segmentation/clitkExtractLymphStations.ggo

   1 #File clitkExtractLymphStations.ggo
   2 package "clitkExtractLymphStations"
   3 version "1.0"
   4 purpose "Extract LymphStations with help of TODO"
   5
   6 option "config"         -  "Config file"                  string        no
   7 option "imagetypes"     -  "Display allowed image types"  flag          off
   8 option "verbose"        v  "Verbose"                      flag          off
   9 option "verboseStep"    -  "Verbose each step"            flag          off
  10 option "writeStep"      w  "Write image at each step"     flag          off
  11 option "verboseOption"  -  "Display options values"       flag          off
  12 option "verboseWarningOff" -  "Do not display warning"    flag          off
  13 option "verboseMemory"  -  "Display memory usage"         flag          off
  14
  15 section "I/O"
  16
  17 option "afdb"          a        "Input Anatomical Feature DB"     string        no
  18 option "input"         i        "Input filename"                  string        no
  19 option "output"        o        "Output lungs mask filename"      string        no
  20
  21 section "Options for Station 8"
  22 option "maxAntSpine" - "Distance max to anterior part of the spine in mm"  double no default="10"
  23 option "esophagusDilatationForAnt" - "Dilatation of esophagus, in mm, for 'anterior' limits (default=15,2,1)" double no multiple
  24 option "esophagusDilatationForRight" - "Dilatation of esophagus, in mm, for 'right' limits (default=5,10,1)" double no multiple
  25 option "fuzzyThresholdForS8" - "Threshold for 'Post' to dilated Esophagus" double default="0.5" no
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