packages/gdcmvtk/src/bbgdcmvtkGetInfoGdcmReader.cxx

   1 #include "bbgdcmvtkGetInfoGdcmReader.h"
   2 #include "bbgdcmvtkPackage.h"
   3
   4 #include "gdcmFile.h"
   5 #include "gdcmFileHelper.h"
   6 #include "vtkImageData.h"
   7 #include "vtkGdcmReader.h"
   8 #include <vtkIndent.h>
   9
  10 namespace bbgdcmvtk
  11 {
  12
  13 BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE(gdcmvtk,GetInfoGdcmReader)
  14 BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION(GetInfoGdcmReader,bbtk::AtomicBlackBox);
  15 void GetInfoGdcmReader::Process()
  16 {
  17         // Reset de reader, f
  18         bbUserFinalizeProcessing();
  19
  20    f = GDCM_NAME_SPACE::File::New();
  21    f->SetFileName( bbGetInputIn() );
  22    bool res = f->Load();
  23    if ( !res )
  24    {
  25       f->Delete();
  26       bbSetOutputOut(0);
  27       return;
  28    }
  29  // Get info from THE image file (only *one* as input)
  30    int i;
  31    std::vector<double> v_iop;
  32    float iop[6];
  33    f->GetImageOrientationPatient(iop);
  34    for(i=0; i< 6; i++)
  35       v_iop.push_back(iop[i]);
  36    bbSetOutputIOP(v_iop );
  37
  38    std::vector<double> v_ipp;
  39    float ipp[3];
  40    f->GetImagePositionPatient(ipp);
  41    for(i=0; i< 3; i++)
  42       v_ipp.push_back(ipp[i]);
  43    bbSetOutputIPP(v_ipp );
  44
  45    std::vector<double> v_pixelspacing;
  46    v_pixelspacing.push_back(f->GetXSpacing());
  47    v_pixelspacing.push_back(f->GetYSpacing());
  48    if (f->GetZSize() != 1) {
  49       v_pixelspacing.push_back(f->GetZSpacing());
  50    }
  51    bbSetOutputPixelSpacing(v_pixelspacing);
  52
  53    //double interslice;
  54     bbSetOutputInterSlice(f->GetZSpacing());
  55
  56    reader = vtkGdcmReader::New();
  57    reader->SetFileName( bbGetInputIn().c_str() );
  58    reader->Update();
  59    reader->GetOutput();
  60
  61    vtkIndent indent ;
  62    reader->GetOutput()->PrintSelf(std::cout, indent);
  63    bbSetOutputOut( reader->GetOutput() );
  64 }
  65
  66 void GetInfoGdcmReader::bbUserSetDefaultValues()
  67 {
  68         reader=NULL;
  69         f=NULL;
  70     bbSetInputIn("");
  71 }
  72
  73 void GetInfoGdcmReader::bbUserInitializeProcessing()
  74 {
  75 }
  76
  77
  78
  79 void GetInfoGdcmReader::bbUserFinalizeProcessing()
  80 {
  81         if(reader){
  82       reader->Delete();
  83           reader=NULL;
  84         }
  85         if(f){
  86       f->Delete();
  87           f=NULL;
  88         }
  89
  90 }
  91
  92 }
  93 // EO namespace bbgdcmvtk
  94
  95