src/gdcmBinEntry.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmBinEntry.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/01/19 15:58:00 $
   7   Version:   $Revision: 1.54 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmBinEntry.h"
  20 #include "gdcmDebug.h"
  21
  22 #include <fstream>
  23 #include <sstream>
  24 #include <iostream> // for std::ios_base, since <ios> does not exist on gcc/Solaris
  25
  26 namespace gdcm
  27 {
  28
  29 //-----------------------------------------------------------------------------
  30 // Constructor / Destructor
  31
  32 /**
  33  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  34  */
  35 BinEntry::BinEntry(DictEntry *e) : ValEntry(e)
  36 {
  37    BinArea = 0;
  38    SelfArea = true;
  39 }
  40
  41 /**
  42  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  43  * @param   e Pointer to existing Doc entry
  44  */
  45 BinEntry::BinEntry(DocEntry *e) : ValEntry(e->GetDictEntry())
  46 {
  47    Copy(e);
  48
  49    //FIXME
  50    //SQDepthLevel = e->GetDepthLevel();
  51
  52    BinArea = 0; // let's be carefull !
  53    SelfArea = true;
  54 }
  55
  56 /**
  57  * \brief   Canonical destructor.
  58  */
  59 BinEntry::~BinEntry()
  60 {
  61    if (BinArea && SelfArea)
  62    {
  63       delete[] BinArea;
  64       BinArea = 0; // let's be carefull !
  65    }
  66 }
  67
  68
  69 //-----------------------------------------------------------------------------
  70 // Print
  71 /*
  72  * \brief   canonical Printer
  73  */
  74
  75 void BinEntry::Print(std::ostream &os, std::string const & )
  76 {
  77    os << "B ";
  78    DocEntry::Print(os);
  79    std::ostringstream s;
  80    void* binArea = GetBinArea();
  81    if (binArea)
  82    {
  83       //s << " [" << GDCM_BINLOADED
  84       s << " [" << GetValue()
  85         << "; length = " << GetLength() << "]";
  86    }
  87    else
  88    {
  89       if ( GetLength() == 0 )
  90       {
  91          s << " []";
  92       }
  93       else
  94       {
  95          //s << " [gdcm::Binary data NOT loaded]";
  96          s << " [" <<GetValue() << "]";
  97       }
  98
  99    }
 100    os << s.str();
 101 }
 102
 103 /*
 104  * \brief   canonical Writer
 105  * @param fp already open file pointer
 106  * @param filetype type of the file to be written
 107 */
 108 void BinEntry::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype)
 109 {
 110 #define BUFFER_SIZE 4096
 111    DocEntry::WriteContent(fp, filetype);
 112    void* binArea = GetBinArea();
 113    int lgr = GetLength();
 114    if (binArea) // the binArea was *actually* loaded
 115    {
 116
 117    // TODO FIME
 118    // Probabely, the same operation will have to be done when we want
 119    // to write image with Big Endian Transfert Syntax,
 120    //   and we are working onj Little Endian Processor
 121
 122 #ifdef GDCM_WORDS_BIGENDIAN
 123       // Be carefull with *any* 16 bits words 'binEntries !'
 124       // if ( GetVR() == "OW") // to be used later
 125
 126       // TODO FIXME Right now, we only care of Pixels element
 127
 128       // 8 Bits Pixels *are* OB, 16 Bits Pixels *are* OW
 129       // -value forced while Reading process-
 130       if (GetGroup() == 0x7fe0 && GetVR() == "OW")
 131       {
 132          uint16_t *currPosition = (uint16_t *)binArea;
 133
 134          // TODO FIXME : Maybe we should allocate somewhere a static buffer,
 135          // in order not to have to alloc/delete for almost every BinEntry ...
 136          uint16_t *buffer = new uint16_t[BUFFER_SIZE];
 137
 138          // how many BUFFER_SIZE long pieces in binArea ?
 139          int nbPieces = lgr/BUFFER_SIZE/2; //(16 bits = 2 Bytes)
 140          uint16_t *binArea16 = (uint16_t*)binArea;
 141          for (int j=0;j<nbPieces;j++)
 142          {
 143             for (int i = 0; i < BUFFER_SIZE/2; i++)
 144             {
 145                buffer[i] =  (binArea16[i] >> 8) | (binArea16[i] << 8);
 146             }
 147             fp->write ( (char*)currPosition, BUFFER_SIZE );
 148             currPosition += BUFFER_SIZE/2;
 149          }
 150          int remainingSize = lgr%BUFFER_SIZE;
 151          if ( remainingSize != 0)
 152          {
 153             fp->write ( (char*)currPosition, remainingSize );
 154          }
 155          delete[] buffer;
 156       }
 157       else
 158       {
 159          // For any other VR, BinEntry is re-written as-is
 160          fp->write ( (char*)binArea, lgr );
 161       }
 162 #else
 163       fp->write ( (char*)binArea, lgr ); // Elem value
 164 #endif //GDCM_WORDS_BIGENDIAN
 165
 166    }
 167    else
 168    {
 169       // nothing was loaded, but we need to skip space on disc
 170       fp->seekp(lgr, std::ios::cur);
 171    }
 172 }
 173 //-----------------------------------------------------------------------------
 174 // Public
 175
 176
 177 /// \brief Sets the value (non string) of the current Dicom Header Entry
 178 void BinEntry::SetBinArea( uint8_t *area, bool self )
 179 {
 180    if (BinArea && SelfArea)
 181       delete[] BinArea;
 182
 183    BinArea = area;
 184    SelfArea=self;
 185 }
 186
 187 //-----------------------------------------------------------------------------
 188 // Protected
 189
 190 //-----------------------------------------------------------------------------
 191 // Private
 192
 193 //-----------------------------------------------------------------------------
 194 } // end namespace gdcm