lib/maracasVisuLib/src/kernel/marGdcmDicom.h

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   wxMaracas
   4   Module:    $RCSfile: marGdcmDicom.h,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2008/10/31 16:32:55 $
   7   Version:   $Revision: 1.1 $
   8
   9   Copyright: (c) 2002, 2003
  10   License:
  11
  12      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  13      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14      PURPOSE.  See the above copyright notice for more information.
  15
  16 =========================================================================*/
  17
  18 #ifndef __MAR__KERNEL__MARGDCMDICOM__HXX__
  19 #define __MAR__KERNEL__MARGDCMDICOM__HXX__
  20
  21 #include <vector>
  22 #include <string>
  23
  24 #include <wx/string.h>
  25 #include <wx/gauge.h>
  26
  27
  28
  29 #include "gdcmDicomDir.h"
  30 #include "gdcmSerieHelper.h"
  31 #include "gdcmDicomDirPatient.h"
  32 #include "gdcmDicomDirStudy.h"
  33 #include "gdcmDicomDirSerie.h"
  34 #include "gdcmDicomDirImage.h"
  35 #include "marDicomBase.h"
  36
  37
  38
  39
  40
  41 typedef std::vector<wxArrayString> SerieInfo;  //DICOM info for each serie
  42 /**
  43  * Shouldn't we break the dependencies to wx ???
  44  *
  45  * We use vector instead of list for efficiency: for access time
  46  * futhermore the number of patient is not changing a lot, so we
  47  * might add the number of patient to params.dat, to allocate the right
  48  * number of vector
  49  *
  50  */
  51
  52 // EED
  53 // class MAR_KERNEL_EXPORT marGdcmDicom : public marObject
  54
  55
  56 class marGdcmDicom : public marFilesBase
  57 {
  58   public:
  59
  60     marGdcmDicom( marParameters* p = NULL );
  61
  62     ~marGdcmDicom( ){
  63             reset( );
  64     }
  65
  66     void loadActualSerie(wxGauge* gauge );
  67     void loadVolume( bool force = false, wxGauge* gauge = NULL);
  68         void PrepareLoadVolumeDispers();
  69         virtual bool loadImage(int i);
  70         bool loadFileDicom(void* p_vol,int *dim,char *namefile);
  71
  72
  73     /**
  74      * General methods
  75      */
  76     void reset( );
  77         void Cleaning_gdcmFileList();
  78
  79     void copyFrom( const marObject& from );
  80     /**
  81      * Persistence methods
  82      */
  83     bool save( std::ofstream& os );
  84     bool load( std::ifstream& is );
  85
  86         void CreateDicomFile( );
  87     void FillDicomInfo(bool parseDir);
  88
  89     wxString GetPatientName();
  90
  91         GDCM_NAME_SPACE::DicomDir* getGdcmDicomDir();
  92
  93         GDCM_NAME_SPACE::DicomDirStudy* getActualStudy();
  94
  95         void setActualPatient(GDCM_NAME_SPACE::DicomDirPatient *patient);
  96         void setActualStudy(GDCM_NAME_SPACE::DicomDirStudy *study);
  97         void setActualSerie(GDCM_NAME_SPACE::DicomDirSerie *serie);
  98
  99         void setIniSlice(int iniSlice);
 100         void setEndSlice(int endSlice);
 101
 102         GDCM_NAME_SPACE::DicomDirSerie *getActualSerie();
 103
 104
 105   private:
 106
 107
 108     std::vector< SerieInfo > m_DicomInfo;
 109         GDCM_NAME_SPACE::DicomDir                       *_dicomDir;
 110         GDCM_NAME_SPACE::DicomDirPatient        *_actualPatient;
 111         GDCM_NAME_SPACE::DicomDirStudy          *_actualStudy;
 112         GDCM_NAME_SPACE::DicomDirSerie          *_actualSerie;
 113         GDCM_NAME_SPACE::DicomDirImage          *_actualImage;
 114
 115         int _iniSlice;
 116         int _endSlice;
 117
 118         virtual void CreateSerieHelper();
 119         void CreateEmptyVoxel();
 120         void ExtactSpacing();
 121         void ExtactInterceptSlope();
 122
 123         bool SerieVerification(  GDCM_NAME_SPACE::FileList *gdcmFileList  );
 124         bool SerieVerificationEqImageSize(  GDCM_NAME_SPACE::FileList *gdcmFileList  );
 125 //      bool SerieVerificationEqImageOrientation(  GDCM_NAME_SPACE::GdcmFileList *gdcmFileList  );
 126
 127
 128
 129   protected:
 130         GDCM_NAME_SPACE::FileList               _gdcmFileList;
 131
 132 };
 133
 134
 135 //-------------------------------------------------------------------
 136
 137 class marGdcmDicomILPD : public marGdcmDicom
 138 {
 139 public:
 140         marGdcmDicomILPD( marParameters* p = NULL );
 141 private:
 142         virtual void CreateSerieHelper();
 143 protected:
 144 };
 145
 146 //-------------------------------------------------------------------
 147
 148 #endif // __MAR__KERNEL__MARGDCMDICOM__HXX__