registration/clitkLists.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef clitkLists_h
  19 #define clitkLists_h
  20 /**
  21    =================================================
  22    * @file   clitkLists.h
  23    * @author Jef Vandemeulebroucke <jef@creatis.insa-lyon.fr>
  24    * @date   30 April 2008
  25    *
  26    * @brief
  27    *
  28    =================================================*/
  29
  30 #include "clitkCommon.h"
  31 #include "clitkIO.h"
  32 #include "clitkList.h"
  33
  34 // itk include
  35 #include "itkLightObject.h"
  36
  37 using namespace std;
  38
  39 namespace clitk{
  40
  41   template <class ListItemType >
  42   class Lists: public std::vector<clitk::List<ListItemType> >
  43   {
  44   public:
  45     //=====================================================================================
  46     //Typedefs
  47     typedef typename ListItemType::ValueType ValueType;
  48     itkStaticConstMacro(Dimension, unsigned int, ListItemType::Dimension);
  49     typedef List<ListItemType> ListType;
  50     typedef itk::Image<signed short, Dimension> ImageType;
  51
  52     //=====================================================================================
  53     // IO
  54     void Read(const std::vector<std::string>& fileNames, bool verbose=false);
  55     void ReadAndConvertPointPairs(const std::vector<std::string>& fileNames, ListType& refList, const typename ImageType::Pointer referenceImage , bool verbose=false);
  56     void Write(const std::vector<std::string> fileNames, const bool verbose);
  57     void Print();
  58
  59     //=====================================================================================
  60     // Members
  61     Lists< itk::FixedArray<double,1> > Norm(void);
  62
  63     //=====================================================================================
  64     //Constructors - Destructors
  65     Lists(){};
  66     Lists(unsigned int size){this->resize(size);};
  67     Lists(const std::vector<std::string> fileNames, bool verbose=false ){Read(fileNames, verbose);}
  68     ~Lists(){};
  69
  70
  71   protected:
  72
  73
  74   };
  75
  76
  77 } // namespace clitk
  78
  79 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
  80 #include "clitkLists.txx"
  81 #endif
  82
  83 #endif