segmentation/clitkMorphoMath.ggo

   1 #File clitkMorphoMath.ggo
   2 #Author: Jef Vandemeulebroucke <jefvdmb@gmail.com>
   3 #Date : Tue 28 April 2009 16.35
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   5 package "clitk"
   6 version "Perform standard morphological operations"
   7
   8 option "config"     - "Config file"   string  no
   9 option "verbose"    v "Verbose"      flag    off
  10 option "imagetypes" - "Display allowed image types"     flag          off
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  12 section "Input"
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  14 option "input"  i "Input grid filename"  string yes
  15 option "output" o "Output grid filename" string yes
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  17
  18 section "Processing Parameters"
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  20 option "type"   t "0=Erode, 1=Dilate, 2=Close (erode(dilate(x))), 3=Open (dilate(erode(x))), 4=CondErode, 5=CondDilate" int     no      default="0"
  21 option "fg"             -       "Foreground value"                                                              float           no      default="1"
  22 option "bg"             -       "Background value (0,1,3: filling value)"                                       float           no      default="0"
  23 option "bound"          b       "0-1: Set borders to foreground/ 2:safe borders "                               flag            off
  24 option "radius"         r       "Use binary ball element with given radius"                                     int             no      multiple        default="1"
  25 option "radiusInMM"     m       "Use binary ball element with given radius in mm (rounded to nearest voxel value), you can give one radius by dimension" double         no      multiple        default="1"
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  27 option "extend" - "Extend the image size according to radius"     flag          off
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