src/gdcmBinEntry.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmBinEntry.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/01/24 16:10:52 $
   7   Version:   $Revision: 1.56 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmBinEntry.h"
  20 #include "gdcmDebug.h"
  21
  22 #include <fstream>
  23 #include <sstream>
  24 #include <iostream> // for std::ios_base, since <ios> does not exist on gcc/Solaris
  25
  26 namespace gdcm
  27 {
  28
  29 //-----------------------------------------------------------------------------
  30 // Constructor / Destructor
  31
  32 /**
  33  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  34  */
  35 BinEntry::BinEntry(DictEntry *e) : ValEntry(e)
  36 {
  37    BinArea = 0;
  38    SelfArea = true;
  39 }
  40
  41 /**
  42  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  43  * @param   e Pointer to existing Doc entry
  44  */
  45 BinEntry::BinEntry(DocEntry *e) : ValEntry(e->GetDictEntry())
  46 {
  47    Copy(e);
  48
  49    BinArea = 0; // let's be carefull !
  50    SelfArea = true;
  51 }
  52
  53 /**
  54  * \brief   Canonical destructor.
  55  */
  56 BinEntry::~BinEntry()
  57 {
  58    if (BinArea && SelfArea)
  59    {
  60       delete[] BinArea;
  61       BinArea = 0; // let's be carefull !
  62    }
  63 }
  64
  65
  66 //-----------------------------------------------------------------------------
  67 // Print
  68 /**
  69  * \brief   Prints a BinEntry (Dicom entry)
  70  * @param   os ostream we want to print in
  71  * @param indent Indentation string to be prepended during printing
  72  */
  73 void BinEntry::Print(std::ostream &os, std::string const & )
  74 {
  75    os << "B ";
  76    DocEntry::Print(os);
  77    std::ostringstream s;
  78    void* binArea = GetBinArea();
  79    if (binArea)
  80    {
  81       //s << " [" << GDCM_BINLOADED
  82       s << " [" << GetValue()
  83         << "; length = " << GetLength() << "]";
  84    }
  85    else
  86    {
  87       if ( GetLength() == 0 )
  88       {
  89          s << " []";
  90       }
  91       else
  92       {
  93          //s << " [gdcm::Binary data NOT loaded]";
  94          s << " [" <<GetValue() << "]";
  95       }
  96    }
  97    os << s.str();
  98 }
  99
 100 /*
 101  * \brief   canonical Writer
 102  * @param fp already open file pointer
 103  * @param filetype type of the file (ACR, ImplicitVR, ExplicitVR, ...)
 104 */
 105 void BinEntry::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype)
 106 {
 107 #define BUFFER_SIZE 4096
 108    DocEntry::WriteContent(fp, filetype);
 109    void* binArea = GetBinArea();
 110    int lgr = GetLength();
 111    if (binArea) // the binArea was *actually* loaded
 112    {
 113
 114    // TODO FIME
 115    // Probabely, the same operation will have to be done when we want
 116    // to write image with Big Endian Transfert Syntax,
 117    //   and we are working on Little Endian Processor
 118
 119 #ifdef GDCM_WORDS_BIGENDIAN
 120       // Be carefull with *any* 16 bits words 'binEntries !'
 121       // if ( GetVR() == "OW") // to be used later
 122
 123       // TODO FIXME Right now, we only care of Pixels element
 124
 125       // 8 Bits Pixels *are* OB, 16 Bits Pixels *are* OW
 126       // -value forced while Reading process-
 127       if (GetGroup() == 0x7fe0 && GetVR() == "OW")
 128       {
 129          uint16_t *currPosition = (uint16_t *)binArea;
 130
 131          // TODO FIXME : Maybe we should allocate somewhere a static buffer,
 132          // in order not to have to alloc/delete for almost every BinEntry ...
 133          uint16_t *buffer = new uint16_t[BUFFER_SIZE];
 134
 135          // how many BUFFER_SIZE long pieces in binArea ?
 136          int nbPieces = lgr/BUFFER_SIZE/2; //(16 bits = 2 Bytes)
 137          uint16_t *binArea16 = (uint16_t*)binArea;
 138          for (int j=0;j<nbPieces;j++)
 139          {
 140             for (int i = 0; i < BUFFER_SIZE/2; i++)
 141             {
 142                buffer[i] =  (binArea16[i] >> 8) | (binArea16[i] << 8);
 143             }
 144             fp->write ( (char*)currPosition, BUFFER_SIZE );
 145             currPosition += BUFFER_SIZE/2;
 146          }
 147          int remainingSize = lgr%BUFFER_SIZE;
 148          if ( remainingSize != 0)
 149          {
 150             fp->write ( (char*)currPosition, remainingSize );
 151          }
 152          delete[] buffer;
 153       }
 154       else
 155       {
 156          // For any other VR, BinEntry is re-written as-is
 157          fp->write ( (char*)binArea, lgr );
 158       }
 159 #else
 160       fp->write ( (char*)binArea, lgr ); // Elem value
 161 #endif //GDCM_WORDS_BIGENDIAN
 162
 163    }
 164    else
 165    {
 166       // nothing was loaded, but we need to skip space on disc
 167       fp->seekp(lgr, std::ios::cur);
 168    }
 169 }
 170 //-----------------------------------------------------------------------------
 171 // Public
 172
 173
 174 /// \brief Sets the value (non string) of the current Dicom Header Entry
 175 void BinEntry::SetBinArea( uint8_t *area, bool self )
 176 {
 177    if (BinArea && SelfArea)
 178       delete[] BinArea;
 179
 180    BinArea = area;
 181    SelfArea=self;
 182 }
 183
 184 //-----------------------------------------------------------------------------
 185 // Protected
 186
 187 //-----------------------------------------------------------------------------
 188 // Private
 189
 190 //-----------------------------------------------------------------------------
 191 } // end namespace gdcm