lib/maracasVisuLib/src/CutModule/kernel/CutModelPolygon.h

   1 /*# ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Sant�)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   7 # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   8 #
   9 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  10 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  11 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  12 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  13 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  14 #  or in the file LICENSE.txt.
  15 #
  16 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  17 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  18 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  19 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  20 #  liability.
  21 #
  22 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  23 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  24 # ------------------------------------------------------------------------ */
  25
  26 #ifndef __CutModelPolygonH__
  27 #define __CutModelPolygonH__
  28
  29 #include "vtkImageData.h"
  30 #include "vtkPoints.h"
  31 #include "vtkTransform.h"
  32 #include "manualBaseModel.h"
  33 #include "manualContourModelPolygon.h"
  34 #include "ContourExtractData.h"
  35 #include <vector>
  36
  37 class CutModelPolygon{
  38 public:
  39         //Constructor method
  40         CutModelPolygon();
  41     ~CutModelPolygon();
  42
  43         // Principal method wich process the input imageData
  44         void processOutImage(int cutInsideOutside);
  45
  46         //Initialize the characteristics of the output ImageData with dimensions
  47         //and type of the input one.
  48         void initializeOutputImage();
  49
  50         //Calculate three orthogonal and normalized vectors which are saved in parameters
  51         //v1 and v2. v1 is the resultant vector between point 0 and point 1 of the contour.
  52         //v2 is an orthogonal vector to v1 and the direction vector.
  53         //@param double v1 - Vector 1
  54         //@param double v2 - Vector 2, perpendicular to v1 and direction vector
  55         void calculateOrthogonalVectors(double* v1, double* v2);
  56
  57         //Constructs the matrix transformation with the vectors given.
  58         //@param double v1 - Vector 1
  59         //@param double v2 - Vector 2
  60         //@param double v3 - Vector 3
  61         void updateTransform(double* v1, double* v2, double* v3);
  62
  63         //Transforms all contour points with the transformation created with the correspondent vectors.
  64         //The transformed points are saved in the vectors given by parameter.
  65         //@param std::vector<double> *vectorOutX
  66         //@param std::vector<double> *vectorOutY
  67         //@param std::vector<double> *vectorOutZ
  68         void transformContourPoints(std::vector<double> *vectorOutX,std::vector<double> *vectorOutY,std::vector<double> *vectorOutZ);
  69
  70         //Creates a Polygonal contour and put all the points which are included into it in the "direction vector" direction in value zero,
  71         //and all the rest remains as they are in the original input image. It is the final step of the process.
  72         //This algorithm creates a hole in the whole image.
  73         //@param std::vector<double> *vectorOutX - X-coordinate of all contour points
  74         //@param std::vector<double> *vectorOutY - Y-coordinate of all contour points
  75         //@param std::vector<double> *vectorOutZ - Z-coordinate of all contour points
  76         void cutInputImage(std::vector<double> vectorOutX,std::vector<double> vectorOutY,std::vector<double> vectorOutZ);
  77
  78         //Creates a Polygonal contour with the points given by parameter. This parameter exists in creaMaracasVisu
  79         //@param std::vector<double> *pointsX - X-coordinate of all contour points
  80         //@param std::vector<double> *pointsY - Y-coordinate of all contour points
  81         //@param std::vector<double> *pointsZ - Z-coordinate of all contour points
  82         manualBaseModel* InitializeContourModel(std::vector<double> pointsX, std::vector<double> pointsY,  std::vector<double> pointsZ);
  83
  84         //////////////////////
  85         // Getters and setters
  86         //////////////////////
  87
  88         vtkImageData* getInImage();
  89         vtkImageData* getOutImage();
  90         vtkPoints* getPoints();
  91         double* getDirection();
  92
  93         void setInImage(vtkImageData* pImage);
  94         void setOutImage(vtkImageData* pImage);
  95         void setPoints(vtkPoints *pPoints);
  96         void setDirection(double *pDirection);
  97
  98 private:
  99         //Input image
 100         vtkImageData *_inImage;
 101
 102         //Output image
 103         //vtkImageData *_outImage;
 104
 105         //Contour points
 106         vtkPoints *_points;
 107
 108         //Direction vector
 109         double *_direction;
 110
 111         //Transform
 112         vtkTransform *_transform;
 113
 114         //If cuts inside:0, else 1
 115         int _cutInsideOutside;
 116 };
 117
 118 #endif