lib/maracasVisuLib/src/interface/wxWindows/widgets/pPlotter/pHistogram.cxx

   1 /*# ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Sant�)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   7 # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   8 #
   9 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  10 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  11 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  12 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  13 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  14 #  or in the file LICENSE.txt.
  15 #
  16 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  17 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  18 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  19 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  20 #  liability.
  21 #
  22 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  23 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  24 # ------------------------------------------------------------------------ */
  25
  26
  27 //----------------------------------------------------------------------------
  28 // Class definition include
  29 //----------------------------------------------------------------------------
  30
  31 #include "pHistogram.h"
  32 //#include "vtkJPEGReader.h"
  33 #include "vtkImageData.h"
  34 #include  "vtkImageCast.h"
  35 //-----------------
  36 // C++
  37 //-----------------
  38 #include <iostream>
  39 #include <fstream>
  40 #include <string>
  41 #include <vector>
  42
  43 // ----------------------------------------------------------------------------
  44 // WX headers inclusion.
  45 // For compilers that support precompilation, includes <wx/wx.h>.
  46 // ----------------------------------------------------------------------------
  47
  48 /*
  49 #ifndef WX_PRECOMP
  50 #include <wx/wx.h>
  51 #endif
  52 */
  53 //----------------------------------------------------------------------------
  54 // Class implementation
  55 //----------------------------------------------------------------------------
  56
  57 //IMPLEMENT_CLASS(pHistogram, wxObject)
  58
  59 //----------------------------------------------------------------------------
  60 // Constructors
  61 //----------------------------------------------------------------------------
  62 pHistogram::pHistogram(std::string filePath)
  63 {
  64         path=filePath;
  65         points= vtkImageData::New();
  66         size=100;
  67         sizeImage=0;
  68         buildHistogram();
  69 }
  70
  71 pHistogram::pHistogram(vtkImageData* imageData)
  72 {
  73         points= vtkImageData::New();
  74         size=100;
  75         sizeImage=0;
  76         //cast
  77         /*
  78         vtkImageCast* cast= vtkImageCast::New();
  79         cast->SetInput(imageData);
  80         cast->SetOutputScalarTypeToInt();
  81         cast->Update();
  82         */
  83         //build the histogram
  84         buildHistogram(imageData);
  85 }
  86
  87 pHistogram::~pHistogram()
  88 {
  89         if(points!=NULL)points->Delete();
  90 }
  91 //----------------------------------------------------------------------------
  92 // Methods
  93 //----------------------------------------------------------------------------
  94
  95 void pHistogram::setImagePath(std::string filePath)
  96 {
  97         path=filePath;
  98 }
  99
 100 void pHistogram::buildHistogram()
 101 {
 102         /*
 103                 reader: is the reader of the image
 104                 histogramVector:Is the image data of the original image
 105                 imageData: vtkImageData of the image that we are reading
 106                 range :it has the (min/max) range of the levels of grey
 107         */
 108         points= vtkImageData::New();
 109         vtkMetaImageReader *reader = vtkMetaImageReader::New();
 110         vtkImageData* imageData=NULL;
 111         double range[2];
 112
 113         //reading
 114         reader->SetFileName(path.c_str());
 115         reader->Update();
 116
 117
 118         // getting the data
 119         imageData=reader->GetOutput();
 120         imageData->GetScalarRange(range);
 121         initializePoints(size);
 122         setPoints(imageData);
 123
 124 }
 125
 126 /*
 127 Calculate the histogram and save it in the attribute points
 128 it is used if the user had given the imageData
 129 Pre: Size had to be setted if the user wants
 130 another value that 100
 131 */
 132 void pHistogram::buildHistogram(vtkImageData* imageData)
 133 {
 134         initializePoints(size);
 135         setPoints(imageData);
 136 }
 137
 138 /*
 139   getting ready the points
 140 */
 141 void pHistogram::initializePoints(int xDimension)
 142 {
 143         //setting image data of the points
 144         points->SetDimensions(xDimension,1,1);
 145         points->SetScalarTypeToUnsignedShort();
 146         points->AllocateScalars();
 147         points->Update();
 148 }
 149
 150 /*
 151          constructing the histogram
 152 */
 153 void pHistogram::setPoints(vtkImageData* imageData)
 154 {
 155         /*
 156                 Pointers
 157         */
 158         unsigned short* dataImagePointer=NULL;
 159         unsigned short* dataHistogramPointer=NULL;
 160
 161         dataImagePointer=(unsigned short*)imageData->GetScalarPointer(0,0,0);
 162         dataHistogramPointer=(unsigned short*)points->GetScalarPointer(0,0,0);
 163
 164         /*
 165          Range of greys
 166         */
 167         double range[2];
 168         if(imageData==NULL)
 169                 range[1]=1;
 170         else
 171                 imageData->GetScalarRange(range);
 172         /*
 173          Setting the  minimun and maximum levels of grey
 174         */
 175         maxLevelOfGrey=(int)range[1];
 176         minLevelOfGrey=(int)range[0];
 177         //std::cout<<"maxLevelOfGrey "<<maxLevelOfGrey<<" minLevelOfGrey "<<minLevelOfGrey<<std::endl;
 178         /*
 179          Image Size
 180         */
 181         int ext[6];
 182         imageData->GetExtent(ext);
 183         int sx,sy,sz;
 184         sx=ext[1]+1;
 185         sy=ext[3]+1;
 186         sz=ext[5]+1;
 187
 188         sizeImage=sx*sy*sz;
 189
 190         int i;
 191         /*
 192           getting ready the histogram
 193         */
 194         for(i=0;i<size;i++)
 195         {
 196                 dataHistogramPointer[i]=0;
 197         }
 198
 199         /*
 200         Constructing the Histogram
 201         */
 202         //int k=size/(maxLevelOfGrey-minLevelOfGrey);
 203         int j=0;
 204         for(i=0;i<sizeImage;i++)
 205         {
 206                 /*
 207                  hashing the histogram
 208                 */
 209                 //double p=((float)*dataImagePointer-minLevelOfGrey);
 210                 //j=p*k;
 211
 212                 j=getIndex(*dataImagePointer);
 213                 //std::cout<<j<<std::endl;
 214                 dataHistogramPointer[j]++;
 215                 dataImagePointer++;
 216         }
 217         /*
 218         BORRAME
 219         */
 220         /*
 221         k=0;
 222         for(i=0;i<size;i++)
 223         {
 224                 k=dataHistogramPointer[i];
 225         }
 226         */
 227 }
 228 /*
 229 Returns the poins of the histograms
 230 */
 231 vtkImageData* pHistogram::getHistogram()
 232 {
 233         return points;
 234 }
 235
 236 /*
 237 hash por getting the index for the histogram vector of the original
 238 image
 239 @gValue: Level of grey for which wants the index in the histogrram
 240 */
 241 int pHistogram::getIndex(int gValue)
 242 {
 243
 244         double p=((double)gValue-minLevelOfGrey)/(maxLevelOfGrey-minLevelOfGrey);
 245         double k=p*(size-1);
 246         //std::cout<<"gValue "<<gValue<<" k "<<k<<std::endl;
 247         return (int)k;
 248 }
 249 /*
 250 Setting the size
 251 */
 252 void pHistogram::setSize(int nSize)
 253 {
 254         size=nSize;
 255 }
 256 /*
 257         Get Image Size
 258 */
 259 int pHistogram::getImageSize()
 260 {
 261         return sizeImage;
 262 }
 263 /*
 264         Get Size of the histogram
 265 */
 266 int pHistogram::getSize()
 267 {
 268         return size;
 269 }
 270 /*
 271         Get the maximum value of grey of the histogram
 272 */
 273 int pHistogram::getMaximumLevelOfGrey()
 274 {
 275         return maxLevelOfGrey;
 276 }
 277 /*
 278         Get the minimum value of grey of the histogram
 279 */
 280 int pHistogram::getMinimumLevelOfGrey()
 281 {
 282         return minLevelOfGrey;
 283 }
 284 /*
 285                 get a point of the Histogram
 286                 given the grey value
 287 */
 288 int pHistogram::getHistogramPoint(int gValue)
 289 {
 290         //double p=((float)gValue-minLevelOfGrey)/(maxLevelOfGrey-minLevelOfGrey); // JPRx
 291         //double k=p*size;
 292
 293         unsigned short* dataHistogramPointer=NULL;
 294         dataHistogramPointer=(unsigned short*)points->GetScalarPointer(0,0,0);
 295
 296         return dataHistogramPointer[gValue];
 297 }
 298
 299