]> Creatis software - bbtk.git/blob - packages/vtk/src/bbvtkSegmentationConnectivity.h
Clean code
[bbtk.git] / packages / vtk / src / bbvtkSegmentationConnectivity.h
1 /*
2  # ---------------------------------------------------------------------
3  #
4  # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
5  #                        pour la SantÈ)
6  # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
7  # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
8  # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
9  #
10  #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
11  #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
12  #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
13  #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
14  #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
15  #  or in the file LICENSE.txt.
16  #
17  #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
18  #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
19  #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
20  #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
21  #  liability.
22  #
23  #  The fact that you are presently reading this means that you have had
24  #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
25  # ------------------------------------------------------------------------ */
26
27
28 /*=========================================================================
29   Program:   bbtk
30   Module:    $RCSfile: bbvtkSegmentationConnectivity.h,v $
31   Language:  C++
32   Date:      $Date: 2012/11/16 08:51:58 $
33   Version:   $Revision: 1.7 $
34 =========================================================================*/
35
36 /**
37  * \brief Short description in one line
38  * 
39  * Long description which 
40  * can span multiple lines
41  */
42 /**
43  * \file 
44  * \brief Pattern for the definition of a new type of Node (header)
45  */
46 /**
47  * \class bbtk::NodePatern 
48  * \brief Pattern for the definition of a new type of Node 
49  */
50
51
52 #ifdef _USE_VTK_
53
54 #ifndef __bbvtkSegmentationConnectivity_h_INCLUDED__
55 #define __bbvtkSegmentationConnectivity_h_INCLUDED__
56
57 #include "bbtkAtomicBlackBox.h"
58
59 #include "vtkVersion.h"
60 #include <vtkImageData.h>
61 #include <vtkImageCast.h>
62 #include <vtkImageThreshold.h>
63 #include <vtkImageSeedConnectivity.h>
64
65 namespace bbvtk
66 {
67
68   class SegmentationConnectivity
69     : 
70     public bbtk::AtomicBlackBox
71   {
72     BBTK_BLACK_BOX_INTERFACE(SegmentationConnectivity,bbtk::AtomicBlackBox);
73     BBTK_DECLARE_INPUT(In,vtkImageData *);
74     BBTK_DECLARE_INPUT(PositionXYZ,std::vector<int>);
75     BBTK_DECLARE_INPUT(ThresholdMinMax,std::vector<int>);
76     BBTK_DECLARE_INPUT(Value,unsigned char);
77     BBTK_DECLARE_INPUT( OutputFormat , std::string );
78     BBTK_DECLARE_OUTPUT(Out,vtkImageData *);
79     BBTK_PROCESS(DoProcess);
80     void DoProcess();
81
82   protected:
83
84   private:
85 //      vtkImageCast             *cast2;
86         vtkImageCast             *cast4; // binary segmentation result
87         vtkImageThreshold        *thresh2;
88         vtkImageSeedConnectivity *connect2;
89
90   };
91
92   BBTK_BEGIN_DESCRIBE_BLACK_BOX(SegmentationConnectivity,bbtk::AtomicBlackBox);
93     BBTK_NAME("SegmentationConnectivity");
94     BBTK_AUTHOR("eduardo.davila [at] creatis.insa-lyon.fr");
95     BBTK_DESCRIPTION("(Adapted to use vtkImageSeedConnectivity) - Segmentation with min max threshold and connectivity");
96
97     BBTK_INPUT(SegmentationConnectivity,In,"Input image",vtkImageData *,"");
98     BBTK_INPUT(SegmentationConnectivity,PositionXYZ,"Lsit of POINTS.  Vector with the Position [x y z]" , std::vector<int>,"");
99     BBTK_INPUT(SegmentationConnectivity,ThresholdMinMax,"vector with the Threshold [min max]" , std::vector<int>,"");
100     BBTK_INPUT(SegmentationConnectivity,Value,"(255 default) [0..255] Gey level of output image" , unsigned char,"");
101     BBTK_INPUT(SegmentationConnectivity,OutputFormat,"Image output format:  SAME (default), VTK_BIT, VTK_CHAR, VTK_SIGNED_CHAR, VTK_UNSIGNED_CHAR, VTK_SHORT, VTK_UNSIGNED_SHORT, VTK_INT, VTK_UNSIGNED_INT, VTK_LONG, VTK_UNSIGNED_LONG, VTK_FLOAT, VTK_DOUBLE",std::string,"");
102
103     BBTK_OUTPUT(SegmentationConnectivity,Out,"Result image",vtkImageData *,"");
104  
105  BBTK_END_DESCRIBE_BLACK_BOX(SegmentationConnectivity);
106
107 } // EO namespace bbvtk
108
109 #endif //  __bbvtkSegmentationConnectivity_h_INCLUDED__
110
111 #endif //_USE_VTK_