scripts/pts_to_landmarks.sh

   1 #! /bin/sh
   2
   3 ###############################################################################
   4 #
   5 # FILE: pts_to_landmarks
   6 # AUTHOR: Vivien Delmon
   7 #
   8 # Conversion from landmarks in the format used in clitkCalculateTRE (.pts)
   9 # to the format used in VV (.txt).
  10 #
  11 ###############################################################################
  12
  13 if [ $# -ne 2 ]; then
  14   echo "Usage: $0 input.pts output.txt" 1>&2
  15 fi
  16
  17 to_append=/tmp/$RANDOM
  18 to_prepend=/tmp/$RANDOM
  19
  20 for i in $(seq 0 $((`cat $1 | wc -l` - 1)));
  21 do
  22   echo 0' '0 >> $to_append
  23   echo $i >> $to_prepend
  24 done
  25
  26 echo "LANDMARKS1" > $2
  27 paste -d ' ' $to_prepend $1 $to_append >> $2