packages/itk/src/bbitkBinaryThresholdImageFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   bbtk
   3   Module:    $RCSfile: bbitkBinaryThresholdImageFilter.h,v $
   4   Language:  C++
   5   Date:      $Date: 2009/05/18 10:45:43 $
   6   Version:   $Revision: 1.13 $
   7 =========================================================================*/
   8
   9 /* ---------------------------------------------------------------------
  10
  11 * Copyright (c) CREATIS-LRMN (Centre de Recherche en Imagerie Medicale)
  12 * Authors : Eduardo Davila, Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
  13 *
  14 *  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  15 *  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  16 *  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
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  18 *  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  19 *  or in the file LICENSE.txt.
  20 *
  21 *  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
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  26 *
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  28 *  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  29 * ------------------------------------------------------------------------ */
  30
  31
  32 #ifdef _USE_ITK_
  33
  34 #include "bbtkAtomicBlackBox.h"
  35 #include "itkBinaryThresholdImageFilter.h"
  36 #include "bbtkItkBlackBoxMacros.h"
  37 #include "bbitkImage.h"
  38
  39 namespace bbitk
  40 {
  41
  42   //===================================================
  43   template <class T>
  44   class /*BBTK_EXPORT*/ BinaryThresholdImageFilter
  45     :
  46     public bbtk::AtomicBlackBox,
  47     public itk::BinaryThresholdImageFilter<T,T>
  48   {
  49     BBTK_TEMPLATE_BLACK_BOX_INTERFACE(BinaryThresholdImageFilter,
  50                                       bbtk::AtomicBlackBox,T);
  51     typedef itk::BinaryThresholdImageFilter<T,T> itkParent;
  52     BBTK_DECLARE_ITK_INPUT(In,const T*);
  53     BBTK_DECLARE_ITK_PARAM(LowerThreshold,typename T::PixelType);
  54     BBTK_DECLARE_ITK_PARAM(UpperThreshold,typename T::PixelType);
  55     BBTK_DECLARE_ITK_PARAM(InsideValue,typename T::PixelType);
  56     BBTK_DECLARE_ITK_PARAM(OutsideValue,typename T::PixelType);
  57     BBTK_DECLARE_ITK_OUTPUT(Out,T*);
  58     BBTK_ITK_PROCESS();
  59     BBTK_ITK_DELETE();
  60
  61   };
  62   //===================================================
  63
  64   //===================================================
  65   BBTK_BEGIN_DESCRIBE_TEMPLATE_BLACK_BOX(BinaryThresholdImageFilter,
  66                                       bbtk::AtomicBlackBox);
  67   BBTK_NAME("BinaryThresholdImageFilter<"+bbtk::TypeName<T>()+">");
  68   BBTK_AUTHOR("laurent.guigues@creatis.insa-lyon.fr");
  69   BBTK_DESCRIPTION("Binarizes an image by thresholding (bbification of itk::BinaryThresholdImageFilter)");
  70   BBTK_TEMPLATE_INPUT(BinaryThresholdImageFilter,In,"Input image",const T*);
  71   BBTK_TEMPLATE_INPUT(BinaryThresholdImageFilter,LowerThreshold,
  72                       "Lower threshold",typename T::PixelType);
  73   BBTK_TEMPLATE_INPUT(BinaryThresholdImageFilter,UpperThreshold,
  74                       "Upper threshold",typename T::PixelType);
  75   BBTK_TEMPLATE_INPUT(BinaryThresholdImageFilter,InsideValue,
  76                       "Output value for pixels inside thresholds",
  77                       typename T::PixelType);
  78   BBTK_TEMPLATE_INPUT(BinaryThresholdImageFilter,OutsideValue,
  79                       "Output value for pixels outside thresholds",
  80                       typename T::PixelType);
  81   BBTK_TEMPLATE_OUTPUT(BinaryThresholdImageFilter,Out,"Output image",T*);
  82   BBTK_END_DESCRIBE_TEMPLATE_BLACK_BOX(BinaryThresholdImageFilter);
  83   //===================================================
  84
  85
  86   //===================================================
  87   //--
  88   template <class T>
  89   void BinaryThresholdImageFilter<T>::bbUserSetDefaultValues()
  90   {
  91     bbSetInputLowerThreshold(0);
  92     bbSetInputUpperThreshold(100);
  93     bbSetInputInsideValue(255);
  94     bbSetInputOutsideValue(0);
  95   }
  96   template <class T>
  97   void BinaryThresholdImageFilter<T>::bbUserInitializeProcessing()
  98   {
  99   }
 100   template <class T>
 101   void BinaryThresholdImageFilter<T>::bbUserFinalizeProcessing()
 102   {
 103   }
 104
 105   //===================================================
 106
 107
 108
 109
 110
 111
 112
 113
 114
 115
 116
 117   //===================================================
 118   // Generic "untemplatized" filter
 119   //===================================================
 120   class /*BBTK_EXPORT*/ BinaryThresholdImageFilterGeneric
 121     :
 122     public bbtk::AtomicBlackBox
 123   {
 124     BBTK_BLACK_BOX_INTERFACE(BinaryThresholdImageFilterGeneric,
 125                                   bbtk::AtomicBlackBox);
 126     BBTK_DECLARE_INPUT(In,anyImagePointer);
 127     BBTK_DECLARE_INPUT(LowerThreshold,double);
 128     BBTK_DECLARE_INPUT(UpperThreshold,double);
 129     BBTK_DECLARE_INPUT(InsideValue,double);
 130     BBTK_DECLARE_INPUT(OutsideValue,double);
 131     BBTK_DECLARE_OUTPUT(Out,anyImagePointer);
 132     BBTK_PROCESS(ProcessSwitch);
 133   private :
 134     inline void ProcessSwitch();
 135     template <class T> void Process();
 136   };
 137   //===================================================
 138
 139
 140   //===================================================
 141
 142   BBTK_BEGIN_DESCRIBE_BLACK_BOX(BinaryThresholdImageFilterGeneric,
 143                                 bbtk::AtomicBlackBox);
 144   BBTK_NAME("BinaryThresholdImageFilter");
 145   BBTK_AUTHOR("laurent.guigues at creatis.insa-lyon.fr");
 146   BBTK_CATEGORY("filter;image");
 147   BBTK_DESCRIPTION("Binarizes an image by thresholding (generic bbification of itk::BinaryThresholdImageFilter)");
 148   BBTK_INPUT(BinaryThresholdImageFilterGeneric,In,
 149              "Input image. Can be any itk::Image<T,D>*",anyImagePointer,"");
 150   BBTK_INPUT(BinaryThresholdImageFilterGeneric,LowerThreshold,
 151              "Lower threshold",double,"");
 152   BBTK_INPUT(BinaryThresholdImageFilterGeneric,UpperThreshold,
 153              "Upper threshold",double,"");
 154   BBTK_INPUT(BinaryThresholdImageFilterGeneric,InsideValue,
 155              "Output value for pixels inside thresholds",double,"");
 156   BBTK_INPUT(BinaryThresholdImageFilterGeneric,OutsideValue,
 157              "Output value for pixels outside thresholds",double,"");
 158   BBTK_OUTPUT(BinaryThresholdImageFilterGeneric,Out,
 159               "Output image. Of the same type and dimension than the input image",
 160               anyImagePointer,"");
 161   BBTK_END_DESCRIBE_BLACK_BOX(BinaryThresholdImageFilterGeneric);
 162   //===================================================
 163
 164
 165
 166
 167   //===================================================
 168
 169   void BinaryThresholdImageFilterGeneric::ProcessSwitch()
 170   {
 171     BBTK_TEMPLATE_ITK_IMAGE_SWITCH(bbGetInputIn().type(), this->Process);
 172   }
 173   //===================================================
 174
 175
 176   //===================================================
 177
 178   template <class T>
 179   void BinaryThresholdImageFilterGeneric::Process()
 180   {
 181     bbtkDebugMessageInc("Core",9,
 182                         "bbitk::BinaryThresholdImageFilterGeneric::Process<"
 183                         <<bbtk::TypeName<T>()<<">()"<<std::endl);
 184
 185     typedef BinaryThresholdImageFilter<T> FilterType;
 186     typename FilterType::Pointer f = FilterType::New("Temp");
 187           typedef T* TPointer;
 188           f->bbSetInputIn( this->bbGetInputIn().get < TPointer > () );
 189     f->bbSetInputLowerThreshold ( (typename T::PixelType)
 190                                   this->bbGetInputLowerThreshold() );
 191     f->bbSetInputUpperThreshold ( (typename T::PixelType)
 192                                   this->bbGetInputUpperThreshold() );
 193     f->bbSetInputInsideValue ( (typename T::PixelType)
 194                                this->bbGetInputInsideValue() );
 195     f->bbSetInputOutsideValue ( (typename T::PixelType)
 196                                 this->bbGetInputOutsideValue() );
 197     f->bbExecute();
 198     f->bbGetOutputOut()->Register();
 199     this->bbSetOutputOut( f->bbGetOutputOut() );
 200
 201     bbtkDebugDecTab("Core",9);
 202   }
 203
 204   //===================================================
 205
 206
 207
 208
 209
 210
 211
 212
 213 }
 214 // EO namespace bbtk
 215
 216 #endif