src/gdcmBinEntry.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmBinEntry.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/02/02 10:02:16 $
   7   Version:   $Revision: 1.61 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmBinEntry.h"
  20 #include "gdcmContentEntry.h"
  21
  22 #include "gdcmDebug.h"
  23
  24 #include <fstream>
  25 #include <sstream>
  26 #include <iostream> // for std::ios_base, since <ios> does not exist on gcc/Solaris
  27
  28 namespace gdcm
  29 {
  30 //-----------------------------------------------------------------------------
  31 // Constructor / Destructor
  32 /**
  33  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  34  */
  35 BinEntry::BinEntry(DictEntry *e)
  36          :ContentEntry(e)
  37 {
  38    BinArea = 0;
  39    SelfArea = true;
  40 }
  41
  42 /**
  43  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  44  * @param   e Pointer to existing Doc entry
  45  */
  46 BinEntry::BinEntry(DocEntry *e)
  47         : ContentEntry(e->GetDictEntry())
  48 {
  49    Copy(e);
  50
  51    BinArea = 0; // let's be carefull !
  52    SelfArea = true;
  53 }
  54
  55 /**
  56  * \brief   Canonical destructor.
  57  */
  58 BinEntry::~BinEntry()
  59 {
  60    if (BinArea && SelfArea)
  61    {
  62       delete[] BinArea;
  63       BinArea = 0; // let's be carefull !
  64    }
  65 }
  66
  67 //-----------------------------------------------------------------------------
  68 // Public
  69 /**
  70  * \brief   canonical Writer
  71  * @param fp already open file pointer
  72  * @param filetype type of the file (ACR, ImplicitVR, ExplicitVR, ...)
  73 */
  74 void BinEntry::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype)
  75 {
  76 #define BUFFER_SIZE 4096
  77    DocEntry::WriteContent(fp, filetype);
  78    void* binArea = GetBinArea();
  79    int lgr = GetLength();
  80    if (binArea) // the binArea was *actually* loaded
  81    {
  82
  83    // TODO FIME
  84    // Probabely, the same operation will have to be done when we want
  85    // to write image with Big Endian Transfert Syntax,
  86    //   and we are working on Little Endian Processor
  87
  88 #ifdef GDCM_WORDS_BIGENDIAN
  89       // Be carefull with *any* 16 bits words 'binEntries !'
  90       // if ( GetVR() == "OW") // to be used later
  91
  92       // TODO FIXME Right now, we only care of Pixels element
  93
  94       // 8 Bits Pixels *are* OB, 16 Bits Pixels *are* OW
  95       // -value forced while Reading process-
  96       if (GetGroup() == 0x7fe0 && GetVR() == "OW")
  97       {
  98          uint16_t *currPosition = (uint16_t *)binArea;
  99
 100          // TODO FIXME : Maybe we should allocate somewhere a static buffer,
 101          // in order not to have to alloc/delete for almost every BinEntry ...
 102          uint16_t *buffer = new uint16_t[BUFFER_SIZE];
 103
 104          // how many BUFFER_SIZE long pieces in binArea ?
 105          int nbPieces = lgr/BUFFER_SIZE/2; //(16 bits = 2 Bytes)
 106          uint16_t *binArea16 = (uint16_t*)binArea;
 107          for (int j=0;j<nbPieces;j++)
 108          {
 109             for (int i = 0; i < BUFFER_SIZE/2; i++)
 110             {
 111                buffer[i] =  (binArea16[i] >> 8) | (binArea16[i] << 8);
 112             }
 113             fp->write ( (char*)currPosition, BUFFER_SIZE );
 114             currPosition += BUFFER_SIZE/2;
 115          }
 116          int remainingSize = lgr%BUFFER_SIZE;
 117          if ( remainingSize != 0)
 118          {
 119             fp->write ( (char*)currPosition, remainingSize );
 120          }
 121          delete[] buffer;
 122       }
 123       else
 124       {
 125          // For any other VR, BinEntry is re-written as-is
 126          fp->write ( (char*)binArea, lgr );
 127       }
 128 #else
 129       fp->write ( (char*)binArea, lgr ); // Elem value
 130 #endif //GDCM_WORDS_BIGENDIAN
 131
 132    }
 133    else
 134    {
 135       // nothing was loaded, but we need to skip space on disc
 136       fp->seekp(lgr, std::ios::cur);
 137    }
 138 }
 139
 140 /**
 141  * \brief Sets the value (non string) of the current Dicom Header Entry
 142  */
 143 void BinEntry::SetBinArea( uint8_t *area, bool self )
 144 {
 145    if (BinArea && SelfArea)
 146       delete[] BinArea;
 147
 148    BinArea = area;
 149    SelfArea=self;
 150 }
 151
 152 //-----------------------------------------------------------------------------
 153 // Protected
 154
 155 //-----------------------------------------------------------------------------
 156 // Private
 157
 158 //-----------------------------------------------------------------------------
 159 // Print
 160 /**
 161  * \brief   Prints a BinEntry (Dicom entry)
 162  * @param   os ostream we want to print in
 163  * @param indent Indentation string to be prepended during printing
 164  */
 165 void BinEntry::Print(std::ostream &os, std::string const & )
 166 {
 167    os << "B ";
 168    DocEntry::Print(os);
 169    std::ostringstream s;
 170    void* binArea = GetBinArea();
 171    if (binArea)
 172    {
 173       s << " [" << GetValue()
 174         << "; length = " << GetLength() << "]";
 175    }
 176    else
 177    {
 178       if ( GetLength() == 0 )
 179       {
 180          s << " []";
 181       }
 182       else
 183       {
 184          s << " [" <<GetValue() << "]";
 185       }
 186    }
 187    os << s.str();
 188 }
 189
 190 //-----------------------------------------------------------------------------
 191 } // end namespace gdcm