]> Creatis software - clitk.git/blob - registration/clitkBLUTDIRGenericFilter.h
Derived from ImageToImageGenericFilter for integrating into vv
[clitk.git] / registration / clitkBLUTDIRGenericFilter.h
1 /*=========================================================================
2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
3
4   Authors belong to: 
5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
6   - Léon Bérard cancer center       http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
8
9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
12
13   It is distributed under dual licence
14
15   - BSD        See included LICENSE.txt file
16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
17 ======================================================================-====*/
18 #ifndef clitkBLUTDIRGenericFilter_h
19 #define clitkBLUTDIRGenericFilter_h
20
21 /* =================================================
22  * @file   clitkBLUTDIRGenericFilter.h
23  * @author 
24  * @date   
25  * 
26  * @brief 
27  * 
28  ===================================================*/
29
30
31 // clitk
32 #include "clitkBLUTDIR_ggo.h"
33 #include "clitkIO.h"
34 #include "clitkImageCommon.h"
35 #include "clitkDifferenceImageFilter.h"
36 #include "clitkTransformUtilities.h"
37 #include "clitkLBFGSBOptimizer.h"
38 #include "clitkBSplineDeformableTransform.h"
39 #include "clitkGenericOptimizer.h"
40 #include "clitkGenericInterpolator.h"
41 #include "clitkGenericMetric.h"
42 #include "clitkBSplineDeformableTransformInitializer.h"
43 #include "clitkMultiResolutionPyramidRegionFilter.h"
44 #include "clitkImageToImageGenericFilter.h"
45
46 // itk include
47 #include "itkMultiResolutionImageRegistrationMethod.h"
48 #include "itkMultiResolutionPyramidImageFilter.h"
49 #include "itkImage.h"
50 #include "itkImageFileReader.h"
51 #include "itkImageFileWriter.h"
52 #include "itkResampleImageFilter.h"
53 #include "itkCommand.h"
54 #include "itkImageMaskSpatialObject.h"
55 #include "itkEuler3DTransform.h"
56 #include "itkWarpImageFilter.h"
57 #include "itkLightObject.h"
58 #include "itkImageToImageMetric.h"
59 #include "itkInterpolateImageFunction.h"
60 #include "itkLabelStatisticsImageFilter.h"
61 #include "itkImageDuplicator.h"
62 #include "itkExtractImageFilter.h"
63 #include "itkTransformToDeformationFieldSource.h"
64
65 namespace clitk 
66 {
67
68
69   class ITK_EXPORT BLUTDIRGenericFilter :public ImageToImageGenericFilter<BLUTDIRGenericFilter>
70   {
71   public:
72     //----------------------------------------
73     BLUTDIRGenericFilter();
74     //----------------------------------------
75     typedef BLUTDIRGenericFilter                   Self;
76     typedef itk::SmartPointer<Self>            Pointer;
77     typedef itk::SmartPointer<const Self>      ConstPointer;
78     typedef ImageToImageGenericFilterBase   Superclass;
79    
80     // Method for creation through the object factory
81     itkNewMacro(Self);  
82     
83     void SetArgsInfo(const args_info_clitkBLUTDIR & a);
84
85     // Run-time type information (and related methods)
86     
87     template<unsigned int Dim>
88     void InitializeImageType();
89
90
91     template<class InputImageType>
92     void UpdateWithInputImageType();
93
94     args_info_clitkBLUTDIR m_ArgsInfo;
95     bool m_Verbose;
96     std::string m_ReferenceFileName;
97
98   };
99
100
101 } // end namespace clitk
102
103
104 #endif // #define clitkBLUTDIRGenericFilter_h