lib/maracasVisuLib/src/kernel/marParameters.h

   1 /*# ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Sant�)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   7 # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   8 #
   9 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  10 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  11 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  12 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  13 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  14 #  or in the file LICENSE.txt.
  15 #
  16 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  17 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  18 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  19 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  20 #  liability.
  21 #
  22 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  23 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  24 # ------------------------------------------------------------------------ */
  25
  26 /*=========================================================================
  27
  28   Program:   wxMaracas
  29   Module:    $RCSfile: marParameters.h,v $
  30   Language:  C++
  31   Date:      $Date: 2012/11/15 14:16:12 $
  32   Version:   $Revision: 1.5 $
  33
  34   Copyright: (c) 2002, 2003
  35   License:
  36
  37      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  38      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  39      PURPOSE.  See the above copyright notice for more information.
  40
  41 =========================================================================*/
  42 #ifndef __MAR__KERNEL__PARAMETERS__HXX__
  43 #define __MAR__KERNEL__PARAMETERS__HXX__
  44
  45 #include "marTypes.h"
  46 #include <wx/arrstr.h>
  47 #include <wx/list.h>
  48 #include <fstream>
  49 //using namespace std;
  50
  51 /** /def marParameters
  52  *  \brief Parameters class definition.
  53  */
  54 class creaMaracasVisu_EXPORT marParameters
  55 {
  56     public:
  57
  58     /** /def Enumerations
  59      *  Some mnemonic enumerations for indexes or
  60      *  behaviour types.
  61      */
  62     enum VoxelTypes
  63     {
  64             VOX_TYPE_MINIMUM = 0x01,
  65             VOX_TYPE_NORMAL  = 0x02
  66
  67     };
  68     enum AlgorithmTypes
  69     {
  70             ISOCONTOURS = 1,
  71             SNAKE       = 2,
  72             DERICHE     = 3
  73
  74     };
  75     enum QuantificationTypes
  76     {
  77             TYPE_AREA                    = 0x01,
  78             TYPE_PERIMETER               = 0x02,
  79             TYPE_DIAMETER_FROM_AREA      = 0x04,
  80             TYPE_DIAMETER_FROM_PERIMETER = 0x08,
  81             TYPE_MINIMUM_DIAMETER        = 0x10,
  82             TYPE_MAXIMUM_DIAMETER        = 0x20,
  83             TYPE_AVERAGE_DIAMETER        = 0x40
  84
  85     };
  86     enum BoolParamIndexes
  87     {
  88 // PS ->            e_debug_window_visible = 0  ,
  89 // PS ->            e_debug_console_visible     ,
  90 // PS ->            e_calculate_mip_default     ,
  91 // PS ->            e_choose_all_slices_default ,
  92             e_debug_isocontour          ,
  93             e_debug_diameters           ,
  94             e_debug_fill_area           ,
  95             e_invest_slice_order        ,
  96 // PS ->            e_show_cell                 ,
  97 // PS ->            e_show_int_cell             ,
  98                 e_bool_cont
  99     };
 100     enum DoubleParamIndexes
 101     {
 102             e_gravity_distance = 0          ,
 103             e_axis_discret_step             ,
 104             e_distance_to_maximum_intensity ,
 105             e_cell_coeficient               ,
 106             e_flexion_coeficient            ,
 107             e_tension_coeficient            ,
 108             e_voxel_x_dimension             ,
 109             e_voxel_y_dimension             ,
 110             e_voxel_z_dimension             ,
 111             e_scale                         ,
 112 // PS ->            e_sampling                      ,
 113             e_threshold_isocontour          ,
 114             e_threshold_snake_isocontour    ,
 115             e_sigma                         ,
 116         e_RescaleIntercept              ,
 117         e_RescaleSlope                  ,
 118 // PS ->            e_gradient_coeficient           ,
 119 // PS ->            e_extern_coeficient             ,
 120 // PS ->            e_ballon_coeficient             ,
 121 // PS ->            e_back_color_3D_r               ,
 122 // PS ->            e_back_color_3D_g               ,
 123 // PS ->            e_back_color_3D_b               ,
 124 // PS ->            e_axis_color_r                  ,
 125 // PS ->            e_axis_color_g                  ,
 126 // PS ->            e_axis_color_b                  ,
 127             e_double_cont
 128     };
 129     enum IntParamIndexes
 130     {
 131             e_roi_dimension = 0                     ,
 132             e_step                                  ,
 133             e_step_coeficient                       ,
 134             e_mass_power                            ,
 135             e_algorithm_type                        ,
 136             e_mask_size                             ,
 137             e_number_of_points_for_snake            ,
 138             e_quantification_type                   ,
 139             e_stenosis_type                         ,
 140 // PS ->            e_number_of_iterations_snake_isocontour ,
 141 // PS ->            e_number_of_iterations_snake_deriche    ,
 142             e_voxel_type                            ,
 143 // PS ->            e_coef_cell_max_int                     ,
 144             e_int_cont
 145     };
 146
 147 //EED
 148         enum StringParamIndexes
 149      {
 150             e_installation_directory = 0 ,
 151             e_dicom_images_directory    ,
 152             e_string_cont
 153      };
 154
 155     public:
 156
 157     /** Default constructor.
 158      */
 159     marParameters( ) { reset( );  };
 160
 161     /** Default destructor.
 162      */
 163     ~marParameters( ) {}
 164
 165     /** Default analyzers & modificators.
 166      *
 167      *  These methods use an index i, which should be one defined on
 168      *  correspondant type enum. For example, if you want to get the
 169      *  installation directory parameter you should write:
 170      *
 171      *  marParameters* myParams = new marParameters( );
 172      *  std::string myDir = myParams->
 173      *                         getStringParam(
 174      *                              marParameters::e_installation_directory );
 175      */
 176     bool   getBoolParam( int i )            { return( _boolValues[ i ] );   };
 177     double getDoubleParam( int i )          { return( _doubleValues[ i ] ); };
 178     int    getIntParam( int i )             { return( _intValues[ i ] );    };
 179
 180 //EED
 181      wxString& getStringParam( int i )       { return( _stringValues[ i ] );};
 182
 183     void   setBoolParam( int i, bool p )     { _boolValues[ i ] = p;        };
 184     void   setDoubleParam( int i, double p ) { _doubleValues[ i ] = p;      };
 185     void   setIntParam( int i, int p )       { _intValues[ i ] = p;         };
 186
 187 //EED
 188      void setStringParam( int i, const wxString& p ) { _stringValues[ i ] = p;  };
 189
 190     /** Special analizers & modifiers
 191      *  (in marKernel context, of course).
 192      */
 193     double      getVoxelSize( );
 194     double      getDimIma( );
 195     int         getSizeIma( );
 196     double      getImaRatio( );
 197     float       getRescaleSlope();
 198     float       getRescaleIntercept();
 199         bool    getInvestSliceOrder();
 200
 201     void        setROIStep( double width );
 202     void        setRescaleSlope(float slope);
 203     void        setRescaleIntercept(float intercept);
 204
 205
 206     /** Copy.
 207      */
 208     void   copyFrom( const marParameters& from );
 209
 210     /** Persistence methods.
 211      */
 212     void reset( );
 213     bool save( std::ofstream& os );
 214     bool load( std::ifstream& is );
 215     bool save( wxString& nw );
 216     bool load( wxString& nr );
 217
 218     wxArrayString getRelationalArray( );
 219     void setRelationalArray( wxArrayString& arr );
 220
 221         //MAZV - Added for CT compatibility
 222         int getContourThresh();
 223         double getStandardDeviation();
 224         double getRadius();
 225         int     getLumenPercentage();
 226         int getCalcPercentage();
 227
 228         void setContourThresh( int thresh );
 229         void setStandardDeviation( double dev );
 230         void setRadius( double rad );
 231         void setLumenPercentage(int percentage);
 232         void setCalcPercentage(int percentage);
 233         //MAZV - End of addition
 234
 235
 236   private:
 237
 238     bool   _boolValues[ ( int )e_bool_cont ];
 239     double _doubleValues[ ( int )e_double_cont ];
 240     int   _intValues[ ( int )e_int_cont ];
 241
 242 // EED
 243         wxString _stringValues[ ( int )e_string_cont ];
 244
 245         //MAZV Added fot CT compatibility
 246         int     _contourThresh;
 247         double  _standardDeviation;
 248         double  _radius;
 249         int _lumenPercentage;
 250         int _calcPercentage;
 251         //MAZV - End of addition
 252
 253 };
 254
 255
 256
 257
 258
 259 #endif // __MAR__KERNEL__PARAMETERS__HXX__
 260
 261 // eof - marParameters.h