif