src/gdcmBinEntry.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmBinEntry.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/01/16 04:50:41 $
   7   Version:   $Revision: 1.53 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmBinEntry.h"
  20 #include "gdcmDebug.h"
  21
  22 #include <fstream>
  23 #include <sstream>
  24 #include <iostream> // for std::ios_base, since <ios> does not exist on gcc/Solaris
  25
  26 namespace gdcm
  27 {
  28
  29 //-----------------------------------------------------------------------------
  30 // Constructor / Destructor
  31
  32 /**
  33  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  34  */
  35 BinEntry::BinEntry(DictEntry *e) : ValEntry(e)
  36 {
  37    BinArea = 0;
  38    SelfArea = true;
  39 }
  40
  41 /**
  42  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  43  * @param   e Pointer to existing Doc entry
  44  */
  45 BinEntry::BinEntry(DocEntry *e) : ValEntry(e->GetDictEntry())
  46 {
  47    Copy(e);
  48 /*   Length     = e->GetLength();
  49    ReadLength = e->GetReadLength();
  50    ImplicitVR = e->IsImplicitVR();
  51    Offset     = e->GetOffset();*/
  52
  53    //FIXME
  54    //SQDepthLevel = e->GetDepthLevel();
  55
  56    BinArea = 0; // let's be carefull !
  57    SelfArea = true;
  58 }
  59
  60 /**
  61  * \brief   Canonical destructor.
  62  */
  63 BinEntry::~BinEntry()
  64 {
  65    if (BinArea && SelfArea)
  66    {
  67       delete[] BinArea;
  68       BinArea = 0; // let's be carefull !
  69    }
  70 }
  71
  72
  73 //-----------------------------------------------------------------------------
  74 // Print
  75 /*
  76  * \brief   canonical Printer
  77  */
  78
  79 void BinEntry::Print(std::ostream &os, std::string const & )
  80 {
  81    os << "B ";
  82    DocEntry::Print(os);
  83    std::ostringstream s;
  84    void* binArea = GetBinArea();
  85    if (binArea)
  86    {
  87       //s << " [" << GDCM_BINLOADED
  88       s << " [" << GetValue()
  89         << "; length = " << GetLength() << "]";
  90    }
  91    else
  92    {
  93       if ( GetLength() == 0 )
  94       {
  95          s << " []";
  96       }
  97       else
  98       {
  99          //s << " [gdcm::Binary data NOT loaded]";
 100          s << " [" <<GetValue() << "]";
 101       }
 102
 103    }
 104    os << s.str();
 105 }
 106
 107 /*
 108  * \brief   canonical Writer
 109  * @param fp already open file pointer
 110  * @param filetype type of the file to be written
 111 */
 112 void BinEntry::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype)
 113 {
 114 #define BUFFER_SIZE 4096
 115    DocEntry::WriteContent(fp, filetype);
 116    void* binArea = GetBinArea();
 117    int lgr = GetLength();
 118    if (binArea) // the binArea was *actually* loaded
 119    {
 120
 121    // TODO FIME
 122    // Probabely, the same operation will have to be done when we want
 123    // to write image with Big Endian Transfert Syntax,
 124    //   and we are working onj Little Endian Processor
 125
 126 #ifdef GDCM_WORDS_BIGENDIAN
 127       // Be carefull with *any* 16 bits words 'binEntries !'
 128       // if ( GetVR() == "OW") // to be used later
 129
 130       // TODO FIXME Right now, we only care of Pixels element
 131
 132       // 8 Bits Pixels *are* OB, 16 Bits Pixels *are* OW
 133       // -value forced while Reading process-
 134       if (GetGroup() == 0x7fe0 && GetVR() == "OW")
 135       {
 136          uint16_t *currPosition = (uint16_t *)binArea;
 137
 138          // TODO FIXME : Maybe we should allocate somewhere a static buffer,
 139          // in order not to have to alloc/delete for almost every BinEntry ...
 140          uint16_t *buffer = new uint16_t[BUFFER_SIZE];
 141
 142          // how many BUFFER_SIZE long pieces in binArea ?
 143          int nbPieces = lgr/BUFFER_SIZE/2; //(16 bits = 2 Bytes)
 144          uint16_t *binArea16 = (uint16_t*)binArea;
 145          for (int j=0;j<nbPieces;j++)
 146          {
 147             for (int i = 0; i < BUFFER_SIZE/2; i++)
 148             {
 149                buffer[i] =  (binArea16[i] >> 8) | (binArea16[i] << 8);
 150             }
 151             fp->write ( (char*)currPosition, BUFFER_SIZE );
 152             currPosition += BUFFER_SIZE/2;
 153          }
 154          int remainingSize = lgr%BUFFER_SIZE;
 155          if ( remainingSize != 0)
 156          {
 157             fp->write ( (char*)currPosition, remainingSize );
 158          }
 159          delete[] buffer;
 160       }
 161       else
 162       {
 163          // For any other VR, BinEntry is re-written as-is
 164          fp->write ( (char*)binArea, lgr );
 165       }
 166 #else
 167       fp->write ( (char*)binArea, lgr ); // Elem value
 168 #endif //GDCM_WORDS_BIGENDIAN
 169
 170    }
 171    else
 172    {
 173       // nothing was loaded, but we need to skip space on disc
 174       fp->seekp(lgr, std::ios::cur);
 175    }
 176 }
 177 //-----------------------------------------------------------------------------
 178 // Public
 179
 180
 181 /// \brief Sets the value (non string) of the current Dicom Header Entry
 182 void BinEntry::SetBinArea( uint8_t *area, bool self )
 183 {
 184    if (BinArea && SelfArea)
 185       delete[] BinArea;
 186
 187    BinArea = area;
 188    SelfArea=self;
 189 }
 190
 191 //-----------------------------------------------------------------------------
 192 // Protected
 193
 194 //-----------------------------------------------------------------------------
 195 // Private
 196
 197 //-----------------------------------------------------------------------------
 198 } // end namespace gdcm