lib/maracasVisuLib/src/kernel/include/marExperimentCT.h

   1 /*# ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Sant�)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   7 # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   8 #
   9 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  10 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  11 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  12 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  13 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  14 #  or in the file LICENSE.txt.
  15 #
  16 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  17 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  18 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  19 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  20 #  liability.
  21 #
  22 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  23 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  24 # ------------------------------------------------------------------------ */
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  26 /*=========================================================================
  27
  28   Program:   wxMaracas
  29   Module:    $RCSfile: marExperimentCT.h,v $
  30   Language:  C++
  31   Date:      $Date: 2012/11/15 14:15:31 $
  32   Version:   $Revision: 1.2 $
  33
  34   Copyright: (c) 2002, 2003
  35   License:
  36
  37      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  38      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  39      PURPOSE.  See the above copyright notice for more information.
  40
  41 =========================================================================*/
  42 #ifndef __MAR__KERNEL__EXPERIMENTCT__HXX__
  43 #define __MAR__KERNEL__EXPERIMENTCT__HXX__
  44
  45 #include <vector>
  46 #include "volume.hxx"
  47 #include "marExperiment.h"
  48 #include "marDynData.h"
  49 #include "GestionBifurcations.h"
  50 #include "marAxisCT.h"
  51 #include "marPoint.h"
  52
  53 class MAR_KERNEL_EXPORT marExperimentCT : public marExperiment
  54 {
  55
  56 public:
  57
  58   marExperimentCT( marParameters* p = NULL );
  59
  60   marContour*           getContour( int point, int contour );
  61   vtkPoints*            get3Dcontour( int point, int contour );
  62   vtkPolyData*          get2Dcontour( int point, int contour );
  63   vtkPoints*            get2DDiameterMin( int point, int contour );
  64   vtkPoints*            get2DDiameterMax( int point, int contour );
  65   int                           getNumberOfContours(int point);
  66   void                          prepareQuantification( );
  67   void                          RegenerateAxis();
  68   void                          RecalculateAxis();
  69   void                          updateLumenPercentage(int percentage);
  70   void                          updateCalcPercentage(int percentage);
  71   void                          updateDiscontinuityThreshold(int percentage);
  72   int                           getContourType(int point, int index);
  73   void                          histogram(int point);
  74   void                          setCalibration(bool calib);
  75   bool                          getCalibration();
  76   void                          ClearContoursPartial(int start);
  77   void                          setStartIndex(int start);
  78   int                           getPointSize();
  79   marPoint*                     getPoint(int i);
  80   void                          markUpLumen(int point);
  81   void                          generateFile();
  82   void                          replaceContour2D(int size,double *vx,double *vy, int type);
  83   void                          cleanContours(int type);
  84   marIsocontour*        loadMarIsocontour(int size, double *vx, double *vy);
  85   double                        performXOR(int type, std::vector<marIsocontour*> manual);
  86   double                        performAND(int type, std::vector<marIsocontour*> manual);
  87   double                        performUnion(int type, std::vector<marIsocontour*> manual);
  88
  89 };
  90
  91 #endif // __MAR__KERNEL__EXPERIMENTCT__HXX__