lib/creaVtk/creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData.cpp

   1 /*
   2 # ---------------------------------------------------------------------
   3 #
   4 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   5 #                        pour la Sante)
   6 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   7 # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   8 # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   9 #
  10 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  11 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  12 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  13 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  14 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  15 #  or in the file LICENSE.txt.
  16 #
  17 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  18 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  19 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  20 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  21 #  liability.
  22 #
  23 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  24 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  25 # ------------------------------------------------------------------------
  26 */
  27
  28 #include "creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData.h"
  29
  30 #define _USE_MATH_DEFINES // for C
  31 #include <math.h>
  32
  33 creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData::creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData()
  34 {
  35 }
  36
  37 creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData::~creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData()
  38 {
  39 }
  40
  41 std::vector<vtkImageData*> creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData::unMosaicVectorVtkImageData (std::vector<vtkImageData*> imageInput, std::vector<int> NbImagesInMosaicVector)
  42 {
  43         std::vector<int> nbImagesPerRow;
  44         std::vector<int> nbImagesInMosaic;
  45         double imagesInMosaic;
  46         for(int i = 0; i < NbImagesInMosaicVector.size(); i++)
  47         {
  48                 imagesInMosaic = NbImagesInMosaicVector[i];
  49                 nbImagesPerRow.push_back( ceil(sqrt(imagesInMosaic)) );
  50                 nbImagesInMosaic.push_back(NbImagesInMosaicVector[i]);
  51         } // for i
  52         if(imageInput.size() != NbImagesInMosaicVector.size())
  53         {
  54                 for(int j = NbImagesInMosaicVector.size(); j < imageInput.size(); j++)
  55                 {
  56                         imagesInMosaic = NbImagesInMosaicVector[NbImagesInMosaicVector.size()-1];
  57                         nbImagesPerRow.push_back( ceil(sqrt(imagesInMosaic)) );
  58                         nbImagesInMosaic.push_back( NbImagesInMosaicVector[NbImagesInMosaicVector.size()-1] );
  59                 } // for j
  60         } // for imageInput size
  61         if (nbImagesPerRow.size() == 0 || nbImagesInMosaic.size() == 0)
  62     {
  63                 std::cout << "VtkUnMosaicVectorVtkImageData ERROR: The number of Images by mosaic is not set " << std::endl;
  64         } // if nbImagesPerRow size
  65         std::vector<vtkImageData*> imageIn = imageInput;
  66         std::vector<vtkImageData*> mImageOut;
  67         for (int i = 0 ; i < (unsigned int)imageIn.size() ; i++)
  68         {
  69                 mImageOut.push_back( unMosaic(imageIn[i], nbImagesPerRow[i], nbImagesInMosaic[i]) );
  70         } // for i
  71         return mImageOut;
  72 }
  73
  74 //------------------------------------------------------------------------------
  75 vtkImageData * creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData::unMosaic(vtkImageData *imageIn, int nbImagesPerRow, int numberOfImagesInMosaic)
  76 {
  77         int inputdims[3];
  78         int outputdims[3];
  79         imageIn->GetDimensions (inputdims);
  80         unsigned short *input = (unsigned short *)(imageIn->GetScalarPointer());
  81 //EED 2017-01-01 Migration VTK7
  82 #if VTK_MAJOR_VERSION <= 5
  83         imageIn->Update();
  84 #else
  85         // ..
  86 #endif
  87         unsigned int div = (unsigned int)ceil(sqrt( (double)numberOfImagesInMosaic ) );
  88         outputdims[0] = inputdims[0] / div;
  89         outputdims[1] = inputdims[1] / div;
  90         outputdims[2] = numberOfImagesInMosaic;
  91
  92     vtkImageData *vtkImageOut;
  93     vtkImageOut = vtkImageData::New();
  94     vtkImageOut->SetDimensions( outputdims );
  95     vtkImageOut->SetExtent(0,outputdims[0]-1,0,outputdims[1]-1,0,outputdims[2]-1);
  96
  97 //EED 2017-01-01 Migration VTK7
  98 #if VTK_MAJOR_VERSION <= 5
  99     vtkImageOut->SetWholeExtent(0,outputdims[0]-1,0,outputdims[1]-1,0,outputdims[2]-1);
 100     vtkImageOut->SetNumberOfScalarComponents(1);
 101 //vtkImageOut->SetSpacing( blabla );
 102     vtkImageOut->SetScalarType( VTK_UNSIGNED_SHORT );
 103     vtkImageOut->AllocateScalars();
 104     vtkImageOut->Update();
 105 #else
 106     vtkImageOut->AllocateScalars(VTK_UNSIGNED_SHORT,1);
 107 #endif
 108     unsigned short *output =(unsigned short *)(vtkImageOut->GetScalarPointer());
 109     unsigned short *dest = output;
 110     int dimXImageElem = outputdims[0];
 111     int dimYImageElem = outputdims[1];
 112     int lgrImage = dimXImageElem*dimYImageElem;
 113     int debImage;
 114     int i,j;
 115 //    for (i=0; i<numberOfImagesInMosaic; i++)
 116       for (i=numberOfImagesInMosaic-1; i>=0; i--)
 117     {
 118        debImage=(i/nbImagesPerRow) * lgrImage*nbImagesPerRow + (i%nbImagesPerRow)*dimXImageElem;
 119        for(j=0; j<dimYImageElem; j++)
 120 //       for(int j=dimYImageElem-1; j>=0; j--)
 121        {
 122           memcpy(dest, input+debImage, dimXImageElem*sizeof(unsigned short));
 123           debImage += dimXImageElem*nbImagesPerRow;
 124           dest += dimXImageElem;
 125        } // for j
 126     } // for i
 127     return  vtkImageOut;
 128 }
 129