lib/maracasVisuLib/src/kernel/vtkSTLExtractor.cpp

   1 /*# ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Sant�)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   7 # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   8 #
   9 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  10 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  11 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  12 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  13 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  14 #  or in the file LICENSE.txt.
  15 #
  16 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  17 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  18 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  19 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  20 #  liability.
  21 #
  22 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  23 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  24 # ------------------------------------------------------------------------ */
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  26
  27 #include "vtkSTLExtractor.h"
  28 #include <vtkImageGaussianSmooth.h>
  29 #include <vtkMarchingCubes.h>
  30 #include <vtkCleanPolyData.h>
  31 #include <vtkTriangleFilter.h>
  32 #include <vtkImageContinuousDilate3D.h>
  33
  34
  35 vtkSTLExtractor::vtkSTLExtractor(){
  36         innerSurface = vtkPolyData::New();
  37         outerSurface = vtkPolyData::New();
  38         marchingCubesLevel = 128.0;
  39         sigmaLevel = 100.0;
  40 }
  41
  42 vtkSTLExtractor::~vtkSTLExtractor(){
  43         innerSurface->Delete();
  44         outerSurface->Delete();
  45 }
  46
  47 void vtkSTLExtractor::setVolume(vtkImageData *volume){
  48         this->volume = volume;
  49 }
  50
  51
  52 void vtkSTLExtractor::setMarchingCubesLevel(double level){
  53         this->marchingCubesLevel = level;
  54 }
  55
  56 void vtkSTLExtractor::setSigmaLevel(double level){
  57         this->sigmaLevel = level;
  58 }
  59
  60
  61 double vtkSTLExtractor::getMarchingCubesLevel(){
  62         return marchingCubesLevel;
  63 }
  64
  65 double vtkSTLExtractor::getSigmaLevel(){
  66         return sigmaLevel;
  67 }
  68
  69
  70 vtkPolyData* vtkSTLExtractor::getInnerSurface(){
  71         return innerSurface;
  72 }
  73
  74
  75 vtkPolyData* vtkSTLExtractor::getOuterSurface(){
  76         return outerSurface;
  77 }
  78
  79
  80
  81 void vtkSTLExtractor::calculate(){
  82
  83         // ------------------------------------------------------------------------
  84                 //  1. CALCULATING THE INNER SURFACE
  85                 // ------------------------------------------------------------------------
  86             vtkImageGaussianSmooth *gaussFilter = vtkImageGaussianSmooth::New();
  87         gaussFilter->SetInput(volume);
  88         gaussFilter->SetDimensionality(3);
  89         gaussFilter->SetStandardDeviation(sigmaLevel);
  90
  91         vtkMarchingCubes *cubesFilter = vtkMarchingCubes::New();
  92         cubesFilter->SetInput(gaussFilter->GetOutput());
  93         cubesFilter->SetValue(0,marchingCubesLevel);
  94                 cubesFilter->ComputeGradientsOn ();
  95         cubesFilter->ComputeScalarsOn ();
  96                 cubesFilter->SetNumberOfContours( 1 );
  97
  98                 // Unir puntos duplicados y remover primitivas degeneradas
  99                 vtkCleanPolyData *cleanFilter = vtkCleanPolyData::New();
 100         cleanFilter->SetInput ( cubesFilter->GetOutput() );
 101
 102                 // crea poligonos triangulares
 103         vtkTriangleFilter *triangleFilter = vtkTriangleFilter::New();
 104         triangleFilter->SetInput( cleanFilter->GetOutput() );
 105         triangleFilter->Update();
 106
 107                 innerSurface->DeepCopy(triangleFilter->GetOutput());
 108
 109
 110                 // ------------------------------------------------------------------------
 111                 //  2. CALCULATING THE OUTER SURFACE
 112                 // ------------------------------------------------------------------------
 113                 vtkImageContinuousDilate3D *dilateFilter = vtkImageContinuousDilate3D ::New();
 114         dilateFilter->SetInput (volume);
 115                 dilateFilter->SetKernelSize (3, 3, 3);
 116                 gaussFilter->SetInput( dilateFilter->GetOutput());
 117         triangleFilter->Update();
 118
 119             outerSurface->DeepCopy(triangleFilter->GetOutput());
 120
 121                 // ------------------------------------------------------------------------
 122                 //  3. CLEANING UP
 123                 // ------------------------------------------------------------------------
 124
 125                 gaussFilter->Delete();
 126                 cubesFilter->Delete();
 127                 cleanFilter->Delete();
 128             triangleFilter->Delete();
 129         dilateFilter->Delete();
 130 }