segmentation/clitkExtractLymphStations.ggo

   1 #File clitkExtractLymphStations.ggo
   2 package "clitkExtractLymphStations"
   3 version "1.0"
   4 purpose "Extract LymphStations with help of TODO"
   5
   6 option "config"         -  "Config file"                  string        no
   7 option "imagetypes"     -  "Display allowed image types"  flag          off
   8 option "verbose"        v  "Verbose"                      flag          off
   9 option "verboseStep"    -  "Verbose each step"            flag          off
  10 option "writeStep"      w  "Write image at each step"     flag          off
  11 option "verboseOption"  -  "Display options values"       flag          off
  12 option "verboseWarningOff" -  "Do not display warning"    flag          off
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  14 section "I/O"
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  16 option "mediastinum"   m        "Input mediastinum mask filename" string        yes
  17 option "trachea"       t        "Input trachea mask filename"     string        yes
  18 option "output"        o        "Output lungs mask filename"      string        yes
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  20 option "carenaZposition"                c       "Sup-Inf position of the carena (in mm, with origin)" double no
  21 option "middleLobeBronchusZposition"    b       "Sup-Inf position of the middle lobe bronchus (in mm, with origin)" double no
  22 option "spacing"     -  "Intermediate resampling spacing"         double no default="6"
  23 option "fuzzy1"      -  "Fuzzy relative position threshold"       double no default="0.6"
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