src/gdcmBinEntry.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmBinEntry.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/10/11 14:48:19 $
   7   Version:   $Revision: 1.80 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmBinEntry.h"
  20 #include "gdcmContentEntry.h"
  21 #include "gdcmUtil.h"
  22
  23 #include <fstream>
  24 #include <sstream>
  25 #include <iostream> // for std::ios_base, since <ios> does not exist on gcc/Solaris
  26
  27 namespace gdcm
  28 {
  29 //-----------------------------------------------------------------------------
  30 // Constructor / Destructor
  31 /**
  32  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  33  */
  34 BinEntry::BinEntry(DictEntry *e)
  35          :ContentEntry(e)
  36 {
  37    BinArea = 0;
  38    SelfArea = true;
  39 }
  40
  41 /**
  42  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  43  * @param   e Pointer to existing Doc entry
  44  */
  45 BinEntry::BinEntry(DocEntry *e)
  46         : ContentEntry(e->GetDictEntry())
  47 {
  48    Copy(e);
  49
  50    BinArea = 0;
  51    SelfArea = true;
  52 }
  53
  54 /**
  55  * \brief   Canonical destructor.
  56  */
  57 BinEntry::~BinEntry()
  58 {
  59    if (BinArea && SelfArea)
  60    {
  61       delete[] BinArea;
  62       BinArea = 0; // let's be carefull !
  63    }
  64 }
  65
  66 //-----------------------------------------------------------------------------
  67 // Public
  68 /**
  69  * \brief   canonical Writer
  70  * @param fp already open file pointer
  71  * @param filetype type of the file (ACR, ImplicitVR, ExplicitVR, ...)
  72 */
  73 void BinEntry::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype)
  74 {
  75    DocEntry::WriteContent(fp, filetype);
  76    uint8_t *binArea8 = BinArea; //safe notation
  77    size_t lgr = GetLength();
  78    if (BinArea) // the binArea was *actually* loaded
  79    {
  80
  81    //  The same operation should be done if we wanted
  82    //  to write image with Big Endian Transfer Syntax,
  83    //  while working on Little Endian Processor
  84    // --> forget Big Endian Transfer Syntax writting!
  85    //     Next DICOM version will give it up ...
  86
  87    // -->
  88    // --> FIXME
  89    // -->
  90    // The stuff looks nice, but it's probably bugged,
  91    // since troubles occur on big endian processors (SunSparc, Motorola)
  92    // while reading the pixels of a
  93    // gdcm-written Little-Endian 16 bits per pixel image
  94
  95 #if defined(GDCM_WORDS_BIGENDIAN) || defined(GDCM_FORCE_BIGENDIAN_EMULATION)
  96
  97       /// \todo FIXME : Right now, we only care of Pixels element
  98       ///       we should deal with *all* the BinEntries
  99       ///       Well, not really since we are not interpreting values read...
 100
 101       // 8 Bits Pixels *are* OB, 16 Bits Pixels *are* OW
 102       // -value forced while Reading process-
 103
 104       //-->
 105       // -->
 106       // -->  WARNING
 107       // -->        the following lines *looked* very clever,
 108       // -->        but they don't work on big endian processors.
 109       // -->        since I've no access for the moment to a big endian proc :-(
 110       // -->        I comment them out, to see the result on the dash board
 111       // -->
 112
 113       // --> Revert to initial code : TestWriteSimple hangs on Darwin :-(
 114       if (GetGroup() == 0x7fe0 && GetVR() == "OW")
 115       {
 116          uint16_t *binArea16 = (uint16_t*)binArea8;
 117          binary_write (*fp, binArea16, lgr );
 118       }
 119       else
 120       {
 121          // For any other VR, BinEntry is re-written as-is
 122          binary_write (*fp, binArea8, lgr );
 123       }
 124
 125       //-->
 126       // -->
 127       // -->  WARNING
 128       // -->         remove the following line, an uncomment the previous ones,
 129       // -->         if it doesn't work better
 130       // -->
 131       /*binary_write ( *fp, binArea8, lgr ); // Elem value*/
 132
 133 #else
 134       binary_write ( *fp, binArea8, lgr ); // Elem value
 135 #endif //GDCM_WORDS_BIGENDIAN
 136
 137    }
 138    else
 139    {
 140       // nothing was loaded, but we need to skip space on disc
 141
 142       //  --> WARNING : nothing is written;
 143       //  --> the initial data (on the the source image) is lost
 144       //  --> user is *not* informed !
 145
 146       fp->seekp(lgr, std::ios::cur);
 147    }
 148 }
 149
 150 /**
 151  * \brief Sets the value (non string) of the current Dicom Header Entry
 152  */
 153 void BinEntry::SetBinArea( uint8_t *area, bool self )
 154 {
 155    if (BinArea && SelfArea)
 156       delete[] BinArea;
 157
 158    BinArea = area;
 159    SelfArea=self;
 160 }
 161
 162 //-----------------------------------------------------------------------------
 163 // Protected
 164
 165 //-----------------------------------------------------------------------------
 166 // Private
 167
 168 //-----------------------------------------------------------------------------
 169 // Print
 170 /**
 171  * \brief   Prints a BinEntry (Dicom entry)
 172  * @param   os ostream we want to print in
 173  * @param indent Indentation string to be prepended during printing
 174  */
 175 void BinEntry::Print(std::ostream &os, std::string const & )
 176 {
 177    os << "B ";
 178    DocEntry::Print(os);
 179    std::ostringstream s;
 180    void* binArea = GetBinArea();
 181    if (binArea)
 182    {
 183       if ( GetVR() == "FL" )
 184       {
 185          int l = GetReadLength()/4 - 1;
 186          float *beg = (float *)GetBinArea();
 187          s << " [" << *beg;
 188          if ( l!= 0)
 189             for (int i=0;i<l;i++)
 190             {
 191                beg++;
 192                s << "\\" << *beg;
 193             }
 194             s << "]";
 195       }
 196       else if ( GetVR() == "FD" )
 197       {
 198          int l = GetReadLength()/8 - 1;
 199          double *beg = (double *)GetBinArea();
 200          s << " [" << *beg;
 201          if ( l!= 0)
 202             for (int i=0;i<l;i++)
 203             {
 204                beg++;
 205                s << "\\" << *beg;
 206             }
 207             s << "]";
 208       }
 209       else
 210       {
 211          if ( Util::IsCleanArea( GetBinArea(),GetLength()  ) )
 212          {
 213             std::string cleanString =
 214                    Util::CreateCleanString( GetBinArea(),GetLength()  );
 215             s << " [" << cleanString << "]";
 216          }
 217          else
 218          {
 219             //s << " [" << GetValue()
 220             s << " [" << GDCM_BINLOADED << ";"
 221               << "length = " << GetLength() << "]";
 222          }
 223       }
 224    }
 225    else
 226    {
 227       if ( GetLength() == 0 )
 228       {
 229          s << " []";
 230       }
 231       else
 232       {
 233          s << " [" <<GetValue() << "]";
 234       }
 235    }
 236    os << s.str();
 237 }
 238
 239 //-----------------------------------------------------------------------------
 240 } // end namespace gdcm