]> Creatis software - clitk.git/blob - registration/clitkAffineRegistrationGenericFilter.h
Removed ggo template for affine registration
[clitk.git] / registration / clitkAffineRegistrationGenericFilter.h
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2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
3
4   Authors belong to:
5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
6   - Léon Bérard cancer center       http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
8
9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
12
13   It is distributed under dual licence
14
15   - BSD        See included LICENSE.txt file
16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
17 ======================================================================-====*/
18
19 #ifndef CLITKAFFINEREGISTRATIONGENERICFILTER_H
20 #define CLITKAFFINEREGISTRATIONGENERICFILTER_H
21
22 // clitk include
23 #include "clitkIO.h"
24 #include "clitkCommon.h"
25 #include "clitkAffineRegistration_ggo.h"
26 #include "clitkImageArithm_ggo.h"
27 #include "clitkCorrelationRatioImageToImageMetric.h"
28 #include "clitkTransformUtilities.h"
29 #include "clitkGenericMetric.h"
30 #include "clitkGenericOptimizer.h"
31 #include "clitkGenericInterpolator.h"
32 #include "clitkGenericAffineTransform.h"
33 #include "clitkImageToImageGenericFilter.h"
34
35
36 //itk include
37 #include <itkMultiResolutionImageRegistrationMethod.h>
38 #include <itkMultiResolutionPyramidImageFilter.h>
39 #include <itkImageToImageMetric.h>
40 #include <itkEuler2DTransform.h>
41 #include <itkCenteredEuler3DTransform.h>
42 #include <itkImage.h>
43 #include <itkResampleImageFilter.h>
44 #include <itkCastImageFilter.h>
45 #include <itkNormalizeImageFilter.h>
46 #include <itkDiscreteGaussianImageFilter.h>
47 #include <itkImageMaskSpatialObject.h>
48 #include <itkCommand.h>
49 #include <itkCheckerBoardImageFilter.h>
50 #include <itkSubtractImageFilter.h>
51 #include <itkLightObject.h>
52 #include <itkImageMomentsCalculator.h>
53 #include <itkThresholdImageFilter.h>
54
55 // other includes
56 #include <time.h>
57 #include <iostream>
58 #include <iomanip>
59
60 namespace clitk
61 {
62
63 //====================================================================
64 class ITK_EXPORT AffineRegistrationGenericFilter:
65     public ImageToImageGenericFilter<AffineRegistrationGenericFilter>
66 {
67 public:
68
69   AffineRegistrationGenericFilter();
70
71   //================================================
72   typedef AffineRegistrationGenericFilter        Self;
73   
74   typedef itk::SmartPointer<Self>        Pointer;
75   typedef itk::SmartPointer<const Self> ConstPointer;
76   typedef ImageToImageGenericFilterBase   Superclass;
77   //================================================
78   itkNewMacro(Self);
79   //itkTypeMacro(AffineRegistrationGenericFilter, LightObject);
80
81
82   //====================================================================
83   // Set methods
84        void SetArgsInfo(const args_info_clitkAffineRegistration & a);
85
86   //====================================================================
87   template<unsigned int Dim>
88   void InitializeImageType();
89
90   bool m_Verbose;
91   args_info_clitkAffineRegistration m_ArgsInfo;
92
93   template<class InputImageType>
94   void UpdateWithInputImageType();
95 };
96 }
97
98 #endif //#define CLITKAFFINEREGISTRATIONGENERICFILTER__H