registration/clitkList.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ======================================================================-====*/
  18 #ifndef CLITKLIST_H
  19 #define CLITKLIST_H
  20 /**
  21    =================================================
  22    * @file   clitkList.h
  23    * @author Jef Vandemeulebroucke <jef@creatis.insa-lyon.fr>
  24    * @date   30 April 2008
  25    *
  26    * @brief
  27    *
  28    =================================================*/
  29
  30 #include "clitkCommon.h"
  31 #include "clitkIO.h"
  32
  33 // itk include
  34 #include "itkLightObject.h"
  35
  36 using namespace std;
  37
  38 namespace clitk{
  39
  40   template <class ListItemType >
  41   class List: public std::vector<ListItemType >
  42   {
  43
  44   public:
  45     //=====================================================================================
  46     //Typedefs
  47     typedef typename ListItemType::ValueType ValueType;
  48     itkStaticConstMacro(Dimension, unsigned int, ListItemType::Dimension);
  49     typedef List<ListItemType> ListType;
  50     typedef itk::ContinuousIndex<ValueType, Dimension> IndexType;
  51     typedef itk::Image<signed short, Dimension> ImageType;
  52
  53     //=====================================================================================
  54     // IO
  55     void Read(const string& fileName, bool verbose=false);
  56     void ReadAndConvertPointPairs(const string& fileName, List& correspList, const typename ImageType::Pointer referenceImage , bool verbose=false);
  57     bool ReadPointPair(const string& fileName, const unsigned int& pointNumber, IndexType& item1, IndexType& item2, bool& veryUnsure);
  58     void Write(const string fileName, const bool verbose);
  59     void Print();
  60
  61     //=====================================================================================
  62     // Members
  63     List<itk::FixedArray<double, 1> > Norm(void);
  64
  65     //=====================================================================================
  66     //Constructors - Destructors
  67     List(){};
  68     List(const string fileName, bool verbose=false ){Read(fileName, verbose);}
  69     List(unsigned int size) { this->resize(size); };
  70     ~List(){};
  71
  72   protected:
  73
  74
  75   };
  76
  77
  78 } // namespace clitk
  79
  80 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
  81 #include "clitkList.txx"
  82 #endif
  83
  84 #endif
  85