registration/clitkBLUTDIRGenericFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef clitkBLUTDIRGenericFilter_h
  19 #define clitkBLUTDIRGenericFilter_h
  20
  21 /* =================================================
  22  * @file   clitkBLUTDIRGenericFilter.h
  23  * @author
  24  * @date
  25  *
  26  * @brief
  27  *
  28  ===================================================*/
  29
  30
  31 // clitk
  32 #include "clitkBLUTDIR_ggo.h"
  33 #include "clitkIO.h"
  34 #include "clitkImageCommon.h"
  35 #include "clitkDifferenceImageFilter.h"
  36 #include "clitkTransformUtilities.h"
  37 #include "clitkLBFGSBOptimizer.h"
  38 #include "clitkMultipleBSplineDeformableTransform.h"
  39 #include "clitkGenericOptimizer.h"
  40 #include "clitkGenericInterpolator.h"
  41 #include "clitkGenericMetric.h"
  42 #include "clitkMultipleBSplineDeformableTransformInitializer.h"
  43 #include "clitkMultiResolutionPyramidRegionFilter.h"
  44 #include "clitkImageToImageGenericFilter.h"
  45
  46 // itk include
  47 #include "itkMultiResolutionImageRegistrationMethod.h"
  48 #include "itkMultiResolutionPyramidImageFilter.h"
  49 #include "itkImage.h"
  50 #include "itkImageFileReader.h"
  51 #include "itkImageFileWriter.h"
  52 #include "itkResampleImageFilter.h"
  53 #include "itkCommand.h"
  54 #include "itkImageMaskSpatialObject.h"
  55 #include "itkEuler3DTransform.h"
  56 #include "itkWarpImageFilter.h"
  57 #include "itkLightObject.h"
  58 #include "itkImageToImageMetric.h"
  59 #include "itkInterpolateImageFunction.h"
  60 #include "itkLabelGeometryImageFilter.h"
  61 #include "itkImageDuplicator.h"
  62 #include "itkExtractImageFilter.h"
  63 #if ITK_VERSION_MAJOR >= 4
  64   #include "itkTransformToDisplacementFieldSource.h"
  65 #else
  66   #include "itkTransformToDeformationFieldSource.h"
  67 #endif
  68
  69 namespace clitk
  70 {
  71
  72   class ITK_EXPORT BLUTDIRGenericFilter :public ImageToImageGenericFilter<BLUTDIRGenericFilter>
  73   {
  74   public:
  75     //----------------------------------------
  76     BLUTDIRGenericFilter();
  77     //----------------------------------------
  78     typedef BLUTDIRGenericFilter                   Self;
  79     typedef itk::SmartPointer<Self>            Pointer;
  80     typedef itk::SmartPointer<const Self>      ConstPointer;
  81     typedef ImageToImageGenericFilterBase   Superclass;
  82
  83     // Method for creation through the object factory
  84     itkNewMacro(Self);
  85
  86     void SetArgsInfo(const args_info_clitkBLUTDIR & a);
  87
  88     // Run-time type information (and related methods)
  89
  90     template<unsigned int Dim>
  91     void InitializeImageType();
  92
  93
  94     template<class InputImageType>
  95     void UpdateWithInputImageType();
  96
  97     args_info_clitkBLUTDIR m_ArgsInfo;
  98     bool m_Verbose;
  99     std::string m_ReferenceFileName;
 100
 101   };
 102
 103 } // end namespace clitk
 104
 105
 106 #endif // #define clitkBLUTDIRGenericFilter_h