packages/itk/src/bbitkImageReader.cxx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   bbtk
   3   Module:    $RCSfile: bbitkImageReader.cxx,v $
   4   Language:  C++
   5   Date:      $Date: 2010/04/08 14:37:58 $
   6   Version:   $Revision: 1.8 $
   7 =========================================================================*/
   8
   9 /* ---------------------------------------------------------------------
  10
  11 * Copyright (c) CREATIS-LRMN (Centre de Recherche en Imagerie Medicale)
  12 * Authors : Eduardo Davila, Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
  13 *
  14 *  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  15 *  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  16 *  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
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  18 *  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  19 *  or in the file LICENSE.txt.
  20 *
  21 *  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
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  28 *  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  29 * ------------------------------------------------------------------------ */
  30
  31 /**
  32  *  \file
  33  *  \brief
  34  */
  35 #ifdef _USE_ITK_
  36
  37 #include "bbitkImageReader.h"
  38 #include "bbitkPackage.h"
  39 #include "itkImageFileReader.h"
  40
  41 namespace bbitk
  42 {
  43   BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION(ImageReader,bbtk::AtomicBlackBox);
  44
  45   BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE(itk,ImageReader);
  46
  47         //-----------------------------------------------------------------
  48         void ImageReader::bbUserSetDefaultValues()
  49         {
  50         }
  51
  52         //-----------------------------------------------------------------
  53         void ImageReader::bbUserInitializeProcessing()
  54         {
  55         }
  56
  57         //-----------------------------------------------------------------
  58         void ImageReader::bbUserFinalizeProcessing()
  59         {
  60         }
  61
  62   void ImageReader::Read()
  63   {
  64     std::string filename = bbGetInputIn();
  65
  66     itk::ImageIOBase::Pointer genericReader =
  67       itk::ImageIOFactory::CreateImageIO(filename.c_str(),
  68                                          itk::ImageIOFactory::ReadMode);
  69     if (!genericReader)
  70       {
  71         bbtkError("File format unknown (while reading [" << filename << "])");
  72       }
  73     genericReader->SetFileName(filename.c_str());
  74     genericReader->ReadImageInformation();
  75
  76     bbtk::TypeInfo typ = GetITKImagePtrTypeInfoFromPixelTypeInfoAndDimension(genericReader->GetComponentTypeInfo(), genericReader->GetNumberOfDimensions());
  77
  78     BBTK_TEMPLATE_ITK_IMAGE_SWITCH( typ, Read);
  79   }
  80
  81
  82   /**
  83       Template Processing
  84   */
  85   template<class itkImageType>
  86   void ImageReader::Read()
  87   {
  88     bbtkDebugMessageInc("Core",9,"itkImageReader<"<<
  89                         bbtk::TypeName<itkImageType>()
  90                         <<">::Read()"<<std::endl);
  91
  92     typedef itk::ImageFileReader< itkImageType > itkReaderType;
  93
  94     typename itkReaderType::Pointer reader = itkReaderType::New();
  95     std::string filename = bbGetInputIn();
  96     reader->SetFileName(filename.c_str());
  97     try { reader->Update(); }
  98     catch( std::exception& e )
  99       {
 100         bbtkError("could not read image \""<< filename << "\" : "<<e.what());
 101       }
 102
 103     reader->GetOutput()->Register();
 104     bbSetOutputOut( reader->GetOutput() );
 105
 106     bbtkDebugDecTab("Core",9);
 107   }
 108
 109 }
 110 // eo namespace bbtk
 111
 112 #endif