itk/clitkResampleImageWithOptionsFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17   ===========================================================================**/
  18
  19 #ifndef CLITKRESAMPLEIMAGEWITHOPTIONSFILTER_H
  20 #define CLITKRESAMPLEIMAGEWITHOPTIONSFILTER_H
  21
  22 #include "itkImageToImageFilter.h"
  23 #include "itkAffineTransform.h"
  24
  25 namespace clitk {
  26
  27   //--------------------------------------------------------------------
  28   /*
  29     Image resampling with several interpolations and Gaussian filtering included.
  30   */
  31   //--------------------------------------------------------------------
  32   template <class InputImageType, class OutputImageType=InputImageType>
  33     class ITK_EXPORT ResampleImageWithOptionsFilter:
  34   public itk::ImageToImageFilter<InputImageType, OutputImageType> {
  35
  36   public:
  37   /** Standard class typedefs. */
  38   typedef ResampleImageWithOptionsFilter                     Self;
  39   typedef itk::ImageToImageFilter<InputImageType, OutputImageType> Superclass;
  40   typedef itk::SmartPointer<Self>                            Pointer;
  41   typedef itk::SmartPointer<const Self>                      ConstPointer;
  42
  43   /** Method for creation through the object factory. */
  44   itkNewMacro(Self);
  45
  46   /** Run-time type information (and related methods). */
  47   itkTypeMacro(ResampleImageWithOptionsFilter, ImageToImageFilter);
  48
  49   /** Some convenient typedefs. */
  50   typedef typename InputImageType::ConstPointer InputImageConstPointer;
  51   typedef typename InputImageType::Pointer      InputImagePointer;
  52   typedef typename InputImageType::RegionType   InputImageRegionType;
  53   typedef typename InputImageType::PixelType    InputImagePixelType;
  54   typedef typename InputImageType::SpacingType  InputImageSpacingType;
  55   typedef typename InputImageType::SizeType     InputImageSizeType;
  56
  57   typedef typename OutputImageType::ConstPointer OutputImageConstPointer;
  58   typedef typename OutputImageType::Pointer      OutputImagePointer;
  59   typedef typename OutputImageType::RegionType   OutputImageRegionType;
  60   typedef typename OutputImageType::PixelType    OutputImagePixelType;
  61   typedef typename OutputImageType::SpacingType  OutputImageSpacingType;
  62   typedef typename OutputImageType::SizeType     OutputImageSizeType;
  63
  64   typedef itk::AffineTransform<double, InputImageType::ImageDimension> TransformType;
  65   typedef typename InputImageType::SpacingType                         GaussianSigmaType;
  66
  67   /** Interpolation types */
  68   typedef enum {
  69     NearestNeighbor = 0,
  70     Linear = 1,
  71     BSpline = 2,
  72     B_LUT = 3,
  73     WSINC = 4
  74   } InterpolationTypeEnumeration;
  75
  76   /** ImageDimension constants */
  77   itkStaticConstMacro(InputImageDimension, unsigned int,
  78                       InputImageType::ImageDimension);
  79   itkStaticConstMacro(OutputImageDimension, unsigned int,
  80                       OutputImageType::ImageDimension);
  81   itkConceptMacro(SameDimensionCheck,
  82                   (itk::Concept::SameDimension<InputImageDimension, OutputImageDimension>));
  83
  84   /** Input : image to resample */
  85   void SetInput(const InputImageType * image);
  86
  87   /** ImageDimension constants */
  88   itkStaticConstMacro(ImageDimension, unsigned int, InputImageType::ImageDimension);
  89
  90   // Options
  91   itkGetMacro(LastDimensionIsTime, bool);
  92   itkSetMacro(LastDimensionIsTime, bool);
  93   itkSetMacro(OutputIsoSpacing, double);
  94   itkGetMacro(OutputIsoSpacing, double);
  95   itkSetMacro(OutputSpacing, OutputImageSpacingType);
  96   itkGetMacro(OutputSpacing, OutputImageSpacingType);
  97   itkSetMacro(OutputSize, OutputImageSizeType);
  98   itkGetMacro(OutputSize, OutputImageSizeType);
  99   itkGetMacro(InterpolationType, InterpolationTypeEnumeration);
 100   itkSetMacro(InterpolationType, InterpolationTypeEnumeration);
 101   itkGetMacro(GaussianFilteringEnabled, bool);
 102   itkSetMacro(GaussianFilteringEnabled, bool);
 103   itkGetMacro(BSplineOrder, int);
 104   itkSetMacro(BSplineOrder, int);
 105   itkGetMacro(BLUTSamplingFactor, int);
 106   itkSetMacro(BLUTSamplingFactor, int);
 107   itkGetMacro(Transform, typename TransformType::Pointer);
 108   itkSetMacro(Transform, typename TransformType::Pointer);
 109   itkGetMacro(GaussianSigma, GaussianSigmaType);
 110   itkSetMacro(GaussianSigma, GaussianSigmaType);
 111   itkGetMacro(DefaultPixelValue, OutputImagePixelType);
 112   itkSetMacro(DefaultPixelValue, OutputImagePixelType);
 113   itkGetMacro(VerboseOptions, bool);
 114   itkSetMacro(VerboseOptions, bool);
 115
 116   protected:
 117   ResampleImageWithOptionsFilter();
 118   virtual ~ResampleImageWithOptionsFilter() {}
 119
 120   bool m_LastDimensionIsTime;
 121   double m_OutputIsoSpacing;
 122   InterpolationTypeEnumeration m_InterpolationType;
 123   bool m_GaussianFilteringEnabled;
 124   int m_BSplineOrder;
 125   int m_BLUTSamplingFactor;
 126   OutputImageSizeType m_OutputSize;
 127   OutputImageSpacingType m_OutputSpacing;
 128   typename TransformType::Pointer m_Transform;
 129   GaussianSigmaType m_GaussianSigma;
 130   OutputImagePixelType m_DefaultPixelValue;
 131   bool m_VerboseOptions;
 132   OutputImageRegionType m_OutputRegion;
 133
 134   virtual void GenerateInputRequestedRegion();
 135   virtual void GenerateOutputInformation();
 136   virtual void GenerateData();
 137
 138   private:
 139   ResampleImageWithOptionsFilter(const Self&); //purposely not implemented
 140   void operator=(const Self&); //purposely not implemented
 141
 142   }; // end class
 143   //--------------------------------------------------------------------
 144
 145   // Convenient function
 146   template<class InputImageType>
 147     typename InputImageType::Pointer ResampleImageSpacing(typename InputImageType::Pointer input,
 148                                                           typename InputImageType::SpacingType spacing,
 149                                                           int interpolationType=0);
 150
 151 } // end namespace clitk
 152 //--------------------------------------------------------------------
 153
 154 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
 155 #include "clitkResampleImageWithOptionsFilter.txx"
 156 #endif
 157
 158 #endif