src/gdcmBinEntry.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmBinEntry.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/08/25 14:59:49 $
   7   Version:   $Revision: 1.74 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmBinEntry.h"
  20 #include "gdcmContentEntry.h"
  21 #include "gdcmUtil.h"
  22
  23 #include <fstream>
  24 #include <sstream>
  25 #include <iostream> // for std::ios_base, since <ios> does not exist on gcc/Solaris
  26
  27 namespace gdcm
  28 {
  29 //-----------------------------------------------------------------------------
  30 // Constructor / Destructor
  31 /**
  32  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  33  */
  34 BinEntry::BinEntry(DictEntry *e)
  35          :ContentEntry(e)
  36 {
  37    BinArea = 0;
  38    SelfArea = true;
  39 }
  40
  41 /**
  42  * \brief   Constructor from a given BinEntry
  43  * @param   e Pointer to existing Doc entry
  44  */
  45 BinEntry::BinEntry(DocEntry *e)
  46         : ContentEntry(e->GetDictEntry())
  47 {
  48    Copy(e);
  49
  50    BinArea = 0;
  51    SelfArea = true;
  52 }
  53
  54 /**
  55  * \brief   Canonical destructor.
  56  */
  57 BinEntry::~BinEntry()
  58 {
  59    if (BinArea && SelfArea)
  60    {
  61       delete[] BinArea;
  62       BinArea = 0; // let's be carefull !
  63    }
  64 }
  65
  66 //-----------------------------------------------------------------------------
  67 // Public
  68 /**
  69  * \brief   canonical Writer
  70  * @param fp already open file pointer
  71  * @param filetype type of the file (ACR, ImplicitVR, ExplicitVR, ...)
  72 */
  73 void BinEntry::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype)
  74 {
  75    DocEntry::WriteContent(fp, filetype);
  76    uint8_t* binArea8 = BinArea; //safe notation
  77    size_t lgr = GetLength();
  78    if (BinArea) // the binArea was *actually* loaded
  79    {
  80    /// \todo  Probably, the same operation should be done if we wanted
  81    ///        to write image with Big Endian Transfer Syntax,
  82    ///        while working on Little Endian Processor
  83
  84 #if defined(GDCM_WORDS_BIGENDIAN) || defined(GDCM_FORCE_BIGENDIAN_EMULATION)
  85       /// \todo FIXME Right now, we only care of Pixels element
  86       ///       we should deal with *all* the BinEntries
  87       ///       well not really since we are not interpreting values read...
  88
  89       // 8 Bits Pixels *are* OB, 16 Bits Pixels *are* OW
  90       // -value forced while Reading process-
  91       if (GetGroup() == 0x7fe0 && GetVR() == "OW")
  92       {
  93          uint16_t *binArea16 = (uint16_t*)binArea8;
  94          binary_write (*fp, binArea16, lgr );
  95       }
  96       else
  97       {
  98          // For any other VR, BinEntry is re-written as-is
  99          binary_write (*fp, binArea8, lgr );
 100       }
 101 #else
 102       binary_write ( *fp, binArea8, lgr ); // Elem value
 103 #endif //GDCM_WORDS_BIGENDIAN
 104
 105    }
 106    else
 107    {
 108       // nothing was loaded, but we need to skip space on disc
 109       fp->seekp(lgr, std::ios::cur);
 110    }
 111 }
 112
 113 /**
 114  * \brief Sets the value (non string) of the current Dicom Header Entry
 115  */
 116 void BinEntry::SetBinArea( uint8_t *area, bool self )
 117 {
 118    if (BinArea && SelfArea)
 119       delete[] BinArea;
 120
 121    BinArea = area;
 122    SelfArea=self;
 123 }
 124
 125 //-----------------------------------------------------------------------------
 126 // Protected
 127
 128 //-----------------------------------------------------------------------------
 129 // Private
 130
 131 //-----------------------------------------------------------------------------
 132 // Print
 133 /**
 134  * \brief   Prints a BinEntry (Dicom entry)
 135  * @param   os ostream we want to print in
 136  * @param indent Indentation string to be prepended during printing
 137  */
 138 void BinEntry::Print(std::ostream &os, std::string const & )
 139 {
 140    os << "B ";
 141    DocEntry::Print(os);
 142    std::ostringstream s;
 143    void* binArea = GetBinArea();
 144    if (binArea)
 145    {
 146       if ( GetVR() == "FL" )
 147       {
 148          int l = GetReadLength()/4 - 1;
 149          float *beg = (float *)GetBinArea();
 150          s << " [" << *beg;
 151          if ( l!= 0)
 152             for (int i=0;i<l;i++)
 153             {
 154                beg++;
 155                s << "\\" << *beg;
 156             }
 157             s << "]";
 158       }
 159       else if ( GetVR() == "FD" )
 160       {
 161          int l = GetReadLength()/8 - 1;
 162          double *beg = (double *)GetBinArea();
 163          s << " [" << *beg;
 164          if ( l!= 0)
 165             for (int i=0;i<l;i++)
 166             {
 167                beg++;
 168                s << "\\" << *beg;
 169             }
 170             s << "]";
 171       }
 172       else
 173       {
 174          if ( Util::IsCleanArea( GetBinArea(),GetLength()  ) )
 175          {
 176             std::string cleanString =
 177                    Util::CreateCleanString( GetBinArea(),GetLength()  );
 178             s << " [" << cleanString << "]";
 179          }
 180          else
 181          {
 182             s << " [" << GetValue()
 183               << "; length = " << GetLength() << "]";
 184          }
 185
 186       }
 187    }
 188    else
 189    {
 190       if ( GetLength() == 0 )
 191       {
 192          s << " []";
 193       }
 194       else
 195       {
 196          s << " [" <<GetValue() << "]";
 197       }
 198    }
 199    os << s.str();
 200 }
 201
 202 //-----------------------------------------------------------------------------
 203 } // end namespace gdcm