src/gdcmBinEntry.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmBinEntry.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/02/01 10:29:54 $
   7   Version:   $Revision: 1.60 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmBinEntry.h"
  20 #include "gdcmContentEntry.h"
  21
  22 #include "gdcmDebug.h"
  23
  24 #include <fstream>
  25 #include <sstream>
  26 #include <iostream> // for std::ios_base, since <ios> does not exist on gcc/Solaris
  27
  28 namespace gdcm
  29 {
  30 //-----------------------------------------------------------------------------
  31 // Constructor / Destructor
  32 /**
  33  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  34  */
  35 BinEntry::BinEntry(DictEntry *e) : ContentEntry(e)
  36 {
  37    BinArea = 0;
  38    SelfArea = true;
  39 }
  40
  41 /**
  42  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  43  * @param   e Pointer to existing Doc entry
  44  */
  45 BinEntry::BinEntry(DocEntry *e) : ContentEntry(e->GetDictEntry())
  46 {
  47    Copy(e);
  48
  49    BinArea = 0; // let's be carefull !
  50    SelfArea = true;
  51 }
  52
  53 /**
  54  * \brief   Canonical destructor.
  55  */
  56 BinEntry::~BinEntry()
  57 {
  58    if (BinArea && SelfArea)
  59    {
  60       delete[] BinArea;
  61       BinArea = 0; // let's be carefull !
  62    }
  63 }
  64
  65 //-----------------------------------------------------------------------------
  66 // Public
  67 /**
  68  * \brief   canonical Writer
  69  * @param fp already open file pointer
  70  * @param filetype type of the file (ACR, ImplicitVR, ExplicitVR, ...)
  71 */
  72 void BinEntry::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype)
  73 {
  74 #define BUFFER_SIZE 4096
  75    DocEntry::WriteContent(fp, filetype);
  76    void* binArea = GetBinArea();
  77    int lgr = GetLength();
  78    if (binArea) // the binArea was *actually* loaded
  79    {
  80
  81    // TODO FIME
  82    // Probabely, the same operation will have to be done when we want
  83    // to write image with Big Endian Transfert Syntax,
  84    //   and we are working on Little Endian Processor
  85
  86 #ifdef GDCM_WORDS_BIGENDIAN
  87       // Be carefull with *any* 16 bits words 'binEntries !'
  88       // if ( GetVR() == "OW") // to be used later
  89
  90       // TODO FIXME Right now, we only care of Pixels element
  91
  92       // 8 Bits Pixels *are* OB, 16 Bits Pixels *are* OW
  93       // -value forced while Reading process-
  94       if (GetGroup() == 0x7fe0 && GetVR() == "OW")
  95       {
  96          uint16_t *currPosition = (uint16_t *)binArea;
  97
  98          // TODO FIXME : Maybe we should allocate somewhere a static buffer,
  99          // in order not to have to alloc/delete for almost every BinEntry ...
 100          uint16_t *buffer = new uint16_t[BUFFER_SIZE];
 101
 102          // how many BUFFER_SIZE long pieces in binArea ?
 103          int nbPieces = lgr/BUFFER_SIZE/2; //(16 bits = 2 Bytes)
 104          uint16_t *binArea16 = (uint16_t*)binArea;
 105          for (int j=0;j<nbPieces;j++)
 106          {
 107             for (int i = 0; i < BUFFER_SIZE/2; i++)
 108             {
 109                buffer[i] =  (binArea16[i] >> 8) | (binArea16[i] << 8);
 110             }
 111             fp->write ( (char*)currPosition, BUFFER_SIZE );
 112             currPosition += BUFFER_SIZE/2;
 113          }
 114          int remainingSize = lgr%BUFFER_SIZE;
 115          if ( remainingSize != 0)
 116          {
 117             fp->write ( (char*)currPosition, remainingSize );
 118          }
 119          delete[] buffer;
 120       }
 121       else
 122       {
 123          // For any other VR, BinEntry is re-written as-is
 124          fp->write ( (char*)binArea, lgr );
 125       }
 126 #else
 127       fp->write ( (char*)binArea, lgr ); // Elem value
 128 #endif //GDCM_WORDS_BIGENDIAN
 129
 130    }
 131    else
 132    {
 133       // nothing was loaded, but we need to skip space on disc
 134       fp->seekp(lgr, std::ios::cur);
 135    }
 136 }
 137
 138 /**
 139  * \brief Sets the value (non string) of the current Dicom Header Entry
 140  */
 141 void BinEntry::SetBinArea( uint8_t *area, bool self )
 142 {
 143    if (BinArea && SelfArea)
 144       delete[] BinArea;
 145
 146    BinArea = area;
 147    SelfArea=self;
 148 }
 149
 150 //-----------------------------------------------------------------------------
 151 // Protected
 152
 153 //-----------------------------------------------------------------------------
 154 // Private
 155
 156 //-----------------------------------------------------------------------------
 157 // Print
 158 /**
 159  * \brief   Prints a BinEntry (Dicom entry)
 160  * @param   os ostream we want to print in
 161  * @param indent Indentation string to be prepended during printing
 162  */
 163 void BinEntry::Print(std::ostream &os, std::string const & )
 164 {
 165    os << "B ";
 166    DocEntry::Print(os);
 167    std::ostringstream s;
 168    void* binArea = GetBinArea();
 169    if (binArea)
 170    {
 171       //s << " [" << GDCM_BINLOADED
 172       s << " [" << GetValue()
 173         << "; length = " << GetLength() << "]";
 174    }
 175    else
 176    {
 177       if ( GetLength() == 0 )
 178       {
 179          s << " []";
 180       }
 181       else
 182       {
 183          //s << " [gdcm::Binary data NOT loaded]";
 184          s << " [" <<GetValue() << "]";
 185       }
 186    }
 187    os << s.str();
 188 }
 189
 190 //-----------------------------------------------------------------------------
 191 } // end namespace gdcm