segmentation/clitkLevelSetSegmentationGenericFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef clitkLevelSetSegmentationGenericFilter_h
  19 #define clitkLevelSetSegmentationGenericFilter_h
  20
  21 /* =================================================
  22  * @file   clitkLevelSetSegmentationGenericFilter.h
  23  * @author Jef Vandemeulebroucke <jef@creatis.insa-lyon.fr>
  24  * @date
  25  *
  26  * @brief
  27  *
  28  ===================================================*/
  29
  30
  31 // clitk include
  32 #include "clitkIO.h"
  33 #include "clitkCommon.h"
  34 #include "clitkImageCommon.h"
  35 #include "clitkLevelSetSegmentation_ggo.h"
  36
  37 //itk include
  38 #include "itkLightObject.h"
  39 #include "itkGeodesicActiveContourLevelSetImageFilter.h"
  40 #include "itkBinaryThresholdImageFilter.h"
  41 #include "itkCurvatureAnisotropicDiffusionImageFilter.h"
  42 #include "itkGradientMagnitudeRecursiveGaussianImageFilter.h"
  43 #include "itkGradientMagnitudeImageFilter.h"
  44 #include "itkSigmoidImageFilter.h"
  45
  46 namespace clitk
  47 {
  48
  49
  50   class ITK_EXPORT LevelSetSegmentationGenericFilter : public itk::LightObject
  51   {
  52   public:
  53     //----------------------------------------
  54     // ITK
  55     //----------------------------------------
  56     typedef LevelSetSegmentationGenericFilter                   Self;
  57     typedef itk::LightObject                   Superclass;
  58     typedef itk::SmartPointer<Self>            Pointer;
  59     typedef itk::SmartPointer<const Self>      ConstPointer;
  60
  61     // Method for creation through the object factory
  62     itkNewMacro(Self);
  63
  64     // Run-time type information (and related methods)
  65     itkTypeMacro( LevelSetSegmentationGenericFilter, LightObject );
  66
  67
  68     //----------------------------------------
  69     // Typedefs
  70     //----------------------------------------
  71
  72
  73     //----------------------------------------
  74     // Set & Get
  75     //----------------------------------------
  76     void SetArgsInfo(args_info_clitkLevelSetSegmentation a)
  77     {
  78       m_ArgsInfo=a;
  79       m_Verbose=m_ArgsInfo.verbose_flag;
  80     }
  81
  82     //----------------------------------------
  83     // Update
  84     //----------------------------------------
  85     void Update();
  86
  87   protected:
  88
  89     //----------------------------------------
  90     // Constructor & Destructor
  91     //----------------------------------------
  92     LevelSetSegmentationGenericFilter();
  93     ~LevelSetSegmentationGenericFilter() {};
  94
  95
  96     //----------------------------------------
  97     // Templated members
  98     //----------------------------------------
  99     template <unsigned int Dimension>  void UpdateWithDim(std::string PixelType);
 100     template <unsigned int Dimension, class PixelType>  void UpdateWithDimAndPixelType();
 101
 102
 103     //----------------------------------------
 104     // Data members
 105     //----------------------------------------
 106     bool m_Verbose;
 107     args_info_clitkLevelSetSegmentation m_ArgsInfo;
 108   };
 109
 110
 111 } // end namespace clitk
 112
 113 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
 114 #include "clitkLevelSetSegmentationGenericFilter.txx"
 115 #endif
 116
 117 #endif // #define clitkLevelSetSegmentationGenericFilter_h