segmentation/clitkFilterWithAnatomicalFeatureDatabaseManagement.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17   ===========================================================================**/
  18
  19 #ifndef CLITKFILTERWITHANATOMICALFEATUREDATABASEMANAGEMENT_H
  20 #define CLITKFILTERWITHANATOMICALFEATUREDATABASEMANAGEMENT_H
  21
  22 // clitk
  23 #include "clitkAnatomicalFeatureDatabase.h"
  24 #include "clitkFilterBase.h"
  25
  26 namespace clitk {
  27
  28   //--------------------------------------------------------------------
  29   /*
  30     - Convenient class to add AFDB capabilities to a filter
  31     - "virtual" inheritance is needed to avoir ambiguous inherited
  32     functions
  33   */
  34   //--------------------------------------------------------------------
  35   class FilterWithAnatomicalFeatureDatabaseManagement: public virtual FilterBase
  36   {
  37   public:
  38     // Standard class typedefs
  39     typedef FilterWithAnatomicalFeatureDatabaseManagement Self;
  40
  41     // Run-time type information (and related methods)
  42     itkTypeMacro(FilterWithAnatomicalFeatureDatabaseManagement, Object);
  43
  44     itkSetMacro(AFDBFilename, std::string);
  45     itkGetConstMacro(AFDBFilename, std::string);
  46
  47     itkSetMacro(AFDBPath, std::string);
  48     itkGetConstMacro(AFDBPath, std::string);
  49
  50     itkGetConstMacro(DisplayUsedStructuresOnlyFlag, bool);
  51     itkSetMacro(DisplayUsedStructuresOnlyFlag, bool);
  52     itkBooleanMacro(DisplayUsedStructuresOnlyFlag);
  53
  54     void WriteAFDB();
  55     void LoadAFDB();
  56
  57     AnatomicalFeatureDatabase::Pointer GetAFDB();
  58     void SetAFDB(AnatomicalFeatureDatabase * a) { m_AFDB = a; }
  59
  60   protected:
  61     FilterWithAnatomicalFeatureDatabaseManagement();
  62     virtual ~FilterWithAnatomicalFeatureDatabaseManagement() {}
  63
  64     std::string m_AFDBFilename;
  65     std::string m_AFDBPath;
  66     clitk::AnatomicalFeatureDatabase::Pointer m_AFDB;
  67
  68     // For debug: display used structures but do not perform
  69     // segmentation
  70     bool m_DisplayUsedStructuresOnlyFlag;
  71     void AddUsedStructures(std::string station, std::string structure);
  72
  73   private:
  74     FilterWithAnatomicalFeatureDatabaseManagement(const Self&); //purposely not implemented
  75     void operator=(const Self&); //purposely not implemented
  76
  77   }; // end class
  78   //--------------------------------------------------------------------
  79
  80 } // end namespace clitk
  81 //--------------------------------------------------------------------
  82
  83 #endif // CLITKFILTERWITHANATOMICALFEATUREDATABASEMANAGEMENT_H