packages/itk/src/bbitkImageProperties.cxx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   bbtk
   3   Module:    $RCSfile: bbitkImageProperties.cxx,v $
   4   Language:  C++
   5   Date:      $Date: 2011/02/28 06:56:57 $
   6   Version:   $Revision: 1.14 $
   7 =========================================================================*/
   8
   9 /* ---------------------------------------------------------------------
  10
  11 * Copyright (c) CREATIS-LRMN (Centre de Recherche en Imagerie Medicale)
  12 * Authors : Eduardo Davila, Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
  13 *
  14 *  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  15 *  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
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  18 *  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
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  28 *  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  29 * ------------------------------------------------------------------------ */
  30
  31 /**
  32  *  \file
  33  *  \brief
  34  */
  35 #ifdef _USE_ITK_
  36
  37 #include "bbitkImageProperties.h"
  38 #include "bbitkPackage.h"
  39 #include "itkMinimumMaximumImageFilter.h"
  40
  41 namespace bbitk
  42 {
  43   BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION(ImageProperties,bbtk::AtomicBlackBox);
  44
  45   BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE(itk,ImageProperties);
  46
  47         //-----------------------------------------------------------------
  48         void ImageProperties::bbUserSetDefaultValues()
  49         {
  50         }
  51
  52         //-----------------------------------------------------------------
  53         void ImageProperties::bbUserInitializeProcessing()
  54         {
  55         }
  56
  57         //-----------------------------------------------------------------
  58         void ImageProperties::bbUserFinalizeProcessing()
  59         {
  60         }
  61
  62   void ImageProperties::DoIt()
  63   {
  64     BBTK_TEMPLATE_ITK_IMAGE_SWITCH(bbGetInputIn().type(),DoIt);
  65   }
  66
  67   /**
  68       Template Processing
  69   */
  70   template<class itkImageType>
  71   void ImageProperties::DoIt()
  72   {
  73     bbtkDebugMessageInc("Core",9,"bbitk::ImageProperties::DoIt<"
  74                         <<bbtk::TypeName<itkImageType>()
  75                         <<">()"<<std::endl);
  76
  77     itkImageType* im = bbGetInputIn().get<itkImageType*>();
  78     unsigned int dim = im->GetImageDimension();
  79
  80     bbSetOutputTypeName(bbtk::TypeName<typename itkImageType::PixelType>());
  81     bbSetOutputDimension(dim);
  82     const typename itkImageType::RegionType& r =im->GetLargestPossibleRegion();
  83     bbSetOutputLargestPossibleRegion(r);
  84
  85     const typename itkImageType::IndexType& ind = r.GetIndex();
  86     std::vector<int> vind;
  87     for (unsigned int i=0;i<dim;++i)
  88        vind.push_back(ind[i]);
  89     bbSetOutputIndex(vind);
  90
  91     const typename itkImageType::SizeType& sz = r.GetSize();
  92     std::vector<int> vsz;
  93     for (unsigned int i=0;i<dim;++i)
  94        vsz.push_back(sz[i]);
  95
  96   // brute hack to avoid failure of most black boxes that expects 3D images. // JPR
  97    if (dim==2)
  98         vsz.push_back(1);
  99     bbSetOutputSize(vsz);
 100
 101     typename itkImageType::SpacingType sp = im->GetSpacing();
 102     std::vector<float> vsp;
 103     for (unsigned int i=0;i<dim;++i)
 104        vsp.push_back(sp[i]);
 105
 106  // brute hack to avoid failure of most black boxes that expects 3D images. // JPR
 107     if (dim==2)
 108        vsp.push_back(1.0);
 109
 110     bbSetOutputSpacing(vsp);
 111
 112
 113   // Min Max Value                     // EED
 114           //itk::MinimumMaximumImageFilter< TInputImage >
 115           printf("EED ImageProperties::DoIt 1\n");
 116           itk::MinimumMaximumImageFilter<itkImageType>   *minmaxfilter = itk::MinimumMaximumImageFilter< itkImageType >::New();
 117           printf("EED ImageProperties::DoIt 2\n");
 118           std::vector<float> vminmax;
 119 /*
 120           minmaxfilter->SetInput(im);
 121           printf("EED ImageProperties::DoIt 3\n");
 122           minmaxfilter->Update();
 123           printf("EED ImageProperties::DoIt 4\n");
 124 //        vminmax.push_back( minmaxfilter->GetMinimumOutput()->Get() );
 125 //        vminmax.push_back( minmaxfilter->GetMaximumOutput()->Get() );
 126           vminmax.push_back( minmaxfilter->GetMinimum() );
 127           printf("EED ImageProperties::DoIt 5\n");
 128           vminmax.push_back( minmaxfilter->GetMaximum() );
 129           printf("EED ImageProperties::DoIt 6\n");
 130 */
 131           vminmax.push_back( 22 );
 132           vminmax.push_back( 33 );
 133
 134           bbSetOutputMinMax(vminmax);
 135           printf("EED ImageProperties::DoIt 7\n");
 136
 137     bbtkDebugDecTab("Core",9);
 138   }
 139 }
 140 // eo namespace bbtk
 141
 142 #endif