src/gdcmBinEntry.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmBinEntry.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/01/25 15:21:20 $
   7   Version:   $Revision: 1.57 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmBinEntry.h"
  20 #include "gdcmContentEntry.h"
  21
  22 #include "gdcmDebug.h"
  23
  24 #include <fstream>
  25 #include <sstream>
  26 #include <iostream> // for std::ios_base, since <ios> does not exist on gcc/Solaris
  27
  28 namespace gdcm
  29 {
  30
  31 //-----------------------------------------------------------------------------
  32 // Constructor / Destructor
  33
  34 /**
  35  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  36  */
  37 BinEntry::BinEntry(DictEntry *e) : ContentEntry(e)
  38 {
  39    BinArea = 0;
  40    SelfArea = true;
  41 }
  42
  43 /**
  44  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  45  * @param   e Pointer to existing Doc entry
  46  */
  47 BinEntry::BinEntry(DocEntry *e) : ContentEntry(e->GetDictEntry())
  48 {
  49    Copy(e);
  50
  51    BinArea = 0; // let's be carefull !
  52    SelfArea = true;
  53 }
  54
  55 /**
  56  * \brief   Canonical destructor.
  57  */
  58 BinEntry::~BinEntry()
  59 {
  60    if (BinArea && SelfArea)
  61    {
  62       delete[] BinArea;
  63       BinArea = 0; // let's be carefull !
  64    }
  65 }
  66
  67
  68 //-----------------------------------------------------------------------------
  69 // Print
  70 /**
  71  * \brief   Prints a BinEntry (Dicom entry)
  72  * @param   os ostream we want to print in
  73  * @param indent Indentation string to be prepended during printing
  74  */
  75 void BinEntry::Print(std::ostream &os, std::string const & )
  76 {
  77    os << "B ";
  78    DocEntry::Print(os);
  79    std::ostringstream s;
  80    void* binArea = GetBinArea();
  81    if (binArea)
  82    {
  83       //s << " [" << GDCM_BINLOADED
  84       s << " [" << GetValue()
  85         << "; length = " << GetLength() << "]";
  86    }
  87    else
  88    {
  89       if ( GetLength() == 0 )
  90       {
  91          s << " []";
  92       }
  93       else
  94       {
  95          //s << " [gdcm::Binary data NOT loaded]";
  96          s << " [" <<GetValue() << "]";
  97       }
  98    }
  99    os << s.str();
 100 }
 101
 102 /*
 103  * \brief   canonical Writer
 104  * @param fp already open file pointer
 105  * @param filetype type of the file (ACR, ImplicitVR, ExplicitVR, ...)
 106 */
 107 void BinEntry::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype)
 108 {
 109 #define BUFFER_SIZE 4096
 110    DocEntry::WriteContent(fp, filetype);
 111    void* binArea = GetBinArea();
 112    int lgr = GetLength();
 113    if (binArea) // the binArea was *actually* loaded
 114    {
 115
 116    // TODO FIME
 117    // Probabely, the same operation will have to be done when we want
 118    // to write image with Big Endian Transfert Syntax,
 119    //   and we are working on Little Endian Processor
 120
 121 #ifdef GDCM_WORDS_BIGENDIAN
 122       // Be carefull with *any* 16 bits words 'binEntries !'
 123       // if ( GetVR() == "OW") // to be used later
 124
 125       // TODO FIXME Right now, we only care of Pixels element
 126
 127       // 8 Bits Pixels *are* OB, 16 Bits Pixels *are* OW
 128       // -value forced while Reading process-
 129       if (GetGroup() == 0x7fe0 && GetVR() == "OW")
 130       {
 131          uint16_t *currPosition = (uint16_t *)binArea;
 132
 133          // TODO FIXME : Maybe we should allocate somewhere a static buffer,
 134          // in order not to have to alloc/delete for almost every BinEntry ...
 135          uint16_t *buffer = new uint16_t[BUFFER_SIZE];
 136
 137          // how many BUFFER_SIZE long pieces in binArea ?
 138          int nbPieces = lgr/BUFFER_SIZE/2; //(16 bits = 2 Bytes)
 139          uint16_t *binArea16 = (uint16_t*)binArea;
 140          for (int j=0;j<nbPieces;j++)
 141          {
 142             for (int i = 0; i < BUFFER_SIZE/2; i++)
 143             {
 144                buffer[i] =  (binArea16[i] >> 8) | (binArea16[i] << 8);
 145             }
 146             fp->write ( (char*)currPosition, BUFFER_SIZE );
 147             currPosition += BUFFER_SIZE/2;
 148          }
 149          int remainingSize = lgr%BUFFER_SIZE;
 150          if ( remainingSize != 0)
 151          {
 152             fp->write ( (char*)currPosition, remainingSize );
 153          }
 154          delete[] buffer;
 155       }
 156       else
 157       {
 158          // For any other VR, BinEntry is re-written as-is
 159          fp->write ( (char*)binArea, lgr );
 160       }
 161 #else
 162       fp->write ( (char*)binArea, lgr ); // Elem value
 163 #endif //GDCM_WORDS_BIGENDIAN
 164
 165    }
 166    else
 167    {
 168       // nothing was loaded, but we need to skip space on disc
 169       fp->seekp(lgr, std::ios::cur);
 170    }
 171 }
 172 //-----------------------------------------------------------------------------
 173 // Public
 174
 175
 176 /// \brief Sets the value (non string) of the current Dicom Header Entry
 177 void BinEntry::SetBinArea( uint8_t *area, bool self )
 178 {
 179    if (BinArea && SelfArea)
 180       delete[] BinArea;
 181
 182    BinArea = area;
 183    SelfArea=self;
 184 }
 185
 186 //-----------------------------------------------------------------------------
 187 // Protected
 188
 189 //-----------------------------------------------------------------------------
 190 // Private
 191
 192 //-----------------------------------------------------------------------------
 193 } // end namespace gdcm