packages/vtk/bbs/old/exampleGaussianSmooth.bbs

   1 # ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la SantÈ)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   7 # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   8 #
   9 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  10 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  11 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  12 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  13 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  14 #  or in the file LICENSE.txt.
  15 #
  16 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  17 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  18 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  19 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  20 #  liability.
  21 #
  22 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  23 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  24 # ------------------------------------------------------------------------ */
  25
  26
  27 print "=== GaussianSmooth box example ==="
  28 description "GaussianSmooth box example.  Screenshot : <img src=ExampleGaussianSmooth.JPG></img>"
  29 author "eduardo.davila at creatis.insa-lyon.fr"
  30 category "example"
  31
  32 include std
  33 include vtk
  34 include wx
  35 include itk
  36 include itkvtk
  37 include wxvtk
  38
  39 new MetaImageReader reader
  40 include  std/boxes/bbPrependPackageDataPath.bbs
  41 new PrependPackageDataPath prependDatapath
  42   set prependDatapath.In "vtk/hola.mhd"
  43   connect prependDatapath.Out reader.In
  44
  45 #---------------------------------------------------------------------
  46
  47 new Slider slider
  48   set slider.Title "Slice"
  49   set slider.Max        190
  50   set slider.In         10
  51
  52 #---------------------------------------------------------------------
  53
  54 new Viewer2D viewer2DImageOriginal
  55   connect reader.Out                    viewer2DImageOriginal.In
  56   connect slider.Out                    viewer2DImageOriginal.Slice
  57   connect slider.BoxChange              viewer2DImageOriginal.BoxExecute
  58
  59 #---------------------------------------------------------------------
  60
  61 new BinaryThresholdImageFilter threshold
  62   set threshold.LowerThreshold 1000
  63   set threshold.UpperThreshold 5000
  64   set threshold.InsideValue 255
  65   set threshold.OutsideValue 0
  66   connect reader.Out threshold.In
  67
  68 new Viewer2D viewer2DImageSegmented
  69   connect threshold.Out                 viewer2DImageSegmented.In
  70   connect slider.Out                    viewer2DImageSegmented.Slice
  71   connect slider.BoxChange              viewer2DImageSegmented.BoxExecute
  72
  73 #---------------------------------------------------------------------
  74
  75 new ImageGaussianSmooth smooth
  76   connect threshold.Out smooth.In
  77   set smooth.StdDevX  1
  78   set smooth.StdDevY  1
  79   set smooth.StdDevZ  1
  80
  81 new Viewer2D viewer2DImageSmooth
  82   connect smooth.Out                    viewer2DImageSmooth.In
  83   connect slider.Out                    viewer2DImageSmooth.Slice
  84   connect slider.BoxChange              viewer2DImageSmooth.BoxExecute
  85
  86 #---------------------------------------------------------------------
  87
  88 new LayoutLine upLayout
  89   set upLayout.Orientation H
  90   connect viewer2DImageOriginal.Widget          upLayout.Widget1
  91   connect viewer2DImageSegmented.Widget         upLayout.Widget2
  92   connect viewer2DImageSmooth.Widget            upLayout.Widget3
  93
  94
  95 #---------------------------------------------------------------------
  96
  97 new Viewer3D  viewernvImagethreshold3D
  98 #  set viewernvImagethreshold3D.nTypeView "5"
  99
 100 new IsoSurfaceExtractor  isoextractorthreshold
 101   connect threshold.Out isoextractorthreshold.In
 102   set isoextractorthreshold.Opacity 1
 103   set isoextractorthreshold.Isovalue 128
 104   connect viewernvImagethreshold3D.Renderer             isoextractorthreshold.Renderer
 105
 106
 107 #---------------------------------------------------------------------
 108 new Viewer3D  viewernvImageSmooth3D
 109 #  set viewernvImageSmooth3D.nTypeView "5"
 110
 111 new IsoSurfaceExtractor  isoextractorsmooth
 112   connect smooth.Out isoextractorsmooth.In
 113   set isoextractorsmooth.Opacity 1
 114   set isoextractorsmooth.Isovalue 128
 115   connect viewernvImageSmooth3D.Renderer                isoextractorsmooth.Renderer
 116
 117
 118 #---------------------------------------------------------------------
 119
 120 new LayoutLine downLayout
 121   set downLayout.Orientation H
 122   connect viewernvImagethreshold3D.Widget               downLayout.Widget1
 123   connect viewernvImageSmooth3D.Widget          downLayout.Widget2
 124
 125 #---------------------------------------------------------------------
 126 new LayoutSplit splitDown
 127   connect upLayout.Widget               splitDown.Widget1
 128   connect downLayout.Widget             splitDown.Widget2
 129
 130 #---------------------------------------------------------------------
 131 new LayoutSplit mainSplit
 132   connect slider.Widget         mainSplit.Widget1
 133   connect splitDown.Widget      mainSplit.Widget2
 134
 135
 136
 137 exec isoextractorthreshold
 138 exec isoextractorsmooth
 139 exec mainSplit