packages/itk/src/bbitkImageReader.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   bbtk
   4   Module:    $RCSfile: bbitkImageReader.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2008/04/18 12:59:50 $
   7   Version:   $Revision: 1.3 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
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  12
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  16
  17 =========================================================================*/
  18 /**
  19  *  \file
  20  *  \brief
  21  */
  22 #ifdef _USE_ITK_
  23
  24 #include "bbitkImageReader.h"
  25 #include "bbitkPackage.h"
  26 #include "itkImageFileReader.h"
  27
  28 namespace bbitk
  29 {
  30   BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION(ImageReader,bbtk::AtomicBlackBox);
  31
  32   BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE(itk,ImageReader);
  33
  34
  35
  36
  37   void ImageReader::Read()
  38   {
  39     std::string filename = bbGetInputFilename();
  40
  41     itk::ImageIOBase::Pointer genericReader =
  42       itk::ImageIOFactory::CreateImageIO(filename.c_str(),
  43                                          itk::ImageIOFactory::ReadMode);
  44     if (!genericReader)
  45       {
  46         bbtkError("File format unknown (while reading \"" << filename << "\")");
  47       }
  48     genericReader->SetFileName(filename.c_str());
  49     genericReader->ReadImageInformation();
  50
  51     bbtk::TypeInfo typ = GetITKImagePtrTypeInfoFromPixelTypeInfoAndDimension(genericReader->GetComponentTypeInfo(), genericReader->GetNumberOfDimensions());
  52
  53     BBTK_TEMPLATE_ITK_IMAGE_SWITCH( typ, Read);
  54   }
  55
  56
  57
  58   /**
  59       Template Processing
  60   */
  61   template<class itkImageType>
  62   void ImageReader::Read()
  63   {
  64     bbtkDebugMessageInc("Core",9,"itkImageReader<"<<
  65                         bbtk::TypeName<itkImageType>()
  66                         <<">::Read()"<<std::endl);
  67
  68     typedef itk::ImageFileReader< itkImageType > itkReaderType;
  69
  70     typename itkReaderType::Pointer reader = itkReaderType::New();
  71     std::string filename = bbGetInputFilename();
  72     reader->SetFileName(filename.c_str());
  73     try { reader->Update(); }
  74     catch( std::exception& e )
  75       {
  76         bbtkError("could not read image \""<< filename << "\" : "<<e.what());
  77       }
  78
  79     reader->GetOutput()->Register();
  80     bbSetOutputOut( reader->GetOutput() );
  81
  82     bbtkDebugDecTab("Core",9);
  83   }
  84
  85
  86
  87
  88
  89
  90 }
  91 // eo namespace bbtk
  92
  93 #endif