packages/itk/src/bbitkImageReader.cxx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   bbtk
   3   Module:    $RCSfile: bbitkImageReader.cxx,v $
   4   Language:  C++
   5   Date:      $Date: 2008/10/17 08:18:21 $
   6   Version:   $Revision: 1.5 $
   7 =========================================================================*/
   8
   9 /* ---------------------------------------------------------------------
  10
  11 * Copyright (c) CREATIS-LRMN (Centre de Recherche en Imagerie Medicale)
  12 * Authors : Eduardo Davila, Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
  13 *
  14 *  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  15 *  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  16 *  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
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  18 *  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  19 *  or in the file LICENSE.txt.
  20 *
  21 *  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
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  26 *
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  28 *  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  29 * ------------------------------------------------------------------------ */
  30
  31 /**
  32  *  \file
  33  *  \brief
  34  */
  35 #ifdef _USE_ITK_
  36
  37 #include "bbitkImageReader.h"
  38 #include "bbitkPackage.h"
  39 #include "itkImageFileReader.h"
  40
  41 namespace bbitk
  42 {
  43   BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION(ImageReader,bbtk::AtomicBlackBox);
  44
  45   BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE(itk,ImageReader);
  46
  47
  48
  49
  50   void ImageReader::Read()
  51   {
  52     std::string filename = bbGetInputIn();
  53
  54     itk::ImageIOBase::Pointer genericReader =
  55       itk::ImageIOFactory::CreateImageIO(filename.c_str(),
  56                                          itk::ImageIOFactory::ReadMode);
  57     if (!genericReader)
  58       {
  59         bbtkError("File format unknown (while reading \"" << filename << "\")");
  60       }
  61     genericReader->SetFileName(filename.c_str());
  62     genericReader->ReadImageInformation();
  63
  64     bbtk::TypeInfo typ = GetITKImagePtrTypeInfoFromPixelTypeInfoAndDimension(genericReader->GetComponentTypeInfo(), genericReader->GetNumberOfDimensions());
  65
  66     BBTK_TEMPLATE_ITK_IMAGE_SWITCH( typ, Read);
  67   }
  68
  69
  70
  71   /**
  72       Template Processing
  73   */
  74   template<class itkImageType>
  75   void ImageReader::Read()
  76   {
  77     bbtkDebugMessageInc("Core",9,"itkImageReader<"<<
  78                         bbtk::TypeName<itkImageType>()
  79                         <<">::Read()"<<std::endl);
  80
  81     typedef itk::ImageFileReader< itkImageType > itkReaderType;
  82
  83     typename itkReaderType::Pointer reader = itkReaderType::New();
  84     std::string filename = bbGetInputIn();
  85     reader->SetFileName(filename.c_str());
  86     try { reader->Update(); }
  87     catch( std::exception& e )
  88       {
  89         bbtkError("could not read image \""<< filename << "\" : "<<e.what());
  90       }
  91
  92     reader->GetOutput()->Register();
  93     bbSetOutputOut( reader->GetOutput() );
  94
  95     bbtkDebugDecTab("Core",9);
  96   }
  97
  98
  99
 100
 101
 102
 103 }
 104 // eo namespace bbtk
 105
 106 #endif