lib/maracasVisuLib/src/kernel/include/marAxisCT.h

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   wxMaracas
   4   Module:    $RCSfile: marAxisCT.h,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2009/05/14 13:55:07 $
   7   Version:   $Revision: 1.1 $
   8
   9   Copyright: (c) 2002, 2003
  10   License:
  11
  12      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  13      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14      PURPOSE.  See the above copyright notice for more information.
  15
  16 =========================================================================*/
  17
  18 #ifndef __MAR__KERNEL__AXISCT__HXX__
  19 #define __MAR__KERNEL__AXISCT__HXX__
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  22
  23 #include <marAxis.h>
  24 #include <marAxisContours.h>
  25 #include <marPoint.h>
  26 #include <marIsocontour.h>
  27 #include <vector>
  28 #include <list>
  29
  30 class MAR_KERNEL_EXPORT marAxisCT : public marAxis
  31 {
  32
  33 public:
  34
  35
  36         marAxisCT(  );
  37         marContour*             getContour( int point , kVolume* vol, int index );              // DATA-MODEL-2D
  38         vtkPoints*              get3Dcontour(   int point , kVolume* vol, int index );          // VISUALISATION-VTK 3D
  39         vtkPolyData*    get2Dcontour(   int point , kVolume* vol, int index );          // VISUALISATION-VTK 2D
  40         vtkPoints*              get2DDiameterMin(       int point , kVolume* vol, int index );          // VISUALISATION-VTK 3D
  41         vtkPoints*              get2DDiameterMax(       int point , kVolume* vol, int index );          // VISUALISATION-VTK 3D
  42         int                             getSignal(int point, int index, kVolume* vol);
  43         void                    updateLumenPercentage(int point, kVolume* vol);
  44         void                    updateCalcPercentage(int point, kVolume* vol);
  45
  46         void                    replaceContour2D(int point,int size,double *vx,double *vy, int type);
  47
  48         marContourVO*   searchContour(int type, int point);
  49         int                     getNumberOfContours(int point, kVolume* vol);
  50         int                     getContourType(int point, int index, kVolume* vol  );
  51         void            createEmptyContours();
  52         void            eraseContours();
  53         void            eraseContoursPartial(int start);
  54
  55         void                    histogram(int point, kVolume* vol);
  56         void            setCalibration(bool calib);
  57         bool            getCalibration();
  58
  59         int                     getStartIndex();
  60         void            setStartIndex(int start);
  61
  62         int                     getPointSize();
  63         marPoint*       getPoint(int i);
  64         void            markUpLumen(int point, kVolume* vol);
  65         void            generateFile(int point,kVolume* vol);
  66
  67         void            cleanContours(int type, int point);
  68         double          performXOR(int type, int point, std::vector<marIsocontour *> manual, kVolume* vol);
  69         double          performAND(int type, int point, std::vector<marIsocontour *> manual, kVolume* vol);
  70         double          performUnion(int type, int point, std::vector<marIsocontour *> manual, kVolume* vol);
  71         marIsocontour*  loadMarIsocontour(int size, double *vx, double *vy);
  72
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  74 private:
  75
  76         void                    createContours(         int point       , kVolume* vol );
  77         void                    create3Dcontours(       int point       , kVolume* vol );
  78         void                    create2Dcontours(       int point       , kVolume* vol );
  79         void                    create2DDiametersMin(int point  , kVolume* vol );
  80         void                    create2DDiametersMax(int point  , kVolume* vol );
  81         void                    createSignals (int point, kVolume* vol);
  82         void                    generatePoints(int point, kVolume* vol, std::vector<marIsocontour*> *list);
  83         int                             getMaximumGrad(std::vector <marPoint *> list, int iniPos, int limit, double threshold);
  84         int                             getMinimumGrad(std::vector <marPoint *> list, int iniPos, int limit, double threshold);
  85         double                  interpolate(double x, double y, vtkImageData* imagedata);
  86         void                    generateVector(int dir,int *coordBase,double originX,double originY,double *x,double *y);
  87         bool                    detectNeighbor(marIsocontour* contour,int dir, int type);
  88         marIsocontour*  addPointToContour(marIsocontour* cont ,bool inside,int type,marPoint* point);
  89         void                    unifyDividedStructure(std::vector<marIsocontour*> *contList);
  90         double                  getStatistics(marIsocontour* contour, double x, double y, vtkImageData* imagedata);
  91         double                  getCalcStatistics(marIsocontour* contour, double x, double y, vtkImageData* imagedata,int i);
  92         int                             round(double num);
  93         int                             getMaxIntensity(int point);
  94         bool                    pointInPolygon(marIsocontour *c, double x, double y);
  95         marIsocontour*  parsePolyDataToMarIsocontour(marContourVO* contourVO);
  96
  97         marIsocontour*  filterContour(marIsocontour* contExt, marIsocontour* contInt, double radio);
  98
  99         double                  obtainContourArea(marIsocontour*contour);
 100         void                    adjustWall(int point, kVolume* vol);
 101         void                    adjustCalcification(int point, kVolume* vol);
 102         void                    adjustContour(int point, kVolume* vol);
 103         int                             maxValue(std::vector <double> list);
 104         int                             getDiameter(marContourVO* contourVO, double x, double y, int limInfX, int limInfY, int limSupX, int limSupY);
 105
 106         int                             searchData(std::vector<double> vec, double value);
 107
 108         void                    extractLumen(vtkImageData *lumenImage, marIsocontour *lumenContour, int point);
 109         double                  avgValue;
 110         double                  stdValue;
 111         int                             startIndex;
 112         double                  maxSignal;
 113
 114
 115
 116                                 //      Contours per slice
 117
 118         //Eliminados
 119         //      marIsocontour*  shrinkContour(marIsocontour *cont, double thresh, vtkImageData* imageData, double radio);
 120
 121 };
 122
 123 #endif // __MAR__KERNEL__AXISCT__HXX__