packages/vtk/src/bbvtkImageBoundaries.cxx

   1 /*
   2  # ---------------------------------------------------------------------
   3  #
   4  # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   5  #                        pour la SantÈ)
   6  # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   7  # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   8  # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   9  #
  10  #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  11  #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  12  #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  13  #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  14  #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  15  #  or in the file LICENSE.txt.
  16  #
  17  #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  18  #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  19  #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  20  #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  21  #  liability.
  22  #
  23  #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  24  #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  25  # ------------------------------------------------------------------------ */
  26
  27
  28 //=====
  29 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
  30 //=====
  31 #include "bbvtkImageBoundaries.h"
  32 #include "bbvtkPackage.h"
  33 namespace bbvtk
  34 {
  35
  36 BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE(vtk,ImageBoundaries)
  37 BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION(ImageBoundaries,bbtk::AtomicBlackBox);
  38 //=====
  39 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
  40 //=====
  41 void ImageBoundaries::Process()
  42 {
  43         printf("bbtk:vtk::ImageBoundaries::Process start\n");
  44         if (bbGetInputIn()!=NULL){
  45                 int i,j,k;
  46                 int ext[6];
  47                 double value;
  48
  49 //EED 2017-01-01 Migration VTK7
  50 #if (VTK_MAJOR_VERSION <= 5)
  51                 bbGetInputIn()->GetWholeExtent(ext);
  52 #endif
  53 #if (VTK_MAJOR_VERSION >= 6)
  54                 bbGetInputIn()->GetExtent(ext);
  55 #endif
  56
  57                 int maxX        = ext[1]-ext[0]+1;
  58                 int maxY        = ext[3]-ext[2]+1;
  59                 int maxZ        = ext[5]-ext[4]+1;
  60
  61                 int bXMax       = 0;
  62                 int bYMax       = 0;
  63                 int bZMax       = 0;
  64                 int bXMin       = maxX-1;
  65                 int bYMin       = maxY-1;
  66                 int bZMin       = maxZ-1;
  67
  68                 for (i=0 ; i<maxX ; i++)
  69                 {
  70                         for (j=0 ; j<maxY ; j++)
  71                         {
  72                                 for (k=0 ; k<maxZ ; k++)
  73                                 {
  74                                         value = bbGetInputIn()->GetScalarComponentAsDouble(i, j, k,0);
  75                                         if ( (value>=bbGetInputLowerValue()) && (value<=bbGetInputUpperValue())  )
  76                                         {
  77                                                 if (i<bXMin) bXMin=i;
  78                                                 if (j<bYMin) bYMin=j;
  79                                                 if (k<bZMin) bZMin=k;
  80                                                 if (i>bXMax) bXMax=i;
  81                                                 if (j>bYMax) bYMax=j;
  82                                                 if (k>bZMax) bZMax=k;
  83                                         }
  84                                 } // for k
  85                         } // for j
  86                 } // i
  87
  88                 std::vector<int> tmpIndex;
  89                 std::vector<int> tmpSize;
  90
  91                 if (bXMin>bXMax){
  92                         tmpIndex.push_back(0);
  93                         tmpIndex.push_back(0);
  94                         tmpIndex.push_back(0);
  95                         tmpSize.push_back(1);
  96                         tmpSize.push_back(1);
  97                         tmpSize.push_back(1);
  98                 } else {
  99                         tmpIndex.push_back(bXMin);
 100                         tmpIndex.push_back(bYMin);
 101                         tmpIndex.push_back(bZMin);
 102                         tmpSize.push_back(bXMax-bXMin+1);
 103                         tmpSize.push_back(bYMax-bYMin+1);
 104                         tmpSize.push_back(bZMax-bZMin+1);
 105                 }
 106
 107                 bbSetOutputIndex(tmpIndex);
 108                 bbSetOutputSize(tmpSize);
 109         } else {
 110                 printf("bbtk warnning: bbtk:vtk:ImageBoundaries box, Input image (In) not initialized..\n");
 111         }
 112         printf("bbtk:vtk::ImageBoundaries::Process end\n");
 113 }
 114 //=====
 115 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
 116 //=====
 117 void ImageBoundaries::bbUserSetDefaultValues()
 118 {
 119
 120
 121 //  SET HERE THE DEFAULT INPUT/OUTPUT VALUES OF YOUR BOX
 122    bbSetInputIn(NULL);
 123         bbSetInputLowerValue(0);
 124         bbSetInputUpperValue(5000);
 125
 126         std::vector<int> tmpIndex;
 127         tmpIndex.push_back(0);
 128         tmpIndex.push_back(0);
 129         tmpIndex.push_back(0);
 130
 131         std::vector<int> tmpSize;
 132         tmpSize.push_back(1);
 133         tmpSize.push_back(1);
 134         tmpSize.push_back(1);
 135
 136         bbSetOutputIndex(tmpIndex);
 137         bbSetOutputSize(tmpSize);
 138 }
 139 //=====
 140 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
 141 //=====
 142 void ImageBoundaries::bbUserInitializeProcessing()
 143 {
 144
 145 //  THE INITIALIZATION METHOD BODY :
 146 //    Here does nothing
 147 //    but this is where you should allocate the internal/output pointers
 148 //    if any
 149
 150
 151 }
 152 //=====
 153 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
 154 //=====
 155 void ImageBoundaries::bbUserFinalizeProcessing()
 156 {
 157
 158 //  THE FINALIZATION METHOD BODY :
 159 //    Here does nothing
 160 //    but this is where you should desallocate the internal/output pointers
 161 //    if any
 162
 163 }
 164 }
 165 // EO namespace bbvtk
 166
 167