lib/maracasVisuLib/src/kernel/include/marExperimentCT.cpp

   1 /*# ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Sant�)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   7 # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   8 #
   9 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
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  13 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  14 #  or in the file LICENSE.txt.
  15 #
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  20 #  liability.
  21 #
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  23 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  24 # ------------------------------------------------------------------------ */
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  26 /*=========================================================================
  27
  28   Program:   wxMaracas
  29   Module:    $RCSfile: marExperimentCT.cpp,v $
  30   Language:  C++
  31   Date:      $Date: 2012/11/15 14:15:31 $
  32   Version:   $Revision: 1.2 $
  33
  34   Copyright: (c) 2002, 2003
  35   License:
  36
  37      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  38      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  39      PURPOSE.  See the above copyright notice for more information.
  40
  41 =========================================================================*/
  42
  43
  44 #include "marExperimentCT.h"
  45
  46
  47 // ----------------------------------------------------------------------------
  48 marExperimentCT::marExperimentCT( marParameters* p ) : marExperiment( p )
  49
  50 {
  51
  52 }
  53
  54 // ----------------------------------------------------------------------------
  55 marContour* marExperimentCT::getContour( int point, int contour ) {
  56         return ((marAxisCT *)getAxis())->getContour(point,getDynData()->getVolume(),contour);
  57 }
  58
  59 // ----------------------------------------------------------------------------
  60 vtkPoints*      marExperimentCT::get3Dcontour( int point, int contour ) {
  61         return ((marAxisCT *)getAxis())->get3Dcontour(point,getDynData()->getVolume(),contour);
  62 }
  63
  64 // ----------------------------------------------------------------------------
  65 vtkPolyData* marExperimentCT::get2Dcontour( int point, int contour ) {
  66         return ((marAxisCT *)getAxis())->get2Dcontour(point,getDynData()->getVolume(),contour);
  67 }
  68
  69 // ----------------------------------------------------------------------------
  70 vtkPoints* marExperimentCT::get2DDiameterMin( int point, int contour ) {
  71         return ((marAxisCT *)getAxis())->get2DDiameterMin(point,getDynData()->getVolume(),contour);
  72 }
  73
  74 // ----------------------------------------------------------------------------
  75 vtkPoints* marExperimentCT::get2DDiameterMax( int point, int contour ) {
  76         return ((marAxisCT *)getAxis())->get2DDiameterMax(point,getDynData()->getVolume(),contour);;
  77 }
  78
  79 // ----------------------------------------------------------------------------
  80 int marExperimentCT::getNumberOfContours(int point) {
  81         return ((marAxisCT *)getAxis())->getNumberOfContours(point,getDynData()->getVolume( )) ;
  82 }
  83
  84 // ----------------------------------------------------------------------------
  85 void marExperimentCT::prepareQuantification( ) {
  86
  87         if(getAxis())
  88         {
  89                 ((marAxisCT *)getAxis())->eraseContours();
  90                 ((marAxisCT *)getAxis())->createEmptyContours();
  91                 marExperiment::prepareQuantification();
  92         }
  93
  94 }
  95
  96 // ----------------------------------------------------------------------------
  97 void marExperimentCT::RegenerateAxis() {
  98
  99         if (getAxis()!=NULL){
 100                 ((marAxisCT *)getAxis())->eraseContours();
 101                 ((marAxisCT *)getAxis())->createEmptyContours();
 102         //      marExperiment::RegenerateAxis();
 103         }
 104
 105
 106 }
 107
 108 // ----------------------------------------------------------------------------
 109 void marExperimentCT::RecalculateAxis() {
 110
 111         if (getAxis()!=NULL){
 112                 ((marAxisCT *)getAxis())->eraseContours();
 113                 ((marAxisCT *)getAxis())->createEmptyContours();
 114                 marExperiment::RecalculateAxis();
 115         }
 116
 117 }
 118
 119 // ----------------------------------------------------------------------------
 120 void marExperimentCT::updateLumenPercentage(int percentage)
 121 {
 122         int point = ((marAxisCT *)getAxis())->getActualQuant();
 123         ((marAxisCT *)getAxis())->getParameters()->setLumenPercentage(percentage);
 124         ((marAxisCT *)getAxis())->updateLumenPercentage(point,getDynData()->getVolume());
 125 }
 126
 127 // ----------------------------------------------------------------------------
 128 void marExperimentCT::updateCalcPercentage(int percentage)
 129 {
 130         int point = ((marAxisCT *)getAxis())->getActualQuant();
 131         ((marAxisCT *)getAxis())->getParameters()->setCalcPercentage(percentage);
 132         ((marAxisCT *)getAxis())->updateCalcPercentage(point,getDynData()->getVolume());
 133 }
 134
 135 // ----------------------------------------------------------------------------
 136 void marExperimentCT::updateDiscontinuityThreshold(int percentage)
 137 {
 138         ((marAxisCT *)getAxis())->getParameters()->setContourThresh(percentage);
 139         ((marAxisCT *)getAxis())->eraseContours();
 140         ((marAxisCT *)getAxis())->createEmptyContours();
 141         ((marAxisCT *)getAxis())->setCalibration(false);
 142
 143 }
 144
 145
 146
 147 // ----------------------------------------------------------------------------
 148 int     marExperimentCT::getContourType(int point, int index) {
 149         return ((marAxisCT *)getAxis())->getContourType(point, index, getDynData()->getVolume());
 150 }
 151
 152 // ----------------------------------------------------------------------------
 153 void marExperimentCT::histogram(int point) {
 154
 155         ((marAxisCT *)getAxis())->histogram(point, getDynData()->getVolume());
 156 }
 157
 158 // ----------------------------------------------------------------------------
 159 void marExperimentCT::setCalibration(bool calib)
 160 {
 161         ((marAxisCT *)getAxis())->setCalibration(calib);
 162 }
 163
 164 // ----------------------------------------------------------------------------
 165 bool marExperimentCT::getCalibration()
 166 {
 167         return ((marAxisCT *)getAxis())->getCalibration();
 168 }
 169
 170 // ----------------------------------------------------------------------------
 171 void marExperimentCT::ClearContoursPartial(int start)
 172 {
 173         ((marAxisCT *)getAxis())->eraseContoursPartial(start);
 174 }
 175
 176 // ----------------------------------------------------------------------------
 177 void marExperimentCT::setStartIndex(int start)
 178 {
 179         ((marAxisCT *)getAxis())->setStartIndex(start);
 180 }
 181
 182 // ----------------------------------------------------------------------------
 183 int     marExperimentCT::getPointSize()
 184 {
 185         return ((marAxisCT *)getAxis())->getPointSize();
 186 }
 187
 188 // ----------------------------------------------------------------------------
 189 marPoint* marExperimentCT::getPoint(int i)
 190 {
 191         return ((marAxisCT *)getAxis())->getPoint(i);
 192 }
 193
 194 // ----------------------------------------------------------------------------
 195 void marExperimentCT::markUpLumen(int point)
 196 {
 197         ((marAxisCT *)getAxis())->markUpLumen(point, getDynData()->getVolume());
 198 }
 199
 200 // ----------------------------------------------------------------------------
 201 void marExperimentCT::generateFile()
 202 {
 203         int point = ((marAxisCT *)getAxis())->getActualQuant();
 204         ((marAxisCT *)getAxis())->generateFile(point, getDynData()->getVolume());
 205 }
 206
 207 // ----------------------------------------------------------------------------
 208 void marExperimentCT::replaceContour2D(int size,double *vx,double *vy, int type)
 209 {
 210         int point = ((marAxisCT *)getAxis())->getActualQuant();
 211         ((marAxisCT *)getAxis())->replaceContour2D(point,size,vx,vy,type);
 212 }
 213
 214 // ----------------------------------------------------------------------------
 215 void marExperimentCT::cleanContours(int type)
 216 {
 217         int point = ((marAxisCT *)getAxis())->getActualQuant();
 218         ((marAxisCT *)getAxis())->cleanContours(type,point);
 219 }
 220
 221 // ----------------------------------------------------------------------------
 222 marIsocontour* marExperimentCT::loadMarIsocontour(int size, double *vx, double *vy)
 223 {
 224         return ((marAxisCT *)getAxis())->loadMarIsocontour(size,vx,vy);
 225 }
 226
 227 // ----------------------------------------------------------------------------
 228 double marExperimentCT::performXOR(int type, std::vector<marIsocontour*> manual)
 229 {
 230         int point = ((marAxisCT *)getAxis())->getActualQuant();
 231
 232         return ((marAxisCT *)getAxis())->performXOR(type,point,manual, getDynData()->getVolume());
 233 }
 234
 235 // ----------------------------------------------------------------------------
 236 double marExperimentCT::performAND(int type, std::vector<marIsocontour*> manual)
 237 {
 238         int point = ((marAxisCT *)getAxis())->getActualQuant();
 239
 240         return ((marAxisCT *)getAxis())->performAND(type,point,manual, getDynData()->getVolume());
 241
 242
 243 }
 244
 245 // ----------------------------------------------------------------------------
 246 double marExperimentCT::performUnion(int type, std::vector<marIsocontour*> manual)
 247 {
 248         int point = ((marAxisCT *)getAxis())->getActualQuant();
 249
 250         return ((marAxisCT *)getAxis())->performUnion(type,point,manual, getDynData()->getVolume());
 251 }