packages/gdcmvtk/src/bbgdcmvtkGetInfoGdcmReader.cxx

   1 #include "bbgdcmvtkGetInfoGdcmReader.h"
   2 #include "bbgdcmvtkPackage.h"
   3
   4 #include "gdcmFile.h"
   5 #include "gdcmFileHelper.h"
   6 #include "vtkImageData.h"
   7 #include "vtkGdcmReader.h"
   8 #include <vtkIndent.h>
   9
  10 namespace bbgdcmvtk
  11 {
  12
  13 BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE(gdcmvtk,GetInfoGdcmReader)
  14 BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION(GetInfoGdcmReader,bbtk::AtomicBlackBox);
  15 void GetInfoGdcmReader::Process()
  16 {
  17         // Reset de reader, f
  18         bbUserFinalizeProcessing();
  19
  20    f = GDCM_NAME_SPACE::File::New();
  21    f->SetFileName( bbGetInputIn() );
  22    bool res = f->Load();
  23    if ( !res )
  24    {
  25       f->Delete();
  26       bbSetOutputOut(0);
  27       return;
  28    }
  29  // Get info from THE image file (only *one* as input)
  30    int i;
  31    std::vector<double> v_iop;
  32    float iop[6];
  33    f->GetImageOrientationPatient(iop);
  34
  35    for(i=0; i< 6; i++)
  36       v_iop.push_back(iop[i]);
  37    bbSetOutputIOP(v_iop );
  38
  39    std::vector<double> v_ipp;
  40    float ipp[3];
  41    f->GetImagePositionPatient(ipp);
  42
  43    for(i=0; i< 3; i++)
  44       v_ipp.push_back(ipp[i]);
  45    bbSetOutputIPP(v_ipp );
  46
  47    std::vector<double> v_pixelspacing;
  48    v_pixelspacing.push_back(f->GetXSpacing());
  49    v_pixelspacing.push_back(f->GetYSpacing());
  50
  51    if (f->GetZSize() != 1)
  52    {
  53       v_pixelspacing.push_back(f->GetZSpacing());
  54    }
  55    bbSetOutputPixelSpacing(v_pixelspacing);
  56
  57    //double interslice;
  58     bbSetOutputInterSlice(f->GetZSpacing());
  59
  60    reader = vtkGdcmReader::New();
  61    reader->SetFileName( bbGetInputIn().c_str() );
  62    reader->Update();
  63    reader->GetOutput();
  64
  65    vtkIndent indent ;
  66    reader->GetOutput()->PrintSelf(std::cout, indent);
  67    bbSetOutputOut( reader->GetOutput() );
  68 }
  69
  70 void GetInfoGdcmReader::bbUserSetDefaultValues()
  71 {
  72    reader=NULL;
  73    f=NULL;
  74    bbSetInputIn("");
  75 }
  76
  77 void GetInfoGdcmReader::bbUserInitializeProcessing()
  78 {
  79 }
  80
  81
  82
  83 void GetInfoGdcmReader::bbUserFinalizeProcessing()
  84 {
  85    if( reader )
  86    {
  87       reader->Delete();
  88       reader=NULL;
  89    }
  90    if(f)
  91    {
  92       f->Delete();
  93       f=NULL;
  94    }
  95 }
  96
  97 }
  98 // EO namespace bbgdcmvtk
  99
 100