src/gdcmBinEntry.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmBinEntry.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/09/21 09:44:59 $
   7   Version:   $Revision: 1.78 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmBinEntry.h"
  20 #include "gdcmContentEntry.h"
  21 #include "gdcmUtil.h"
  22
  23 #include <fstream>
  24 #include <sstream>
  25 #include <iostream> // for std::ios_base, since <ios> does not exist on gcc/Solaris
  26
  27 namespace gdcm
  28 {
  29 //-----------------------------------------------------------------------------
  30 // Constructor / Destructor
  31 /**
  32  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  33  */
  34 BinEntry::BinEntry(DictEntry *e)
  35          :ContentEntry(e)
  36 {
  37    BinArea = 0;
  38    SelfArea = true;
  39 }
  40
  41 /**
  42  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  43  * @param   e Pointer to existing Doc entry
  44  */
  45 BinEntry::BinEntry(DocEntry *e)
  46         : ContentEntry(e->GetDictEntry())
  47 {
  48    Copy(e);
  49
  50    BinArea = 0;
  51    SelfArea = true;
  52 }
  53
  54 /**
  55  * \brief   Canonical destructor.
  56  */
  57 BinEntry::~BinEntry()
  58 {
  59    if (BinArea && SelfArea)
  60    {
  61       delete[] BinArea;
  62       BinArea = 0; // let's be carefull !
  63    }
  64 }
  65
  66 //-----------------------------------------------------------------------------
  67 // Public
  68 /**
  69  * \brief   canonical Writer
  70  * @param fp already open file pointer
  71  * @param filetype type of the file (ACR, ImplicitVR, ExplicitVR, ...)
  72 */
  73 void BinEntry::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype)
  74 {
  75    DocEntry::WriteContent(fp, filetype);
  76    uint8_t *binArea8 = BinArea; //safe notation
  77    size_t lgr = GetLength();
  78    if (BinArea) // the binArea was *actually* loaded
  79    {
  80
  81    //  The same operation should be done if we wanted
  82    //  to write image with Big Endian Transfer Syntax,
  83    //  while working on Little Endian Processor
  84    // --> forget Big Endian Transfer Syntax writting!
  85    //     Next DICOM version will give it up ...
  86
  87    // -->
  88    // --> FIXME
  89    // -->
  90    // The stuff looks nice, but it's probably bugged,
  91    // since troubles occur on big endian processors (SunSparc, Motorola)
  92    // while reading the pixels of a
  93    // gdcm-written Little-Endian 16 bits per pixel image
  94
  95 #if defined(GDCM_WORDS_BIGENDIAN) || defined(GDCM_FORCE_BIGENDIAN_EMULATION)
  96
  97       /// \todo FIXME : Right now, we only care of Pixels element
  98       ///       we should deal with *all* the BinEntries
  99       ///       Well, not really since we are not interpreting values read...
 100
 101       // 8 Bits Pixels *are* OB, 16 Bits Pixels *are* OW
 102       // -value forced while Reading process-
 103       if (GetGroup() == 0x7fe0 && GetVR() == "OW")
 104       {
 105          uint16_t *binArea16 = (uint16_t*)binArea8;
 106          binary_write (*fp, binArea16, lgr );
 107       }
 108       else
 109       {
 110          // For any other VR, BinEntry is re-written as-is
 111          binary_write (*fp, binArea8, lgr );
 112       }
 113 #else
 114       binary_write ( *fp, binArea8, lgr ); // Elem value
 115 #endif //GDCM_WORDS_BIGENDIAN
 116
 117    }
 118    else
 119    {
 120       // nothing was loaded, but we need to skip space on disc
 121       fp->seekp(lgr, std::ios::cur);
 122    }
 123 }
 124
 125 /**
 126  * \brief Sets the value (non string) of the current Dicom Header Entry
 127  */
 128 void BinEntry::SetBinArea( uint8_t *area, bool self )
 129 {
 130    if (BinArea && SelfArea)
 131       delete[] BinArea;
 132
 133    BinArea = area;
 134    SelfArea=self;
 135 }
 136
 137 //-----------------------------------------------------------------------------
 138 // Protected
 139
 140 //-----------------------------------------------------------------------------
 141 // Private
 142
 143 //-----------------------------------------------------------------------------
 144 // Print
 145 /**
 146  * \brief   Prints a BinEntry (Dicom entry)
 147  * @param   os ostream we want to print in
 148  * @param indent Indentation string to be prepended during printing
 149  */
 150 void BinEntry::Print(std::ostream &os, std::string const & )
 151 {
 152    os << "B ";
 153    DocEntry::Print(os);
 154    std::ostringstream s;
 155    void* binArea = GetBinArea();
 156    if (binArea)
 157    {
 158       if ( GetVR() == "FL" )
 159       {
 160          int l = GetReadLength()/4 - 1;
 161          float *beg = (float *)GetBinArea();
 162          s << " [" << *beg;
 163          if ( l!= 0)
 164             for (int i=0;i<l;i++)
 165             {
 166                beg++;
 167                s << "\\" << *beg;
 168             }
 169             s << "]";
 170       }
 171       else if ( GetVR() == "FD" )
 172       {
 173          int l = GetReadLength()/8 - 1;
 174          double *beg = (double *)GetBinArea();
 175          s << " [" << *beg;
 176          if ( l!= 0)
 177             for (int i=0;i<l;i++)
 178             {
 179                beg++;
 180                s << "\\" << *beg;
 181             }
 182             s << "]";
 183       }
 184       else
 185       {
 186          if ( Util::IsCleanArea( GetBinArea(),GetLength()  ) )
 187          {
 188             std::string cleanString =
 189                    Util::CreateCleanString( GetBinArea(),GetLength()  );
 190             s << " [" << cleanString << "]";
 191          }
 192          else
 193          {
 194             //s << " [" << GetValue()
 195             s << " [" << GDCM_BINLOADED << ";"
 196               << "length = " << GetLength() << "]";
 197          }
 198       }
 199    }
 200    else
 201    {
 202       if ( GetLength() == 0 )
 203       {
 204          s << " []";
 205       }
 206       else
 207       {
 208          s << " [" <<GetValue() << "]";
 209       }
 210    }
 211    os << s.str();
 212 }
 213
 214 //-----------------------------------------------------------------------------
 215 } // end namespace gdcm