src/gdcmBinEntry.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmBinEntry.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/02/10 14:23:18 $
   7   Version:   $Revision: 1.68 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmBinEntry.h"
  20 #include "gdcmContentEntry.h"
  21
  22 #include "gdcmDebug.h"
  23
  24 #include <fstream>
  25 #include <sstream>
  26 #include <iostream> // for std::ios_base, since <ios> does not exist on gcc/Solaris
  27
  28 namespace gdcm
  29 {
  30 //-----------------------------------------------------------------------------
  31 // Constructor / Destructor
  32 /**
  33  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  34  */
  35 BinEntry::BinEntry(DictEntry *e)
  36          :ContentEntry(e)
  37 {
  38    BinArea = 0;
  39    SelfArea = true;
  40 }
  41
  42 /**
  43  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  44  * @param   e Pointer to existing Doc entry
  45  */
  46 BinEntry::BinEntry(DocEntry *e)
  47         : ContentEntry(e->GetDictEntry())
  48 {
  49    Copy(e);
  50
  51    BinArea = 0;
  52    SelfArea = true;
  53 }
  54
  55 /**
  56  * \brief   Canonical destructor.
  57  */
  58 BinEntry::~BinEntry()
  59 {
  60    if (BinArea && SelfArea)
  61    {
  62       delete[] BinArea;
  63       BinArea = 0; // let's be carefull !
  64    }
  65 }
  66
  67 //-----------------------------------------------------------------------------
  68 // Public
  69 /**
  70  * \brief   canonical Writer
  71  * @param fp already open file pointer
  72  * @param filetype type of the file (ACR, ImplicitVR, ExplicitVR, ...)
  73 */
  74 void BinEntry::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype)
  75 {
  76    DocEntry::WriteContent(fp, filetype);
  77    void* binArea = GetBinArea();
  78    int lgr = GetLength();
  79    if (binArea) // the binArea was *actually* loaded
  80    {
  81
  82    // TODO FIME
  83    // Probabely, the same operation will have to be done when we want
  84    // to write image with Big Endian Transfert Syntax,
  85    //   and we are working on Little Endian Processor
  86
  87 #ifdef GDCM_WORDS_BIGENDIAN
  88       const int BUFFER_SIZE = 4096;
  89       // TODO FIXME Right now, we only care of Pixels element
  90
  91       // 8 Bits Pixels *are* OB, 16 Bits Pixels *are* OW
  92       // -value forced while Reading process-
  93       if (GetGroup() == 0x7fe0 && GetVR() == "OW")
  94       {
  95          uint16_t *buffer = new uint16_t[BUFFER_SIZE/2];
  96
  97          // how many BUFFER_SIZE long pieces in binArea ?
  98          int nbPieces = lgr/BUFFER_SIZE; //(16 bits = 2 Bytes)
  99          int remainingSize = lgr%BUFFER_SIZE;
 100
 101          uint16_t *binArea16 = (uint16_t*)binArea;
 102          for (int j=0;j<nbPieces;j++)
 103          {
 104             for (int i = 0; i < BUFFER_SIZE/2; i++)
 105             {
 106                //buffer[i] =  (binArea16[i] >> 8) | (binArea16[i] << 8);
 107                uint16_t val = binArea16[i];
 108                buffer[i] = ((( val << 8 ) & 0xff00 ) | (( val >> 8 ) & 0x00ff ) );
 109             }
 110             fp->write ( (char*)buffer, BUFFER_SIZE );
 111             binArea16 += BUFFER_SIZE/2;
 112          }
 113          if ( remainingSize > 0)
 114          {
 115             for (int i = 0; i < remainingSize/2; i++)
 116             {
 117                //buffer[i] =  (binArea16[i] >> 8) | (binArea16[i] << 8);
 118                uint16_t val = binArea16[i];
 119                buffer[i] = ((( val << 8 ) & 0xff00 ) | (( val >> 8 ) & 0x00ff ) );
 120             }
 121             fp->write ( (char*)buffer, remainingSize );
 122          }
 123          delete[] buffer;
 124       }
 125       else
 126       {
 127          // For any other VR, BinEntry is re-written as-is
 128          fp->write ( (char*)binArea, lgr );
 129       }
 130 #else
 131       fp->write ( (char*)binArea, lgr ); // Elem value
 132 #endif //GDCM_WORDS_BIGENDIAN
 133
 134    }
 135    else
 136    {
 137       // nothing was loaded, but we need to skip space on disc
 138       fp->seekp(lgr, std::ios::cur);
 139    }
 140 }
 141
 142 /**
 143  * \brief Sets the value (non string) of the current Dicom Header Entry
 144  */
 145 void BinEntry::SetBinArea( uint8_t *area, bool self )
 146 {
 147    if (BinArea && SelfArea)
 148       delete[] BinArea;
 149
 150    BinArea = area;
 151    SelfArea=self;
 152 }
 153
 154 //-----------------------------------------------------------------------------
 155 // Protected
 156
 157 //-----------------------------------------------------------------------------
 158 // Private
 159
 160 //-----------------------------------------------------------------------------
 161 // Print
 162 /**
 163  * \brief   Prints a BinEntry (Dicom entry)
 164  * @param   os ostream we want to print in
 165  * @param indent Indentation string to be prepended during printing
 166  */
 167 void BinEntry::Print(std::ostream &os, std::string const & )
 168 {
 169    os << "B ";
 170    DocEntry::Print(os);
 171    std::ostringstream s;
 172    void* binArea = GetBinArea();
 173    if (binArea)
 174    {
 175       s << " [" << GetValue()
 176         << "; length = " << GetLength() << "]";
 177    }
 178    else
 179    {
 180       if ( GetLength() == 0 )
 181       {
 182          s << " []";
 183       }
 184       else
 185       {
 186          s << " [" <<GetValue() << "]";
 187       }
 188    }
 189    os << s.str();
 190 }
 191
 192 //-----------------------------------------------------------------------------
 193 } // end namespace gdcm