segmentation/clitkMorphoReconstructionGenericFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef clitkMorphoReconstructionGenericFilter_h
  19 #define clitkMorphoReconstructionGenericFilter_h
  20
  21 /* =================================================
  22  * @file   clitkMorphoReconstructionGenericFilter.h
  23  * @author
  24  * @date
  25  *
  26  * @brief
  27  *
  28  ===================================================*/
  29
  30
  31 // clitk include
  32 #include "clitkIO.h"
  33 #include "clitkCommon.h"
  34 #include "clitkImageCommon.h"
  35 #include "clitkMorphoReconstruction_ggo.h"
  36
  37 //itk include
  38 #include "itkLightObject.h"
  39 #include "itkReconstructionByDilationImageFilter.h"
  40 #include "itkReconstructionByErosionImageFilter.h"
  41 #include "itkClosingByReconstructionImageFilter.h"
  42 #include "itkOpeningByReconstructionImageFilter.h"
  43 #include "itkBinaryBallStructuringElement.h"
  44
  45
  46 namespace clitk
  47 {
  48
  49
  50   class ITK_EXPORT MorphoReconstructionGenericFilter : public itk::LightObject
  51   {
  52   public:
  53     //----------------------------------------
  54     // ITK
  55     //----------------------------------------
  56     typedef MorphoReconstructionGenericFilter                   Self;
  57     typedef itk::LightObject                   Superclass;
  58     typedef itk::SmartPointer<Self>            Pointer;
  59     typedef itk::SmartPointer<const Self>      ConstPointer;
  60
  61     // Method for creation through the object factory
  62     itkNewMacro(Self);
  63
  64     // Run-time type information (and related methods)
  65     itkTypeMacro( MorphoReconstructionGenericFilter, LightObject );
  66
  67
  68     //----------------------------------------
  69     // Typedefs
  70     //----------------------------------------
  71
  72
  73     //----------------------------------------
  74     // Set & Get
  75     //----------------------------------------
  76     void SetArgsInfo(const args_info_clitkMorphoReconstruction & a)
  77     {
  78       m_ArgsInfo=a;
  79       m_Verbose=m_ArgsInfo.verbose_flag;
  80       m_InputFileName=m_ArgsInfo.input_arg;
  81     }
  82
  83
  84     //----------------------------------------
  85     // Update
  86     //----------------------------------------
  87     void Update();
  88
  89   protected:
  90
  91     //----------------------------------------
  92     // Constructor & Destructor
  93     //----------------------------------------
  94     MorphoReconstructionGenericFilter();
  95     ~MorphoReconstructionGenericFilter() {};
  96
  97
  98     //----------------------------------------
  99     // Templated members
 100     //----------------------------------------
 101     template <unsigned int Dimension>  void UpdateWithDim(std::string PixelType);
 102     template <unsigned int Dimension, class PixelType>  void UpdateWithDimAndPixelType();
 103
 104
 105     //----------------------------------------
 106     // Data members
 107     //----------------------------------------
 108     args_info_clitkMorphoReconstruction m_ArgsInfo;
 109     bool m_Verbose;
 110     std::string m_InputFileName;
 111
 112   };
 113
 114
 115 } // end namespace clitk
 116
 117 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
 118 #include "clitkMorphoReconstructionGenericFilter.txx"
 119 #endif
 120
 121 #endif // #define clitkMorphoReconstructionGenericFilter_h