lib/maracasVisuLib/src/kernel/include/itkFM3D.h

   1 /*# ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Sant�)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   7 # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   8 #
   9 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  10 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  11 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  12 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  13 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  14 #  or in the file LICENSE.txt.
  15 #
  16 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  17 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  18 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  19 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  20 #  liability.
  21 #
  22 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  23 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  24 # ------------------------------------------------------------------------ */
  25
  26 #include "vtkImageData.h"
  27 /**
  28 * Clase para segmentar una imagen usando fast marching
  29 *
  30 * La imagen de velocidad se obtiene aplicando una transformacion sigmoide a cada voxel.
  31 * Dicha transformacion esta regida por los par�metros alfa (pendiente) y beta(centro de pivotaje)
  32 */
  33
  34 class itkFM3D
  35 {
  36 public:
  37         itkFM3D();
  38         virtual ~itkFM3D();
  39         void AddSeed(int x, int y, int z);
  40         void SetAlpha(double alpha);
  41         void SetBeta(double beta);
  42         void SetStopTime(double stopTime);
  43         void CurvatureAnisotropicFiltertOn();
  44         void CurvatureAnisotropicFilterOff();
  45         vtkImageData* segment(vtkImageData *volume);
  46         double GetEstimatedOtsuTreshold();
  47
  48 protected:
  49
  50          FILE *logger;
  51
  52 private:
  53         double alpha;
  54         double beta;
  55         double stopTime;
  56         int usefilter;
  57         int x;
  58         int y;
  59         int z;
  60         double estimatedOtsuThreshold;
  61 };