segmentation/clitkExtractAirwaysTreeInfo.ggo

   1 #File clitkExtractAirwaysTreeInfos.ggo
   2 package "clitkExtractAirwaysTreeInfos"
   3 version "1.0"
   4 purpose "From trachea binary image, extract skeleton and carena point."
   5
   6 option "config"         -  "Config file"                  string        no
   7 option "imagetypes"     -  "Display allowed image types"  flag          off
   8 option "verbose"        v  "Verbose"                      flag          off
   9 option "verboseStep"    -  "Verbose each step"            flag          off
  10 option "writeStep"      w  "Write image at each step"     flag          off
  11 option "verboseOption"  -  "Display options values"       flag          off
  12 option "verboseWarningOff" -  "Do not display warning"    flag          off
  13
  14 section "I/O"
  15
  16 option "input"         i        "Input trachea mask image filename"               string  yes
  17 option "afdb"          a        "Output Anatomical Feature DB (Carina position)"  string  no
  18 option "output"        o        "Output skeleton mask image filename"             string  yes
  19
  20 section "Main options"
  21
  22 option "writeSkeleton"    - "Write skeleton"                       flag    off
  23 option "skeletonFilename" - "Skeleton filename"                    string  no